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猪繁殖与呼吸综合征病毒5非翻译区的结构与功能解析

摘要第1-8页
Abstract第8-15页
第一章 绪论第15-28页
   ·猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子生物学研究进展第15-22页
     ·病原的分类地位及理化特性第15页
     ·PRRSV 基因组成及性质第15-16页
     ·PRRSV 基因组翻译和复制第16-17页
     ·PRRSV 亚基因组的转录第17-18页
     ·病毒基因组编码的蛋白及其功能第18-21页
     ·PRRS 疾病的防治及疫苗现状第21-22页
   ·单股正链RNA 病毒基因组5′非翻译区的结构与功能研究进展第22-28页
     ·5′UTR 各序列/元件的结构特征第23页
     ·5′UTR 结构与功能的研究方法第23-24页
     ·5′UTR 的功能及其与高级结构的关系第24-26页
     ·问题及前景第26-28页
第二章 PRRSV 基因组5′UTR 一级序列、二级结构的生物信息学分析第28-31页
   ·材料与方法第28-29页
     ·材料第28页
     ·方法第28-29页
   ·结果第29-30页
     ·PRRSV 5′UTR 一级核苷酸序列比对结果第29页
     ·PRRSV 5′UTR 二级结构分析结果第29-30页
   ·讨论第30-31页
第三章 PRRSV基因组5′UTR 中茎环结构SL2的功能研究第31-55页
   ·材料与方法第31-43页
     ·细胞与质粒第31页
     ·试剂第31-32页
     ·主要仪器第32页
     ·PRRSV 5' UTR N-SL2 突变克隆的构建第32-36页
     ·突变质粒DNA 转染BHK-21 细胞第36-37页
     ·病毒库的建立第37页
     ·病毒上清RNA 的提取第37-38页
     ·细胞总RNA 的提取第38页
     ·RT-PCR 检测病毒正负链基因组及亚基因组第38-42页
     ·间接免疫荧光试验(IFA)第42页
     ·Northern blot 分析第42-43页
     ·病毒空斑形态分析第43页
     ·病毒多步生长曲线的绘制第43页
     ·突变病毒的二级结构预测分析第43页
   ·结果第43-53页
     ·PRRSV 5' UTR N-SL2 突变克隆的构建结果第43-46页
     ·N-SL2 的茎环结构突变体对病毒基因组复制和亚基因组转录的影响第46-47页
     ·N-SL2 的茎环结构突变体对病毒结构蛋白的表达、RNA 的合成及表型特性的影响第47-48页
     ·PRRSV SL2 在两型之间可以功能性替换第48-49页
     ·N-SL2 的茎结构整体性是保证病毒亚基因组转录的必要条件第49-51页
     ·N-SL2 的茎环结构突变体对病毒结构蛋白的表达及表型特性的影响第51-52页
     ·N-SL2 突变病毒的遗传稳定性第52页
     ·SL2 在动脉炎病毒及部分冠状病毒中型间保守第52-53页
   ·讨论第53-55页
第四章 PRRSV基因组5′UTR 中一特殊作用元件的鉴定及其功能解析第55-64页
   ·材料与方法第55-60页
     ·细胞与质粒第55-56页
     ·试剂第56页
     ·主要仪器第56页
     ·PRRSV 5' UTR LTH 一茎部结构突变克隆的构建第56-59页
     ·突变质粒DNA 转染MARC-145 细胞第59页
     ·病毒库的建立第59页
     ·病毒上清RNA 的提取及RT-PCR 检测第59页
     ·间接免疫荧光试验(IFA)第59页
     ·Northern blot 分析第59-60页
     ·病毒空斑形态分析第60页
     ·突变病毒的二级结构预测分析第60页
   ·结果第60-63页
     ·突变全长克隆质粒的构建第60页
     ·LTH C/C’部分二级茎结构不影响病毒的复制过程第60-61页
     ·LTH C 部分一级序列对病毒复制所起的调控作用第61-62页
     ·突变病毒的空斑形态学分析及病毒稳定性分析第62-63页
   ·讨论第63-64页
第五章 PRRSV 基因组5′UTR 前导序列TRS侧翼序列的结构与功能解析第64-75页
   ·材料与方法第64-70页
     ·细胞与质粒第64页
     ·试剂第64页
     ·主要仪器第64页
     ·PRRSV 5' UTR 前导序列TRS 侧翼序列突变克隆的构建第64-68页
     ·突变质粒DNA 转染BHK-21 细胞第68页
     ·突变质粒DNA 转染MARC-145 细胞第68页
     ·病毒库的建立第68页
     ·病毒上清RNA 的提取及RT-PCR 检测第68页
     ·突变病毒正链亚基因组5 和7(sg mRNA5 and sg mRNA7)的鉴定第68-70页
     ·间接免疫荧光试验(IFA)第70页
     ·病毒空斑形态分析第70页
     ·病毒多步生长曲线的绘制第70页
     ·突变病毒的二级结构预测分析第70页
   ·结果第70-74页
     ·突变全长克隆质粒的构建第70-71页
     ·突变体的突变位点比对分析第71页
     ·LTH A/A’前导TRS 侧翼序列对病毒sg mRNA 转录的影响第71-72页
     ·LTH A/A’前导TRS 侧翼序列对病毒结构蛋白翻译的影响第72-73页
     ·突变病毒的空斑形态学分析及病毒稳定性分析第73页
     ·突变病毒的病毒滴定分析第73-74页
   ·讨论第74-75页
第六章 结论第75-76页
参考文献第76-88页
致谢第88-89页
作者简介第89-90页

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