中文摘要 | 第1-12页 |
英文摘要 | 第12-15页 |
第一章 文献综述 | 第15-30页 |
1 卤虫Artemia franciscana | 第15-20页 |
1.1 生物学特性 | 第15-16页 |
1.2 卤虫的开发及应用 | 第16-18页 |
1.2.1 作为水产养殖动物的饵料 | 第16-17页 |
1.2.2 作为药物的载体 | 第17页 |
1.2.3 其它应用 | 第17-18页 |
1.3 卤虫的研究现状 | 第18-20页 |
1.3.1 国内的研究现状 | 第18页 |
1.3.2 国外的研究进展 | 第18-20页 |
2 表达序列标签及其生物学应用 | 第20-26页 |
2.1 表达序列标签(EST) | 第20-21页 |
2.2 EST计划的过去与现状 | 第21页 |
2.3 EST的局限性 | 第21-22页 |
2.3.1 不准确性 | 第22页 |
2.3.2 不完整性 | 第22页 |
2.3.3 偏好性 | 第22页 |
2.4 EST的生物学应用 | 第22-25页 |
2.4.1 EST和新基因鉴定 | 第22-23页 |
2.4.2 EST和基因组物理图谱构建 | 第23-24页 |
2.4.3 基因组DNA中基因的预测 | 第24页 |
2.4.4 EST与序列多态性 | 第24页 |
2.4.5 EST与基因表达水平的定量 | 第24-25页 |
2.5 将来的展望 | 第25-26页 |
3 胁迫蛋白 | 第26-29页 |
3.1 小型热激/α-晶体蛋白与p26 | 第26-27页 |
3.1.1 小型热激/α-晶体蛋白的分子性状 | 第26-27页 |
3.1.2 小型热激/α-晶体蛋白的功能 | 第27页 |
3.1.3 p26的分子性状及功能 | 第27页 |
3.2 Hsp70 | 第27-28页 |
3.2.1 Hsp70的分子性状 | 第27-28页 |
3.2.2 Hsp70的功能 | 第28页 |
3.3 Artemin和铁蛋白 | 第28-29页 |
3.3.1 Artemin | 第28页 |
3.3.2 铁蛋白 | 第28-29页 |
4 研究目标 | 第29-30页 |
第二章 旧金山湾卤虫(Artemia franciscana)表达序列标签数据库的初步建立 | 第30-62页 |
1 材料与方法 | 第30-41页 |
1.1 材料 | 第30-31页 |
1.1.1 旧金山湾卤虫(Artemia franciscana)休眠卵 | 第30页 |
1.1.2 分子生物学试剂 | 第30页 |
1.1.3 其它试剂及材料 | 第30-31页 |
1.1.4 引物 | 第31页 |
1.2 方法 | 第31-41页 |
1.2.1 卤虫二期幼虫的收集 | 第31页 |
1.2.2 卤虫二期幼虫总RNA的提取 | 第31-32页 |
1.2.3 mRNA的纯化和检测 | 第32页 |
1.2.4 cDNA的合成 | 第32-37页 |
1.2.5 库容量测定 | 第37页 |
1.2.6 cDNA文库的大规模在体切除 | 第37-38页 |
1.2.7 单克隆分离 | 第38页 |
1.2.8 cDNA片段长度的测定 | 第38页 |
1.2.9 DNA测序 | 第38-39页 |
1.2.10 序列加工及分析 | 第39页 |
1.2.11 cDNA克隆的削减 | 第39-41页 |
2 实验结果与分析 | 第41-57页 |
2.1 卤虫卵的培养与收集 | 第41页 |
2.2 总RNA的提取 | 第41-42页 |
2.3 mRNA的分离纯化 | 第42页 |
2.4 cDNA合成及文库的包装 | 第42-43页 |
2.5 cDNA文库容量的测定 | 第43页 |
2.6 cDNA片段长度的测定及筛选 | 第43-44页 |
2.7 初步测序 | 第44-45页 |
2.8 EST结果统计分析 | 第45-47页 |
2.9 EST功能的分类 | 第47-55页 |
2.10 密码子使用频率和GC含量 | 第55页 |
