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利用测序水稻品种构建重组自交系群体及SSR遗传连锁图谱的初步制作研究

摘要(中文)第1-9页
摘要(英文)第9-10页
第一章 文献综述第10-30页
 1 水稻基因组研究概况第10页
 2 水稻基因组作图研究进展第10-18页
   ·遗传图谱第10-12页
   ·物理图谱第12-14页
   ·基因组序列第14-16页
   ·植物基因组比较作图研究进展第16-18页
     ·植物比较遗传作图第16-17页
     ·植物比较物理作图第17-18页
 3 遗传图谱的构建设方法第18-29页
   ·作图群体的组建第18-20页
     ·亲本的选配第18页
     ·作图群体类型第18-20页
       ·F_2群体第19页
       ·BC_1群体第19页
       ·重组自交系(Recombinant Inbred Line,RIL)群体第19页
       ·DH(Doubled Haploid)群体第19-20页
     ·作图群体大小确定和选择第20页
   ·遗传图谱制作第20-29页
     ·DNA分子标记第20-28页
       ·基于Southern杂交技术的分子标记第21页
       ·基于PCR技术的分子标记第21-26页
         ·随机扩增多态性DNA(RAPD)第22-24页
         ·扩增片段长度多态性(AFLP)第24页
         ·序列标签位点(STS)第24-25页
         ·特征序列扩增区域(SCAR)第25页
         ·CAPS(Cleaved amplified polymorphic sequence)第25页
         ·常用几种DNA标记的优缺点比较第25-26页
       ·DNA分子标记在作物育种上的应用第26-28页
         ·构建品种的DNA指纹图第26-27页
         ·杂交育种中亲本选配第27页
         ·杂种优势预测第27页
         ·分子标记辅助选择第27-28页
           ·质量性状的MAS第27-28页
           ·数量性状的MAS第28页
     ·分子标记分离数据的收集与处理第28-29页
     ·连锁图谱绘制第29页
     ·分子标记连锁群的染色体定位第29页
 4.研究思路第29-30页
第二章 材料与方法第30-34页
 1 重组自交系(RIL)群体的构建第30-31页
   ·亲本材料第30页
   ·RIL的构建第30页
   ·RIL性状考察及评价第30-31页
     ·性状考察第30页
     ·RIL的评价第30-31页
       ·性状评价第30页
       ·SSR分子评价第30-31页
 2 SSR引物第31页
 3 SSR分析第31-32页
   ·DNA微量提取法第31页
   ·DNA质量检测第31页
     ·定性检测第31页
     ·定量检测第31页
   ·反应体系和反应程序第31-32页
   ·电泳检测第32页
 4 连锁图谱制作第32-33页
   ·SSR数据资料的收集第32页
   ·遗传图谱绘制第32-33页
 5 标记分离统计分析第33页
 6 QTL定位第33-34页
第三章 结果与分析第34-60页
 1 重组自交系(RIL)群体的构建及评价第34-41页
   ·RIL的构建第34页
   ·RIL的性状表现第34页
   ·RIL的遗传纯合度检测第34-41页
     ·性状检测第34页
     ·分子标记检测第34-41页
 2 传连锁图谱的构建第41-45页
   ·亲本间的SSR多态性分析第41页
   ·SSR遗传图谱的构建第41-45页
     ·F_2图谱构建第41-42页
     ·F_6图谱构建第42-45页
 3 水稻分子图谱的比较第45-51页
   ·F_2图谱和F_6图谱的比较第45-50页
   ·与Nipponbare基因组序列图比较第50-51页
 4 SSR标记的分离概况第51-59页
   ·定位在F_6图谱上标记分离情况第51-53页
   ·未标记在F_6图谱上标记的分离情况第53-54页
   ·偏分离热点区域第54-59页
 5 RIL群体中3类性状的QTL定位分析第59-60页
第四章 讨论第60-65页
 1 关于重组自交系群体的构建与评价第60页
 2 关于遗传图谱的构建第60-61页
 3 关于图谱的比较第61-62页
 4 关于重组自交系群体中的偏分离标记和未定标记第62-63页
 5 关于QTL定位分析第63-65页
参考文献第65-71页
硕士期间发表的学术论文第71-72页
致谢第72页

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