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生长因子诱导的鼻咽癌细胞上皮—间质转换过程中的mRNA-microRNA调控网络--AmRNA:MicroRNA Regulatory Network in Epithelial-mesenchrymal Transition Induced by Growth Factor in Nasopharyngeal Carcinoma

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-15页
英文缩略词表第15-16页
前言第16-20页
技术路线第20-21页
第二章 材料和方法第21-35页
   ·材料第21-23页
     ·实验用细胞第21页
     ·常用溶液的配制第21页
     ·试剂第21-22页
     ·主要实验仪器第22-23页
   ·方法第23-35页
     ·生长因子诱导细胞后的形态学观察第23页
     ·细胞总RNA抽提第23-24页
     ·消化RNA中痕量DNA第24页
     ·RNA质量检测第24页
     ·RNA逆转录实验第24-25页
     ·实时荧光定量PCR(Real Time-PCR)第25-28页
     ·microRNA逆转录实验第28页
     ·microRNA实时荧光定量PCR第28-29页
     ·siRNA细胞转染实验第29页
     ·细胞划痕实验第29页
     ·细胞Transwell体外侵袭实验第29-30页
     ·MTT比色法测定细胞生长、存活第30页
     ·mRNA芯片和miRNA芯片分析第30页
     ·差异表达的mRNA和microRNA分子的筛选第30-31页
     ·mRNA表达谱的生物信息学分析第31-33页
     ·miRNA芯片的生物信息学分析第33-34页
     ·miR-505和miR-1207-5p靶基因的预测第34-35页
第三章 结果第35-72页
   ·EGF或TGF-β1诱导鼻咽癌细胞HK-1发生上皮-间质转换第35-37页
   ·EGF或TGF-β1对鼻咽癌细胞的mRNA和microRNA表达谱的影响第37-39页
   ·利用荧光定量PCR验证高通量芯片分析的结果第39-40页
   ·EGF和TGF-β1共同上调的基因多与细胞黏附、运动相关第40-42页
   ·EGF和TGF-β1共同下调的基因多与细胞周期、分裂、染色体、DNA复制等相关第42-44页
   ·EGF和TGF-β1诱导的EMT过程中信号通路和GO的变化(MAS3.0分析结果)第44-48页
   ·EGF和TGF-β1诱导的EMT过程中基因集变化情况(GSEA分析结果)第48-51页
   ·EGF和TGF-β1诱导的EMT过程中,ETS家族成员和EGR1靶基因的变化情况第51-55页
   ·EGF诱导的EMT过程中,EGFR通路的变化情况第55-56页
   ·EGF和TGF-β1诱导的EMT过程中,EMT通路的变化情况第56-58页
   ·EGF或TGF-β1诱导的EMT对于鼻咽癌发病机制的贡献第58-60页
   ·EGF和TGF-β1对microRNA表达谱的影响(基于转录因子的分析)第60-61页
   ·EGF和TGF-β1所诱导的EMT过程中涉及的microRNA-靶基因-信号通路网络第61-65页
   ·EGF和TGF-β1共同诱导3个microRNA分子的表达第65页
   ·qRT-PCR验证特异性mi RNA mimics和inhbitor的效果第65-66页
   ·miR-505和miR-1207-5p可抑制鼻咽癌细胞的迁移和侵袭能力第66-68页
   ·miR-1207-5p和miR-505对鼻咽癌细胞增殖能力的影响第68页
   ·miR-505和miR-1207-5p靶基因的预测分析第68-70页
   ·qRT-PCR筛选、验证miR-505和miR-1207-5p的潜在靶基因第70-72页
第四章 讨论第72-81页
   ·肿瘤转移与EMT第72页
   ·EGF、TGF-β1对mRNA表达谱的影响第72-75页
   ·EGF、TGF-β1对基因集的影响第75-76页
   ·EGF、TGF-β1诱导的EMT过程中EGFR通路、TGF-β通路、EMT通路的变化情况第76-77页
   ·EGF和TGF-β1诱导的EMT对于鼻咽癌发病机制的贡献-基于基因表达谱的分析结论第77-78页
   ·EGF和TGF-β1诱导的EMT过程中microRNA表达谱的改变第78-79页
   ·miR-505和miR-1207-5p在EMT过程中其负反馈作用(鲁棒性)第79-81页
第五章 结论第81-82页
参考文献第82-86页
综述第86-99页
 参考文献第95-99页
致谢第99页

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