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HumanCosavirus套式PCR检测方法的建立及基因组序列分析

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-6页
符号说明第6-10页
第一章 文献综述第10-21页
 1 HCoSV 的研究进展第10-11页
 2 病原学第11-14页
   ·形态学特征第11页
   ·基因组结构第11-13页
   ·遗传分类第13页
   ·体外培养第13-14页
   ·致病性第14页
 3 流行病学第14-15页
   ·分子流行病学第14-15页
   ·环境中的HCoSV第15页
 4 HCoSV 的检测方法第15-20页
   ·微生物学检测第15-16页
     ·电镜(EM)直接观察法第15-16页
     ·免疫电镜法第16页
   ·免疫学检测技术第16-17页
     ·免疫吸附凝集试验第16页
     ·酶联免疫试验第16-17页
   ·分子生物学检测第17-20页
     ·RT-PCR 方法第18-19页
     ·核酸杂交法第19页
     ·荧光定量RT-PCR 法第19-20页
     ·宏基因组学 ( metagenomics)第20页
 5 本研究的目的与意义第20-21页
第二章 HCoSV 套式PCR 检测方法的建立及应用第21-29页
 1 材料第21-22页
   ·粪便样本第21页
   ·病毒样品第21页
   ·主要试剂第21-22页
   ·主要仪器第22页
 2 实验方法第22-23页
   ·引物的设计与合成第22页
   ·病毒总RNA 的提取第22-23页
   ·cDNA 的合成第23页
 3 套式PCR 方法的建立第23-24页
   ·PCR 条件的优化第23页
   ·PCR 扩增第23-24页
   ·PCR 产物克隆与DNA 序列分析第24页
   ·PCR 特异性试验第24页
   ·PCR 灵敏性试验第24页
   ·套式PCR检测方法的应用第24页
 4 结果第24-27页
   ·最佳的PCR 反应条件第24-25页
   ·PCR 法的特异性第25-26页
   ·PCR 法的灵敏性第26页
   ·临床样品的检测第26-27页
 5 讨论第27-29页
第三章 HCoSV 基因组的扩增及序列分析第29-47页
 1 技术原理第29-30页
 2 引物设计第30-32页
 3 反应条件第32-35页
   ·染色体步移技术第32-33页
     ·1~(st) PCR 反应第32页
     ·2~(nd) PCR 反应第32-33页
     ·3~(nd) PCR 反应第33页
   ·普通PCR 反应条件第33-34页
   ·长片段扩增反应条件第34-35页
 4 结果第35-45页
   ·HCoSV 本实验毒株基因结构图第35-36页
   ·HCoSV 本实验毒株基因组序列信息第36-39页
   ·系统分析及进化树第39-45页
 5 讨论第45-47页
第四章 HCoSV VP3 蛋白的原核表达及纯化第47-59页
 1 材料第47-48页
   ·粪便样品、菌株和质粒第47页
   ·主要试剂第47页
   ·主要仪器第47-48页
 2 实验方法第48-55页
   ·引物的设计与合成第48页
   ·RT-PCR 反应第48-49页
     ·cDNA 的合成第48页
     ·PCR 扩增第48-49页
   ·目的片段的纯化回收第49-50页
   ·目的基因的克隆第50-51页
     ·克隆质粒的构建第50页
     ·克隆质粒的筛选及制备第50-51页
       ·克隆质粒的转化及筛选第50页
       ·克隆质粒的提取及鉴定第50-51页
   ·原核表达载体PET-30a-VP3 的构建第51-53页
     ·双酶切反应第51-52页
     ·PET-30a 空载体的线性化双酶切第52-53页
     ·目的基因与线性化表达载体pET-30a 的连接第53页
     ·原核表达载体的转化与鉴定第53页
   ·重组表达载体的诱导表达第53页
   ·最优表达时间的确定第53-54页
   ·表达产物的纯化第54页
     ·包涵体的分离和变性第54页
     ·目的蛋白的纯化第54页
   ·表达产物的复性第54-55页
 3 结果第55-57页
   ·VP3 基因的PCR 结果第55页
   ·目的基因的克隆鉴定第55页
   ·重组表达载体的鉴定第55-56页
   ·蛋白原核表达及最优表达时间的确定第56页
   ·蛋白的可溶性分析第56-57页
   ·蛋白的纯化与复性第57页
 4 讨论第57-59页
第五章 结论第59-61页
参考文献第61-68页
附录Ⅰ 试剂配置第68-71页
攻读学位期间发表的学术论文目录第71-72页
致谢第72-74页

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