生物序列的几何刻画及应用
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 1 绪论 | 第10-26页 |
| ·生物信息学产生的背景 | 第10-11页 |
| ·生物信息学的研究对象 | 第11-19页 |
| ·核酸 | 第12-14页 |
| ·蛋白质 | 第14-16页 |
| ·分子遗传机制 | 第16-19页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第19-23页 |
| ·序列比较 | 第19-21页 |
| ·系统发育与分子进化 | 第21-23页 |
| ·本文主要工作 | 第23-26页 |
| 2 生物序列的图形表示及相似性分析 | 第26-48页 |
| ·引言 | 第26-32页 |
| ·2-D图形表示 | 第26-28页 |
| ·3-D图形表示 | 第28-32页 |
| ·其他的图形表示 | 第32页 |
| ·RNA二级结构序列的2-D图形表示 | 第32-39页 |
| ·2-D图形表示模型的提出 | 第34-36页 |
| ·RNA二级结构序列的数值特征 | 第36-37页 |
| ·RNA二级结构序列的相似性分析 | 第37-39页 |
| ·蛋白质序列的2-D图形表示 | 第39-43页 |
| ·2-D图形表示模型的提出 | 第39-41页 |
| ·蛋白质序列的相似性分析 | 第41-43页 |
| ·本章小节 | 第43-48页 |
| 3 曲率在生物序列相似性分析中的应用 | 第48-62页 |
| ·引言 | 第48-51页 |
| ·由图形表示提取矩阵 | 第48-50页 |
| ·矩阵的不变量 | 第50页 |
| ·利用不变量来比较生物序列的相似性 | 第50-51页 |
| ·曲率在生物序列相似性比较中的应用 | 第51-59页 |
| ·材料和方法 | 第51-53页 |
| ·相似性分析 | 第53-59页 |
| ·本章小节 | 第59-62页 |
| 4 挠率在生物序列相似性分析中的应用 | 第62-72页 |
| ·蛋白质的TOPS图表示 | 第62-63页 |
| ·3-D图形表示 | 第63-66页 |
| ·差分形式的挠率 | 第66-67页 |
| ·相似性分析 | 第67-69页 |
| ·本章小节 | 第69-72页 |
| 5 曲率和挠率联合的应用 | 第72-84页 |
| ·材料和方法 | 第72-75页 |
| ·3-D图形表示 | 第72-73页 |
| ·曲率和挠率的差分公式 | 第73-75页 |
| ·相似性分析 | 第75-82页 |
| ·本章小节 | 第82-84页 |
| 结论 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-94页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第94-96页 |
| 致谢 | 第96-98页 |
