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单纯疱疹病毒中简单重复序列及其GC含量的研究

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
第1章 绪论第9-26页
   ·简单重复序列的简介第10-18页
     ·简单重复序列的筛选第10-11页
       ·文库筛选法第10页
       ·序列标记微卫星分布技术第10页
       ·选择性扩增微卫星序列分析方法第10-11页
       ·从表达序列标签中筛选 SSRs第11页
     ·简单重复序列的功能第11-13页
       ·构成基因组的重要组成部分第11-12页
       ·影响基因的表达第12-13页
     ·简单重复序列在研究中的应用第13-15页
       ·建立 DNA 指纹、品种鉴定及种子纯度检测第13-14页
       ·种质资源保存、评价和利用第14页
       ·基因定位和构建基因组图谱第14页
       ·系谱分析及分子标记辅助育种第14页
       ·亲子鉴定第14-15页
     ·简单重复序列的突变机制第15-17页
       ·滑动复制第15-16页
       ·DNA 重组第16页
       ·滑动复制与 DNA 重组的相互作用第16-17页
     ·简单重复序列与人类疾病第17-18页
   ·疱疹病毒简介第18-19页
     ·单纯疱疹病毒 1 型第18-19页
     ·单纯疱疹病毒 2 型第19页
   ·生物信息学数据库第19-21页
     ·GenBank第20-21页
     ·EMBL(欧洲分子生物学实验室)第21页
     ·DDBJ(日本国家遗传学研究所,NIG)第21页
   ·SSR 常用的分析软件第21-24页
     ·MEGA第21-22页
     ·FASTA第22页
     ·IMEx第22页
     ·SAS第22-23页
     ·DNA Star第23-24页
     ·SPSS第24页
   ·研究意义和前景第24-26页
第2章 材料与方法第26-30页
   ·实验材料第26页
   ·方法与步骤第26-30页
     ·序列的处理第26-28页
     ·相关软件的选取第28-29页
     ·分析方法的选取第29页
     ·对分析结果进行处理第29-30页
第3章 结果分析与讨论第30-39页
   ·HSV-1 和 HSV-2 基因组中 SSRS的整体分布情况第30-32页
   ·在 HSV-1 和 HSV-2 中不同长度 SSRS的分布特点第32页
   ·在 HSV-1 和 HSV-2 中三核苷酸重复的特异性分布第32-34页
   ·HSV-1 和 HSV-2 SSRS中 GC 含量的分析第34-36页
   ·HSV-1 和 HSV-2 中 SSRS的保守性和突变性第36-39页
结论第39-41页
参考文献第41-53页
附录 A 攻读学位期间所发表的学术论文目录第53-54页
致谢第54页

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