| 中文摘要 | 第1-11页 |
| 英文摘要 | 第11-14页 |
| 第一部分 文献综述 | 第14-59页 |
| 第1章 DNA标记在作物育种中的应用 | 第15-36页 |
| 1．1 生物技术在作物育种中的应用 | 第15页 |
| 1．2 DNA标记 | 第15-18页 |
| 1．2．1 遗传学标记 | 第15-16页 |
| 1．2．2 DNA标记的分类 | 第16-18页 |
| 1．2．2．1 基于Southern杂交的DNA标记 | 第16-17页 |
| 1．2．2．2 基于PCR的DNA标记 | 第17-18页 |
| 1．3 DNA标记在作物育种中的应用 | 第18-27页 |
| 1．3．1 遗传图谱的构建 | 第18-20页 |
| 1．3．1．1 作图标记的选择 | 第19页 |
| 1．3．1．2 分离群体的选择 | 第19页 |
| 1．3．1．3 数据分析 | 第19-20页 |
| 1．3．2 鉴定和应用种质资源 | 第20-21页 |
| 1．3．2．1 种质资源的鉴定和管理 | 第20页 |
| 1．3．2．2 杂交组合表现的预测 | 第20-21页 |
| 1．3．3 标记辅助选择 | 第21-23页 |
| 1．3．3．1 近等基因系 | 第21-22页 |
| 1．3．3．2 建池分离分析方法 | 第22页 |
| 1．3．3．3 QTLs的定位 | 第22页 |
| 1．3．3．4 MAS的应用 | 第22-23页 |
| 1．3．4 比较作图分析 | 第23-25页 |
| 1．3．4．1 共线性分析 | 第23-25页 |
| 1．3．4．2 共线性的应用 | 第25页 |
| 1．3．5 图位克隆 | 第25-27页 |
| 1．3．5．1 物理图谱的构建 | 第25-26页 |
| 1．3．5．2 染色体步行法 | 第26页 |
| 1．3．5．3 图位克隆的改进 | 第26-27页 |
| 1．4 总结 | 第27-28页 |
| 参考文献 | 第28-36页 |
| 第2章 外源基因在转基因植物中的定位 | 第36-41页 |
| 2．1 转基因技术及外源基因定位 | 第36页 |
| 2．2 外源基因定位的方法 | 第36-37页 |
| 2．2．1 原位杂交 | 第36页 |
| 2．2．2 形态学标记和同工酶标记 | 第36-37页 |
| 2．2．3 分子标记 | 第37页 |
| 2．2．3．1 RFLP标记 | 第37页 |
| 2．2．3．2 RAPD标记 | 第37页 |
| 2．3 外源基因定位数据的应用 | 第37-39页 |
| 2．3．1 对外源基因插入位点的研究 | 第37-38页 |
| 2．3．2 分析外源基因在受体中的遗传行为 | 第38页 |
| 2．3．2．1 对基因沉默的研究 | 第38页 |
| 2．3．2．2 对转座子转座的研究 | 第38页 |
| 2．3．3 在遗传育种领域的应用 | 第38-39页 |
| 2．3．3．1 作为种质数据 | 第38页 |
| 2．3．3．2 标记辅助选择 | 第38页 |
| 2．3．3．3 安全性研究 | 第38-39页 |
| 2．4 展望 | 第39页 |
| 参考文献 | 第39-41页 |
| 第3章 符合孟德尔分离时遗传标记连锁图谱的构建方法 | 第41-49页 |
| 3．1 回交、DH群体 | 第41-42页 |
| 3．2 重组近交系和近等基因系 | 第42页 |
| 3．3 F_2群体 | 第42-47页 |
| 3．3．1 两个显性标记 | 第42-45页 |
| 3．3．1．1 最大似然估计法 | 第43页 |
| 3．3．1．2 三点自交法 | 第43-45页 |
| 3．3．2 两个共显性标记 | 第45-46页 |
| 3．3．3 一个显性标记与一个共显性标记 | 第46-47页 |
| 3．4 影响遗传图谱构建的因素 | 第47页 |
| 参考文献 | 第47-49页 |
| 第4章 存在偏分离时遗传标记连锁图谱的构建方法 | 第49-59页 |
| 4．1 遗传标记的偏分离及其产生的因素 | 第49页 |
| 4．2 回交和DH群体 | 第49-52页 |
| 4．2．1 重组值估计 | 第49-50页 |
| 4．2．2 标准误比较 | 第50-51页 |
| 4．2．3 连锁关系检测 | 第51-52页 |
| 4．3 F_2群体 | 第52-57页 |
| 4．3．1 显性标记 | 第52-55页 |
