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耐辐射式球菌双链DNA修复系统RecF途径的关键解旋酶DrRecQ的结构与功能研究

摘要第1-10页
Abstract第10-13页
第一章 前沿第13-27页
 一、研究背景第13-24页
  1. 耐辐射式球菌Deinococcus radiodurans简介第13-14页
   ·耐辐射式球菌D.radiodurans的发现第13页
   ·耐辐射式球菌基因组结构和DNA修复途径的研究第13-14页
  2. DNA的损伤修复途径简介第14-21页
   ·切除修复(Excision Repair)第14-15页
   ·直接修复(Direct Repair)第15-16页
   ·SOS修复(SOS Repair)第16页
   ·重组修复(Recombinational Repair)第16-21页
     ·RecBCD修复途径第17-20页
     ·RecF修复途径第20-21页
  3. RecQ蛋白的研究概况第21-24页
 二、研究内容、目的与意义第24-27页
第二章 研究材料与方法第27-39页
 1. 菌株和质粒第27页
 2. 实验试剂和工具酶第27-28页
 3. 主要仪器第28-29页
 4. 实验流程和方法第29-39页
   ·基因的克隆第29-31页
   ·蛋白质表达与纯化第31-32页
     ·蛋白质表达第31页
     ·蛋白质的纯化第31-32页
       ·用于结晶的蛋白的纯化第31页
       ·生化检测所用蛋白质的纯化第31-32页
       ·DrRecQ1-824蛋白质与Holliday Junction结合后聚合态的检测第32页
   ·晶体生长和数据收集第32-33页
   ·小角散射的样品准备和数据收集第33-35页
   ·生化功能分析第35-39页
     ·DrRecQ水解ATP活性实验第35页
     ·EMSA实验(electrophoretic mobility shift assay)第35-37页
       ·DNA底物的准备第36页
       ·EMSA反应体系第36-37页
     ·DrRecQ蛋白Helicase活性检测第37-39页
第三章 :实验结果与分析第39-84页
 1、DrRecQ的克隆和蛋白质的表达纯化第39-56页
   ·DrRecQ蛋白质的初步表达纯化第43-50页
     ·DrRecQ1-824-pET28at_plus的表达纯化第43-45页
     ·DrRecQ1-610-pET28at_plus的表达纯化第45-46页
     ·DrRecQ1-520-pET28at_plus的表达纯化第46-47页
     ·DrRecQ1-824-Holliday Junction复合物纯化结果第47-50页
   ·DrRecQ去除杂质DNA的纯化第50-55页
   ·DrRecQ蛋白质纯化小结第55-56页
 2、蛋白质的结晶优化及水溶液中蛋白小角实验分析第56-68页
   ·蛋白质结晶和优化第56-62页
     ·DrRecQ1-824的结晶与优化第56-58页
     ·DrRecQ1-610的结晶和优化第58-60页
     ·DrRecQ1-520的晶体优化第60-62页
   ·DrRecQ1-824和DrRecQ1-610的小角数据分析第62-66页
   ·DrRecQ1-520蛋白质晶体结构第66-68页
 3、DrRecQ的生化实验结果与分析第68-84页
   ·ATP水解实验第68-70页
   ·EMSA实验结果与分析第70-82页
     ·DrRecQ1-520与不同类型DNA的EMSA结果第70-73页
     ·DrRecQ1-610与不同类型DNA的EMSA结果第73-76页
     ·DrRecQ1-824与不同类型DNA的EMSA结果第76-80页
     ·不同的DrRecQ蛋白质与Y-DNA的EMSA结果第80-82页
   ·DrRecQ1-824蛋白质Helicase活性检测第82-84页
全文总结与展望第84-85页
附录第85-88页
参考文献第88-92页
致谢第92-94页
学位论文评阅及答辩情况表第94页

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