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新疆库尔勒香梨主要病毒的分子检测研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-17页
1 引言第17-54页
   ·果树病毒危害及特点第17-19页
     ·果树病毒危害第17-18页
     ·果树病毒病的主要特点第18-19页
   ·果树病毒病的研究概况第19-23页
     ·国外研究概况第19-21页
     ·国内研究概况第21-23页
   ·果树病毒病的检测技术第23-47页
     ·果树病毒病的外观症状诊断法第23页
     ·果树病毒病的指示植物检测法第23-24页
     ·果树病毒病的电子显微镜检测法第24页
     ·果树病毒病的血清学检测法第24-25页
     ·分子生物学检测法第25-47页
       ·核酸分子杂交技术第26-32页
         ·核酸杂交技术的优越性第26-27页
         ·核酸探针的来源第27-28页
         ·核酸探针的制备第28页
         ·探针的标记物第28-31页
         ·杂交方法第31页
         ·核酸杂交支持膜第31-32页
         ·影响核酸杂交的因素第32页
       ·多聚酶链式反应(PCR)技术第32-33页
       ·逆转录-聚合链式反应(RT-PCR)第33-36页
       ·双链RNA(dsRNA)技术第36-41页
         ·dsRNA的产生第36-37页
         ·dsRNA检测技术在果树上的应用第37-41页
           ·果树病毒病及病源鉴定第37-38页
           ·病毒分化株系的鉴定第38-39页
           ·以dsRNA为中介对病毒核酸序列进行研究第39-40页
           ·探针的制备和cDNA克隆的获得第40页
           ·用于检测病毒卫星RNA和亚基因组RNA第40-41页
           ·其他用途第41页
       ·其他方法第41-42页
         ·免疫电镜法第41-42页
         ·免疫捕获PCR(IC-PCR)第42页
       ·原位PCR技术第42-47页
         ·原位逆转录PCR的基本原理第43页
         ·原位逆转录PCR的原则和方法第43-45页
           ·样品制备第43-44页
           ·逆转录及PCR反应第44-45页
           ·细胞内PCR产物的检测第45页
         ·对照的设置第45-46页
         ·原位PCR的应用第46-47页
   ·梨树病毒病害的研究第47-52页
     ·梨树病毒病的特点第47-48页
     ·梨环纹花叶病毒与苹果褪绿叶斑病毒及梨脉黄病毒与苹果茎痘病毒之间的关系第48-49页
     ·几种主要梨病毒特征第49-52页
   ·果树病毒病研究的展望第52-54页
2 材料与方法第54-75页
   ·材料第54-55页
     ·供试材料第54页
     ·菌株第54页
     ·质粒第54页
     ·引物第54-55页
     ·试剂及酶类第55页
     ·主要仪器第55页
   ·方法第55-75页
     ·梨组织RNA的提取第55-58页
       ·梨组织中总RNA的提取第55-56页
         ·异硫氰酸胍法第55-56页
         ·TRIzol法第56页
         ·方法M第56页
         ·试剂盒法第56页
       ·梨组织中dsRNA的提取第56-57页
       ·梨组织中总核酸的提取第57-58页
         ·PEX法第57-58页
         ·盐酸胍法第58页
     ·库尔勒香梨病毒的多重RT-PCR检测体系第58-65页
       ·库尔勒香梨病毒的RT-PCR检测体系的优化第58-59页
         ·cDNA合成第58页
         ·PCR扩增第58-59页
         ·RT体系的优化第59页
         ·PCR体系的优化第59页
       ·一步法RT-PCR检测体系第59-60页
       ·库尔勒香梨上ASGV、ACLSV、ASPV的多重RT-PCR检测体系的建立第60-61页
         ·内标体系的建立第60页
         ·多重RT-PCR体系第60-61页
           ·cDNA合成第60页
           ·多重PCR扩增第60-61页
       ·目的片段转化大肠杆菌第61-64页
         ·DNA片段的切胶纯化第61-62页
         ·与载体质粒的连接第62页
         ·氯化钙法转化第62-64页
           ·感受态细胞的制备第62-63页
           ·转化第63页
           ·碱裂解法小量提取质粒第63页
           ·重组克隆的酶切鉴定第63-64页
           ·重组克隆的PCR鉴定第64页
       ·序列测定与分析第64页
         ·DNA序列测定第64页
         ·DNA序列分析第64页
       ·库尔勒香梨病毒的RT-PCR检测试剂盒第64-65页
     ·库尔勒香梨病毒的cDNA探针检测体系第65-67页
       ·库尔勒香梨病毒的cDNA探针检测体系的优化第65-67页
         ·非放射性标记cDNA探针的制备第65页
         ·探针显色灵敏度的检测第65页
         ·RNA点杂交的常规方法第65-66页