2.11 卤虫EST的3’-UTR序列分析 | 第55-57页 |
3 讨论 | 第57-62页 |
3.1 cDNA文库的构建 | 第57-61页 |
3.1.1 cDNA合成 | 第57-59页 |
3.1.2 Uni-ZAP XR载体 | 第59页 |
3.1.3 受体菌 | 第59页 |
3.1.4 在体切除 | 第59-61页 |
3.2 cDNA文库的削减 | 第61页 |
3.3 EST数据库 | 第61-62页 |
第三章 Artemin和铁蛋白cDNA的克隆及其分子特性 | 第62-80页 |
1 材料与方法 | 第62-66页 |
1.1 材料 | 第62-63页 |
1.1.1 卤虫休眠卵与二期幼虫cDNA文库 | 第62页 |
1.1.2 分子生物学试剂 | 第62页 |
1.1.3 其它试剂与材料 | 第62页 |
1.1.4 引物 | 第62-63页 |
1.2 方法 | 第63-66页 |
1.2.1 Artemin和铁蛋白cDNA的克隆和测序 | 第63页 |
1.2.2 Artemin和铁蛋白的cDNA与蛋白质的结构特点 | 第63页 |
1.2.3 系统进化比较 | 第63-64页 |
1.2.4 Northern分析 | 第64-65页 |
1.2.5 Artemin基因内元的确定 | 第65-66页 |
2 结果与分析 | 第66-77页 |
2.1 Artemin和铁蛋白cDNA的测序结果及分析 | 第66-69页 |
2.1.1 Artemin | 第66-68页 |
2.1.2 铁蛋白 | 第68-69页 |
2.2 Artemin与铁蛋白的结构比较 | 第69-72页 |
2.3 系统进化比较 | 第72-74页 |
2.4 卤虫artemin与铁蛋白mRNA在发育过程中的调控 | 第74-76页 |
2.5 Artemin基因内元的确定 | 第76-77页 |
3 讨论 | 第77-80页 |
3.1 Artemin和铁蛋白的分子特性 | 第77页 |
3.2 Artemin和铁蛋白基因在不同发育阶段表达的调控 | 第77-78页 |
3.3 Artemin和铁蛋白的功能 | 第78-80页 |
3.3.1 Artemin | 第78页 |
3.3.2 铁蛋白 | 第78-80页 |
第四章 基因组步行法扩增artemin基因上游调控序列 | 第80-89页 |
1 材料与方法 | 第80-84页 |
1.1 材料 | 第80页 |
1.1.1 卤虫休眠卵 | 第80页 |
1.1.2 分子生物学试剂 | 第80页 |
1.1.3 酶 | 第80页 |
1.1.4 其他试剂 | 第80页 |
1.1.5 引物 | 第80页 |
1.2 方法 | 第80-84页 |
1.2.1 卤虫基因组DNA的提取 | 第80-81页 |
1.2.2 接头与引物设计 | 第81页 |
1.2.3 无载体连接的Genome Walker DNA文库的构建 | 第81-82页 |
1.2.4 TD-PCR | 第82-83页 |
1.2.5 扩增片段的回收与测序 | 第83-84页 |
2 结果与分析 | 第84-87页 |
2.1 TD-PCR | 第84-85页 |
2.2 序列分析 | 第85-87页 |
3 讨论 | 第87-89页 |
3.1 基因组步行技术 | 第87-88页 |
3.2 上游调控序列 | 第88-89页 |
结论 | 第89-91页 |
参考文献 | 第91-108页 |
附录 | 第108-127页 |
1 英文缩写词表 | 第108-110页 |
2 各种缓冲液和培养基的配制方法 | 第110-112页 |
3 测序图谱 | 第112-124页 |
1.1 Artemin | 第112-118页 |
1.2 铁蛋白 | 第118-122页 |
1.3 Artemin上游调控序列 | 第122-124页 |
3 GenBank接受序列 | 第124-127页 |
致谢 | 第127-128页 |
作者简历 | 第128-129页 |
博士在读期间的学术成果 | 第129-130页 |