条件随机场在基因剪接位点预测中的应用研究
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 1 绪论 | 第10-20页 |
| ·课题研究的背景和意义 | 第10-11页 |
| ·课题的国内外研究现状 | 第11-16页 |
| ·剪接位点预测的方法 | 第11-14页 |
| ·影响剪接位点预测的因素 | 第14-16页 |
| ·课题的主要关注点和挑战 | 第16-17页 |
| ·课题的主要研究内容及组织结构 | 第17-20页 |
| 2 基因剪接位点及其基本理论 | 第20-30页 |
| ·基因的概念 | 第20页 |
| ·基因的结构 | 第20-22页 |
| ·基因预测与基因剪接位点预测简介 | 第22-25页 |
| ·原核生物中的基因预测 | 第22-23页 |
| ·真核生物中的基因预测 | 第23页 |
| ·真核生物基因剪接位点预测 | 第23-24页 |
| ·几种重要的基因预测工具 | 第24-25页 |
| ·基因剪接位点的公开数据 | 第25-26页 |
| ·基因剪接位点预测的评价指标 | 第26-28页 |
| ·本章小结 | 第28-30页 |
| 3 基于有向概率图模型的剪接位点预测方法 | 第30-48页 |
| ·有向图模型 | 第30-31页 |
| ·基于贝叶斯网络模型的剪接位点预测研究 | 第31-39页 |
| ·贝叶斯网络模型简介 | 第31-33页 |
| ·贝叶斯网络模型的应用 | 第33-35页 |
| ·实验结果与分析 | 第35-39页 |
| ·基于隐马尔科夫模型的剪接位点预测研究 | 第39-46页 |
| ·隐马尔科夫模型的原理 | 第39-40页 |
| ·隐马尔科夫模型的应用 | 第40-41页 |
| ·实验结果与分析 | 第41-46页 |
| ·本章小结 | 第46-48页 |
| 4 基于条件随机场模型的剪接位点预测研究 | 第48-72页 |
| ·无向图模型 | 第48-49页 |
| ·无向图条件随机场模型的理论 | 第49-54页 |
| ·条件随机场定义 | 第49-51页 |
| ·条件随机场模型的训练和求解 | 第51-54页 |
| ·条件随机场模型在基因剪接位点预测中的应用 | 第54-61页 |
| ·基于条件随机场的剪接位点建模 | 第54-57页 |
| ·模型设计与算法步骤 | 第57-60页 |
| ·实验结果与分析 | 第60-61页 |
| ·改进的条件随机场模型的应用 | 第61-66页 |
| ·模型在解决问题时存在的不足 | 第61页 |
| ·改进的参数估计算法 | 第61-62页 |
| ·实验结果与分析 | 第62-66页 |
| ·对不同剪接位点预测模型预测水平的比较分析 | 第66-70页 |
| ·本章小结 | 第70-72页 |
| 5 总结与展望 | 第72-74页 |
| ·总结 | 第72-73页 |
| ·展望 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-78页 |
| 攻读硕士学位期间所发表的学术论文 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80页 |
