| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-14页 |
| ·研究背景与意义 | 第10-12页 |
| ·DNA甲基化修饰 | 第10-12页 |
| ·研究内容与目标 | 第12页 |
| ·论文结构 | 第12-14页 |
| 第二章 数据库和研究方法 | 第14-19页 |
| ·数据库 | 第14-15页 |
| ·数据库的概述 | 第14-15页 |
| ·Bisulfite-Seq数据概述 | 第15页 |
| ·研究方法 | 第15-19页 |
| ·数据的选取 | 第15-18页 |
| ·讨论与小结 | 第18-19页 |
| 第三章 功能区域的DNA甲基化分布、差异甲基化基因的寻找以及分析 | 第19-30页 |
| ·人类全基因组六个功能区域DNA甲基化修饰模式 | 第19-23页 |
| ·运用两种方法找出差异基因 | 第23-29页 |
| ·离散增量法 | 第23页 |
| ·距离参数法 | 第23-27页 |
| ·DNA甲基化差异基因的表达分析 | 第27-29页 |
| ·讨论与小结 | 第29-30页 |
| 第四章 CG位点甲基化水平与邻近序列碱基组成的相关性分析 | 第30-38页 |
| ·细胞系中碱基以及二联体的分布 | 第30-31页 |
| ·细胞系的MEMEmotif分析 | 第31-34页 |
| ·软件说明 | 第31-32页 |
| ·高低甲基化位点附近区域的motif分析 | 第32-34页 |
| ·序列的能量、相对稳定性和柔性 | 第34-36页 |
| ·讨论与小结 | 第36-38页 |
| 第五章 总结与展望 | 第38-40页 |
| ·全文总结 | 第38-39页 |
| ·工作展望 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-44页 |
| 致谢 | 第44-45页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第45页 |