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玫瑰黄链霉菌几丁质酶基因及抗生素合成基因簇研究

第一章:拮抗链霉菌几丁质酶基因分子探测第1-35页
 1 引言第12-15页
 2 材料与方法第15-21页
   ·材料第15-17页
     ·菌株第15页
     ·培养基第15-16页
     ·试剂第16-17页
     ·主要仪器第17页
   ·方法第17-21页
     ·链霉菌菌株的分离第17页
     ·拮抗链霉菌菌株的筛选第17-18页
     ·链霉菌菌株的保藏第18页
     ·产几丁质酶菌株的筛选第18页
     ·链霉菌DNA提取方法第18-19页
     ·几丁质酶基因保守引物设计、合成和扩增第19页
     ·PCR扩增测序第19-20页
     ·PCR扩增片段的BLAST分析第20-21页
 3 结果与分析第21-31页
   ·拮抗链霉菌分离第21页
   ·拮抗链霉菌菌株的几丁质酶活性测定第21-22页
   ·快速提取链霉菌DNA的方法第22-24页
   ·几丁质酶基因保守引物设计第24-26页
   ·几丁质酶基因的PCR探测第26-27页
   ·PCR产物序列分析第27-31页
     ·Men-myco-93-63菌株PCR产物序列分析第28-29页
     ·S93菌株PCR产物序列分析第29-31页
 4 讨论第31-34页
   ·拮抗链霉菌菌株的筛选第31页
   ·产几丁质酶生防链霉菌菌株的筛选第31-32页
   ·几丁质酶的PCR检测第32-34页
 5 结论第34-35页
第二章 玫瑰黄链霉菌Men-myco-93-63几丁质酶基因ChiC的克隆及原核表达第35-59页
 1 引言第35-37页
 2 材料与方法第37-45页
   ·材料第37-39页
     ·菌株与质粒第37页
     ·培养基第37-38页
     ·试剂与酶第38-39页
     ·主要仪器第39页
   ·方法第39-45页
     ·链霉菌孢子悬液的制备第39页
     ·链霉菌DNA提取:第39-40页
     ·Men-myco-93-63几丁质酶基因ChiC催化域的扩增第40页
     ·Men-myco-93-63几丁质酶基因ChiC催化域的克隆第40-41页
     ·E.coli质粒DNA小量提取第41页
     ·E.coli质粒DNA大量提取第41页
     ·限制酶切反应第41-42页
     ·去磷酸化反应第42页
     ·DNA连接反应第42页
     ·E.coli感受态细胞的制备第42页
     ·质粒DNA转化E.coli第42页
     ·E.coli转化子的快速鉴定第42页
     ·Men-myco-93-63 ChiC基因的表达及活性检测第42-45页
 3 结果与分析第45-56页
   ·Men-myco-93-63几丁质酶基因ChiC催化域的克隆和表达第45-49页
     ·Men-myco-93-63几丁质酶基因ChiC催化域的克隆第45-47页
     ·表达载体的构建第47-48页
     ·SDS-PAGE分析第48-49页
     ·几丁质酶活性测定第49页
   ·Men-myco-93-63几丁质酶基因ChiC拼接后表达第49-56页
     ·几丁质酶基因ChiC催化域PCR扩增第49-50页
     ·几丁质酶前端序列的PCR扩增第50页
     ·表达载体的构建第50-53页
     ·SDS-PAGE分析第53-54页
     ·几丁质酶活性测定第54-56页
 4 讨论第56-58页
   ·几丁质酶催化域的克隆及E.coli表达第56页
   ·几丁质酶基因拼接表达第56-58页
 5 结论第58-59页
第三章 玫瑰黄链霉菌Men-myco-93-63抗生素生物合成基因簇的初步研究第59-89页
 1 引言第59-62页
 2 材料与方法第62-71页
   ·材料第62-65页
     ·菌株与质粒第62页
     ·培养基第62-63页
     ·试剂第63-65页
     ·主要仪器第65页
   ·方法第65-71页
     ·链霉菌孢子悬浮液的制备第65页
     ·链霉菌DNA提取:第65页
     ·E.coli质粒DNA提取第65页
     ·E.coli感受态细胞的制备第65-66页
     ·质粒酶切、去磷酸化、连接第66页
     ·总DNA的Sau3AI不完全酶切第66页
     ·蔗糖浓度梯度离心第66-67页
     ·噬菌外壳蛋白包装第67页
     ·E.coli LE392感受态细胞制备第67页
     ·噬菌体转导第67页
     ·挑选转化子第67页
     ·文库的筛选第67页
     ·Southem印迹杂交第67-69页
     ·链霉菌质粒提取第69页
     ·链霉菌的原生质体制备,转化及再生程序第69-70页
     ·转化子活性检测第70页
     ·抗性检测第70-71页
 3 结果与分析第71-85页
   ·玫瑰黄链霉菌Men-myco-93-63基因文库的建立第71-73页
     ·总DNA的Sau3AI不完全酶切第71页
     ·DNA片段的蔗糖梯度离心第71-72页
     ·质粒载体pKC505的处理第72页
     ·载体与外源片段的连接、包装及侵染第72页
     ·文库质量分析第72-73页
   ·鸟枪法克隆抗生素合成基因簇第73页
   ·探针的获得第73-77页
     ·PKS类引物的合成和扩增第73-75页
     ·糖苷类引物的合成和扩增第75-76页
     ·NRPS类引物的合成和扩增第76页
     ·抗生素抗性基因引物的合成和扩增第76-77页
   ·玫瑰黄链霉菌Men-myco-93-63β-内酰胺酶基因的克隆第77-85页
     ·质粒文库的构建第77-79页
     ·文库筛选第79-85页
 4 讨论第85-88页
 5 结论第88-89页
全文结论第89-95页
参考文献第95-106页
在读期间发表的学术论文第106-107页
作者简历第107-122页
致谢第122页

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