         ·库尔勒香梨病毒斑点杂交检测体系的优化第66-67页
           ·斑点杂交检测体系的优化第66-67页
           ·不同杂交膜比较第67页
           ·不同封闭剂对杂交信号检测影响第67页
         ·改进方法第67页
       ·库尔勒香梨病毒的核酸点杂交检测试剂盒第67页
       ·病毒样品的检测第67页
     ·库尔勒香梨病毒的原位PCR检测体系第67-75页
       ·库尔勒香梨叶片病毒的原位PCR检测体系第67-71页
         ·玻片处理第67-68页
         ·石蜡切片制作法第68页
         ·组织预处理第68-69页
         ·反转录反应第69-70页
         ·原位PCR扩增第70页
         ·原位PCR产物的免疫检测第70-71页
         ·对照的设置第71页
         ·果胶酶处理时间第71页
         ·蛋白酶处理时间第71页
         ·退火温度不同处理第71页
         ·有效RT反应体系的建立第71页
         ·扩增中各因素对试验结果影响的研究第71页
       ·库尔勒香梨茎尖病毒的原位PCR检测第71-75页
         ·玻片处理第72页
         ·冷冻切片的制作第72页
         ·组织预处理第72页
         ·一步法RT-PCR反应第72-73页
         ·原位杂交第73页
         ·原位PCR产物的免疫检测第73-74页
         ·对照的设置第74-75页
3 结果与分析第75-118页
   ·梨组织RNA的提取第75-76页
     ·梨组织中总RNA的提取第75-76页
     ·梨组织中dsRNA的提取第76页
     ·梨组织中总核酸的提取第76页
   ·库尔勒香梨病毒的多重RT-PCR检测体系第76-98页
     ·库尔勒香梨病毒的RT-PCR检测体系的优化第76-87页
       ·RT体系的优化第77-82页
       ·PCR体系的优化第82-87页
     ·一步法RT-PCR检测体系第87-88页
     ·库尔勒香梨上ASGV、ACLSV、ASPV的多重RT-PCR检测体系的建立第88-92页
       ·内标体系的建立第88-90页
       ·多重RT-PCR体系第90-92页
     ·RT-PCR产物的转化、筛选和鉴定第92-93页
     ·目的片段的序列分析与比较第93-97页
     ·库尔勒香梨病毒的RT-PCR检测试剂盒第97-98页
       ·试剂组成及配方第97页
       ·操作方法第97-98页
   ·库尔勒香梨病毒的cDNA探针检测体系第98-105页
     ·库尔勒香梨病毒的cDNA探针检测体系的优化第98-103页
       ·非放射性标记cDNA探针的鉴定第98-99页
       ·探针显色灵敏度的检测第99页
       ·RNA点杂交的常规方法第99-100页
       ·库尔勒香梨病毒斑点杂交检测体系的优化第100-103页
         ·斑点杂交检测体系的优化第100-102页
         ·不同杂交膜比较第102-103页
         ·不同封闭剂对杂交信号检测影响第103页
     ·库尔勒香梨病毒的核酸点杂交检测试剂盒第103-105页
       ·杂交试剂盒的组成第103-104页
       ·操作方法第104-105页
     ·病毒样品的检测第105页
   ·库尔勒香梨病毒的原位PCR检测体系第105-118页
     ·库尔勒香梨叶片病毒的原位PCR检测体系第105-114页
       ·不同处理对石蜡切片制作效果的影响第105-106页
       ·不同组织预处理对原位切片效果的影响第106-108页
       ·反转录反应组分浓度对原位PCR效果的影响第108-111页
       ·原位扩增中各因素对PCR效果的影响第111-114页
     ·库尔勒香梨茎尖病毒的原位PCR检测第114-118页
4 讨论第118-128页
   ·梨组织中总RNA、dsRNA及总核酸的提取第118-119页
   ·库尔勒香梨病毒的多重RT-PCR检测体系第119-121页
   ·库尔勒香梨病毒的cDNA探针检测体系第121-123页
   ·香梨病毒检测试剂盒的研制第123-124页
   ·库尔勒香梨病毒的原位PCR检测体系第124-128页
     ·固定剂的选用与固定时间的确定第124页
     ·切片的防脱第124页
     ·反应中蒸发的防止第124-125页
     ·蛋白酶消化时间的确定第125页
     ·地高辛标记核苷酸的使用第125-126页
     ·原位PCR的反应体系各组分对结果的影响第126页
     ·循环次数第126页
     ·标本的洗涤第126-127页
     ·原位PCR检测梨病毒的敏感性与特异性第127-128页
5 结论第128-130页
   ·梨组织RNA、dsRNA、总核酸的提取第128页
   ·库尔勒香梨病毒的多重RT-PCR检测体系第128页
   ·库尔勒香梨病毒的cDNA探针检测体系第128页
   ·库尔勒香梨病毒分子检测试剂盒第128-129页
   ·库尔勒香梨病毒的原位PCR检测体系第129-130页
参考文献第130-143页
致谢第143-144页
附录1: 缩写词和英汉对照第144-146页
附录2: 本研究使用的主要试剂与溶液的配制第146-150页
附录3: 攻读博士期间已发表的主要论文和著作第150-151页
附录4: 测序原始图谱第151-155页

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