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近海养殖场底泥微生物区系结构和功能的研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-19页
第一章 绪论第19-31页
   ·水产养殖环境微生物生态研究的意义第19-23页
     ·微生物生态学(Microbial ecology)的概念第19页
     ·微生物在水产养殖环境中的作用第19-21页
     ·环境生态对生态食品质量的影响第21-22页
     ·绿色食品、有机食品和生态食品的概念第22-23页
   ·微生物生态学研究的方法第23-27页
     ·传统微生物生态学研究方法的局限性和实用性第24-25页
     ·分子微生物生态学研究方法的进展及应用前景第25-27页
   ·课题研究的立题依据和主要研究内容第27-28页
     ·立题依据第27-28页
     ·主要研究内容第28页
 参考文献第28-31页
第一部分 底泥细菌分离、鉴定及其分类学研究第31-105页
 第二章 底泥细菌的分离、生理生化鉴定第31-61页
   ·引言第31页
   ·材料与方法第31-39页
     ·样品和菌株第31页
     ·培养基第31-34页
     ·培养条件第34页
     ·分离和纯化第34页
     ·生理生化鉴定方法第34-39页
   ·结果第39-50页
     ·菌落形态和菌体形态第39-42页
     ·生理生化实验结果第42-43页
     ·底泥细菌生理生化分类结果第43-50页
   ·讨论第50页
  参考文献第50-52页
  附录: 养殖场底泥中分离纯化的106株细菌的菌体形态第52-61页
 第三章 底泥细菌的ARDRA图谱的聚类分析和序列测定第61-76页
   ·引言第61页
   ·材料与方法第61-66页
     ·菌株第61页
     ·主要仪器、设备和试剂第61页
     ·实验方法第61-66页
   ·结果第66-72页
     ·菌株的ARDRA图谱分析第66-71页
     ·ARDRA聚类分析结果第71-72页
     ·部分菌株序列测定第72页
   ·讨论第72-74页
     ·ARDRA图谱聚类分析的可行性第72-74页
     ·ARDR图谱聚类分析的局限性第74页
  参考文献第74-76页
 第四章 底泥细菌分类鉴定结果及其种群结构分析第76-83页
   ·底泥细菌分类鉴定结果第76-80页
     ·综合分析结果第76-77页
     ·细菌鉴定结果分析第77-80页
   ·结论第80-81页
     ·底泥细菌种群结构及其分布特征第80-81页
     ·细菌种群结构与底泥环境关系的分析第81页
  参考文献第81-83页
 第五章 Bacillus catenulatus sp. strain 2-2的鉴定和细胞分化的研究第83-105页
   ·引言第83页
   ·材料与方法第83-88页
     ·菌株第83-84页
     ·培养基第84页
     ·培养条件第84-85页
     ·生理生化实验方法第85页
     ·菌体细胞成分分析第85-88页
   ·结果第88-101页
     ·菌落形态和菌体形态第88-91页
     ·生理生化鉴定指标第91-92页
     ·细菌生长特征第92-95页
     ·细胞壁成分分析第95页
     ·16S rDNA酶切图谱分析第95-96页
     ·16S rDNA序列测定和系统发育分析第96-100页
     ·质粒提取第100页
     ·全细胞蛋白图谱第100-101页
     ·菌株2-2y与菌株2-2w之间的分化第101页
   ·讨论第101-103页
     ·菌株分类鉴定结果第101-102页
     ·Bacillus catenulatus sp. strain 2-2细胞的分化特性第102-103页
  参考文献第103-105页
第二部分 底泥生源要素循环的微生物学特征第105-155页
 第六章 底泥细菌生物总量及其分布特征第105-111页
   ·引言第105页
   ·材料与方法第105-108页
     ·样品和菌株第105-106页
     ·培养基第106页
     ·培养条件第106页
     ·底泥样品的各项理化指标的分析方法第106页
     ·细菌生物总量统计方法第106-108页
   ·结果第108-110页
     ·底泥各项理化指标测定结果第108页
     ·底泥各样品细菌计数结果第108-110页
   ·讨论第110页
     ·养殖场底泥环境状况第110页
     ·底泥中细菌总数和分布第110页
  参考文献第110-111页
 第七章 底泥细菌在碳素(有机含碳化合物)代谢中的特征第111-121页
   ·引言第111页
   ·材料与方法第111-113页
     ·样品和菌株第111页
     ·培养基第111-112页
     ·培养条件第112页
     ·参与代谢含碳有机化合物的生理类群的细菌数量统计第112-113页
     ·代谢含碳有机化合物的生理类群细菌的种群结构第113页
   ·结果第113-118页
     ·底泥中参与含碳有机化合物代谢的生理类群的细菌数量第113-114页
     ·不同含碳有机化合物代谢生理类群细菌的种群结构第114-118页
   ·讨论第118-119页
  参考文献第119-121页
 第八章 底泥细菌在氮素循环中的特征第121-136页
   ·引言第121-123页
     ·环境中的氮循环及其作用第121-123页
     ·底泥中氮素来源和种类第123页
   ·材料与方法第123-126页
     ·样品和菌株第123页
     ·培养基第123-124页
     ·培养条件第124页
     ·参与碳循环生理类群的细菌数量统计第124-125页
     ·参与氮素循环的各生理类群细菌的种群结构分析第125-126页
   ·结果第126-132页
     ·底泥中参与氮素循环生理类群细菌的数量第126-127页
     ·参与氮素循环的各生理类群细菌的种群结构第127-132页
   ·讨论第132-134页
     ·底泥中氨化细菌的菌群分布及产氨作用第132页
     ·底泥中硝化细菌与反硝化细菌的分布及脱氮作用第132-133页
     ·底泥中反硝化细菌与硝酸盐、亚硝酸盐还原细菌的分布及其作用第133-134页
  参考文献第134-136页
 第九章 底泥细菌代谢含硫化合物产H_2S的特征第136-146页
   ·引言第136-137页
     ·硫素循环在环境物质循环中的作用和地位第136-137页
     ·底泥中含硫化合物的来源、种类及产H_2S的特性第137页
   ·材料与方法第137-139页
     ·样品和菌株第137页
     ·培养基第137-138页
     ·培养条件第138页
     ·代谢含硫化合物产H_2S的细菌数量第138-139页
     ·代谢含硫化合物产H_2S生理类群细菌的种群结构第139页
   ·结果第139-144页
     ·底泥中代谢含硫化合物产H_2S生理类群的细菌数量第139-141页
     ·代谢含硫化合物产H_2S生理类群细菌的种群结构第141-144页
   ·讨论第144-145页
     ·底泥细菌利用有机含硫化合物产H_2S的特征第144页
     ·细菌利用无机含硫化合物产H_2S的特征第144页
     ·硫酸盐还原细菌产H_2S的特征第144-145页
  参考文献第145-146页
 第十章 底泥细菌在磷素循环中的特征第146-155页
   ·引言第146页
     ·环境中磷循环的特征第146页
     ·养殖池底泥中磷素来源和种类第146页
   ·材料与方法第146-148页
     ·样品和菌株第146页
     ·培养基第146-147页
     ·培养条件第147页
     ·参与磷循环生理类群的细菌数量第147-148页
       ·参与磷素循环的各生理类群细菌的种群结构第148页
   ·结果与讨论第148-152页
     ·底泥中参与磷素循环的各生理类群细菌数量第148-149页
     ·参与磷循环各生理类群细菌的种群结构第149-152页
   ·结论第152-154页
  参考文献第154-155页
结论第155-157页
攻读博士学位期间发表文章第157-158页
致谢第158页

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