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基于时间点的转录组综合分析鉴定斑马鱼下颌再生的调节通路

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
第一章 引言第11-17页
   ·组织再生的定义与机制第11-12页
   ·芽基再生(blastemal regeneration)第12-15页
     ·芽基再生的定义第12页
     ·芽基再生的基本过程第12-13页
     ·芽基细胞的来源与形成机制第13-14页
     ·芽基再生过程中的信号调控第14-15页
       ·愈伤表皮形成的调控第14页
       ·芽基形成与重塑的调控第14-15页
   ·斑马鱼与其下颌再生第15页
   ·本研究的目的与意义第15-17页
第二章 斑马鱼下颌再生过程中愈伤表皮与芽基的形态学研究第17-24页
   ·实验材料第17-18页
     ·实验用鱼第17页
     ·实验试剂和仪器第17-18页
   ·实验方法第18-20页
     ·石蜡切片的制备第18-19页
     ·H.E染色第19-20页
   ·结果第20-23页
     ·斑马鱼下颌愈伤表皮的形成第20-21页
     ·斑马鱼下颌芽基形成的细胞形态转变第21-23页
   ·讨论第23-24页
第三章 下颌芽基再生关键时间点的转录组测序分析第24-34页
   ·实验材料第24页
   ·方法第24-25页
     ·转录组深度测序分析第24页
     ·差异基因的功能注释第24-25页
     ·差异基因的功能分类与聚类富集第25页
     ·差异表达基因的分等级聚类第25页
   ·结果第25-33页
     ·差异表达基因与KEGG功能注释第25-30页
     ·差异表达基因的GO富集性分析第30页
     ·GO高等级富集基因的功能聚类第30-31页
     ·再生过程相关的信号通路预测第31-33页
   ·讨论第33-34页
第四章 四条信号通路在蛋白和细胞水平的验证第34-44页
   ·实验材料第34-35页
     ·实验用鱼第34页
     ·细胞系第34页
     ·实验试剂和仪器第34-35页
   ·实验方法第35-36页
     ·冰冻切片的制备第35页
     ·切片免疫组化/荧光第35-36页
     ·细胞免疫荧光第36页
   ·结果第36-42页
     ·抗体的特异性检测第36-37页
     ·斑马鱼下颌再生过程一些基因的表达模式第37-40页
     ·细胞转化与三种细胞系的组织划分第40-42页
   ·讨论第42-44页
     ·Foxi1 和Pax3a信号通路共同调节愈伤表皮的重建和芽基的形成 . 32 4.4.2 pou5f1-cdx4-kdrl信号通路调控芽基血管新生和血管形成第42页
     ·pou5f1-cdx4-kdrl 信号通路调控芽基血管新生和血管形成第42-43页
     ·PCP信号通路调控芽基再生的位置排布第43-44页
第五章信号通路之间的联系第44-54页
   ·实验材料第44-45页
     ·实验用鱼第44页
     ·实验试剂与仪器第44-45页
   ·实验方法第45-51页
     ·活体电转Mo敲降Foxi1第45页
     ·冰冻切片及免疫荧光第45页
     ·胚胎注射Mo第45页
     ·胚胎原位杂交第45-51页
   ·结果第51-53页
     ·Foxi1 对于表皮重建与芽基形成是必需的第51-52页
     ·Foxi1,Hoxa2b,Sox9a相互调节来维持正常的表达模式第52-53页
   ·讨论第53-54页
小结第54-56页
参考文献第56-59页
附录第59-60页
致谢第60页

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