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细胞内铜离子螯合蛋白质数据库的构建及数据分析

中文摘要第1-8页
英文摘要第8-10页
第一章 问题的引出第10-16页
   ·神经退行性疾病与药物设计第10-13页
     ·自由基氧化胁迫第10-11页
     ·蛋白质的错误折叠、聚集第11-12页
     ·药物设计第12-13页
   ·铜离子与神经退行性疾病第13-14页
   ·构建铜离子螯合蛋白质数据库的意义第14-16页
第二章 生物信息学基础第16-23页
   ·基因组测序与核酸序列数据库第17-18页
   ·蛋白质测序与氨基酸序列数据库、蛋白质结构数据库第18-19页
   ·生物序列分析第19-23页
     ·序列比对简介第19页
     ·核酸序列的分析方法第19-20页
     ·蛋白质二级结构预测第20-22页
     ·蛋白质三维结构的预测第22-23页
第三章 计算机科学在本论文中的应用第23-25页
   ·MySQL(结构化查询语言)第23页
   ·HTML(超文本标注语言)第23-24页
   ·PHP(超文本预处理器)第24页
   ·APACHE(Web服务器)第24-25页
第四章 细胞内铜离子的转运体系第25-30页
   ·铜离子的摄取(uptake)第25-26页
     ·高亲和力的铜离子转运体系第25-26页
       ·CTR1(Copper transporter 1)第25页
       ·CTR3(Copper transporter 3)第25-26页
     ·低亲和力的铜离子转运体系第26页
   ·Cu~+在细胞内的运输第26-29页
     ·ATX1、HAH1与CCC2第26-27页
     ·COX17、hCOX17与SCO1第27-28页
     ·LYS7、CCS与SOD第28-29页
   ·细胞内Cu~+的其它转运方式第29页
   ·存在的问题第29-30页
第五章 DCCP数据库的构建第30-33页
   ·数据的收集第30-31页
     ·三级结构数据的搜集第30页
     ·一级序列数据的搜集第30-31页
   ·数据的整理第31页
   ·可用信息的提取第31页
   ·数据库信息输入第31-32页
   ·前台界面的编写及其与后台数据库的连接第32页
   ·数据库的对外服务第32页
   ·数据库的更新第32-33页
第六章 数据分析第33-41页
   ·蛋白质分类第33-34页
   ·不同性质氨基酸含量分析第34-38页
     ·疏水氨基酸和亲水氨基酸含量分析第34-35页
     ·蛋白质疏水性(Hydrophobicity)的变化第35-37页
     ·形成β折叠的倾向性分析第37-38页
   ·蛋白质的二级结构预测结果及其评价第38-39页
     ·方法第38页
     ·结果处理第38-39页
     ·二级结构预测结果及讨论第39页
   ·铜离子螯合蛋白的进化的一点讨论第39-41页
第七章 结论第41-42页
参考文献第42-49页
在学期间发表的学术论文目录第49-50页
致谢第50页

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