| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-20页 |
| ·生物信息学简介 | 第10-15页 |
| ·分子生物信息学背景概述 | 第10-13页 |
| ·生物信息学研究内容 | 第13-15页 |
| ·基序查找问题定义及研究现状 | 第15-19页 |
| ·生物序列中基序查找问题定义 | 第17-18页 |
| ·研究现状 | 第18-19页 |
| ·课题研究目标和意义 | 第19页 |
| ·论文组织 | 第19-20页 |
| 第二章 弱信号基序查找算法比较与分析 | 第20-35页 |
| ·引言 | 第20-21页 |
| ·弱信号基序查找问题模型 | 第21-22页 |
| ·基序模型 | 第22-23页 |
| ·弱信号基序查找算法分析 | 第23-29页 |
| ·基序查找基本算法策略 | 第23-25页 |
| ·基于PMP模型的弱信号基序查找算法 | 第25-28页 |
| ·基于EMP模型的弱信号基序查找算法 | 第28-29页 |
| ·实验比较与分析研究 | 第29-34页 |
| ·小结 | 第34-35页 |
| 第三章 基于统一投影和邻居桶聚集策略的基序查找算法 | 第35-45页 |
| ·投影算法概述 | 第35-37页 |
| ·UPNT算法 | 第37-41页 |
| ·UPNT算法思想 | 第37-40页 |
| ·UPNT算法描述 | 第40-41页 |
| ·实验和分析 | 第41-44页 |
| ·植入(l，d)基序问题的实验结果 | 第41-42页 |
| ·GC分布偏移问题的实验结果 | 第42-44页 |
| ·结论 | 第44-45页 |
| 第四章 基于Box-Links的二分体基序查找算法 | 第45-54页 |
| ·二分体基序查找概述 | 第45-47页 |
| ·RISO算法 | 第47-49页 |
| ·DMDB算法 | 第49-51页 |
| ·实验与分析 | 第51-53页 |
| ·结论 | 第53-54页 |
| 第五章 结束语 | 第54-56页 |
| ·研究工作总结 | 第54-55页 |
| ·进一步研究工作 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 研究成果 | 第61页 |