| 4．3．1．1 A、B配子选择 | 第53页 |
| 4．3．1．2 A、B合子选择 | 第53-54页 |
| 4．3．1．3 A配子选择、B合子选择 | 第54页 |
| 4．3．1．4 不同选择影响估计的方式 | 第54-55页 |
| 4．3．2 共显性标记 | 第55-56页 |
| 4．3．2．1 重组值估计 | 第55-56页 |
| 4．3．2．2 选择类型的确定 | 第56页 |
| 4．3．3 显性与共显性标记 | 第56-57页 |
| 4．4 讨论 | 第57页 |
| 参考文献 | 第57-59页 |
| 第二部分 水稻F_2群体SSRs连锁分析及分子标记作图模型研究 | 第59-94页 |
| 第5章 基于F_2群体的水稻微卫星标记作图 | 第60-67页 |
| 5．1 材料和方法 | 第60-62页 |
| 5．1．1 材料 | 第60页 |
| 5．1．2 SSRs标记的扩增及多态性分析 | 第60-61页 |
| 5．1．2．1 SSRs标记引物合成 | 第60-61页 |
| 5．1．2．2 水稻DNA提取 | 第61页 |
| 5．1．2．3 SSRs标记多态性扩增和检测 | 第61页 |
| 5．1．3 遗传数据分析 | 第61-62页 |
| 5．2 结果 | 第62-65页 |
| 5．2．1 SSRs标记多态性分析 | 第62-63页 |
| 5．2．2 cw2群体SSRs标记的偏分离 | 第63页 |
| 5．2．3 cw3群体SSRs标记的正常分离 | 第63-64页 |
| 5．2．4 5个SSRs标记基于cw3群体的连锁图谱构建 | 第64-65页 |
| 5．3 讨论 | 第65页 |
| 参考文献 | 第65-67页 |
| 第6章 三点自交法和两点最大似然法构建水稻F_2群体分子标记连锁图谱的比较 | 第67-75页 |
| 6．1 材料 | 第67-68页 |
| 6．2 方法 | 第68-69页 |
| 6．2．1 三点自交法和两点最大似然法 | 第68页 |
| 6．2．2 连锁图谱构建 | 第68页 |
| 6．2．3 Fisher信息计算 | 第68-69页 |
| 6．3 结果和分析 | 第69-73页 |
| 6．3．1 F_2群体分子标记连锁数据的处理和分析 | 第69-71页 |
| 6．3．2 连锁图谱的比较分析 | 第71-72页 |
| 6．3．3 Fisher精确度比较分析 | 第72-73页 |
| 6．4 讨论 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-75页 |
| 第7章 F_2群体分子标记基于偏分离评估的作图 | 第75-82页 |
| 7．1 确定选择类型的两种χ~2检测 | 第75-76页 |
| 7．2 遗传距离估算方法 | 第76-78页 |
| 7．3 实例分析 | 第78-80页 |
| 7．3．1 选择类型的确定 | 第78-79页 |
| 7．3．2 重组值及选择强度的估算 | 第79-80页 |
| 7．4 讨论 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-82页 |
| 第8章 通用的遗传标记作图最大似然模型 | 第82-94页 |
| 8．1 回交和DH群体 | 第82-85页 |
| 8．1．1 重组值估计 | 第82-83页 |
| 8．1．2 有效性比较 | 第83-85页 |
| 8．2 F_2群体 | 第85-91页 |
| 8．2．1 显性标记 | 第85-87页 |
| 8．2．1．1 重组值估计 | 第85-86页 |
| 8．2．1．2 有效性比较 | 第86-87页 |
| 8．2．2 共显性标记 | 第87-90页 |
| 8．2．2．1 重组值估计 | 第87-88页 |
| 8．2．2．2 有效性比较 | 第88-90页 |
| 8．2．3 一个共显性标记和显性标记 | 第90-91页 |
| 8．3 通用MLE在连锁图谱构建中的应用前景 | 第91页 |
| 8．3．1 通用MLE迭代求解的特征 | 第91页 |
| 8．3．2 基于通用MLE的作图新策略 | 第91页 |
| 8．4 讨论 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-94页 |
| 附录A 表目录 | 第94-95页 |
| 附录B 图目录 | 第95-96页 |
| 附录C F_2群体分子标记原始数据 | 第96-97页 |
