| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 目录 | 第9-14页 |
| 前言 | 第14-15页 |
| 1 林木分子数量遗传学研究进展 | 第15-34页 |
| ·经典数量遗传学研究 | 第15-16页 |
| ·分子数量遗传学研究 | 第16-17页 |
| ·林木遗传连锁作图 | 第17-21页 |
| ·杨树遗传图谱 | 第17-18页 |
| ·桉树遗传图谱 | 第18-19页 |
| ·松树遗传图谱 | 第19-20页 |
| ·其他树种遗传图谱 | 第20-21页 |
| ·功能标记和功能图谱 | 第21-22页 |
| ·遗传连锁图谱的应用 | 第22-30页 |
| ·数量性状位点(QTL)研究 | 第22-27页 |
| ·数量性状位点研究概述 | 第22-24页 |
| ·木本植物QTL研究进展 | 第24-27页 |
| ·比较基因组学研究 | 第27-28页 |
| ·全基因组测序中的作用 | 第28-29页 |
| ·分子标记辅助育种和早期选择 | 第29-30页 |
| ·分离数量性状基因 | 第30-32页 |
| ·林木数量性状研究的发展方向 | 第32页 |
| ·本研究的目的意义和技术路线 | 第32-34页 |
| 2 毛白杨转录组图谱构建的准备 | 第34-46页 |
| ·引言 | 第34页 |
| ·构建转录组图谱试验材料的选择 | 第34-36页 |
| ·材料与方法 | 第34页 |
| ·取材方法 | 第34页 |
| ·RNA提取 | 第34页 |
| ·结果与分析 | 第34-36页 |
| ·利用毛白杨回交群体未成熟木质部构建转录图谱可行性分析 | 第36-45页 |
| ·材料与方法 | 第36-41页 |
| ·实验材料 | 第36-37页 |
| ·模板合成 | 第37页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第37-39页 |
| ·cDNA-AFLP分析 | 第39-41页 |
| ·引物选择 | 第41页 |
| ·亲本间多态性分析 | 第41页 |
| ·结果与分析 | 第41-45页 |
| ·RNA提取和cDNA合成 | 第41-42页 |
| ·引物选择 | 第42页 |
| ·亲本多态性标记统计结果 | 第42-43页 |
| ·cDNA-AFLP和转录组图谱 | 第43-45页 |
| ·小结 | 第45-46页 |
| 3 利用cDNA-AFLP技术构建毛白杨未成熟木质部转录组图谱 | 第46-65页 |
| ·引言 | 第46-47页 |
| ·材料与方法 | 第47-51页 |
| ·作图群体 | 第47页 |
| ·取材方法 | 第47页 |
| ·模板制备 | 第47-48页 |
| ·DNA提取 | 第47-48页 |
| ·RNA提取 | 第48页 |
| ·ds-cDNA的合成 | 第48页 |
| ·SSR标记分析 | 第48-49页 |
| ·DNA检测及模版制备 | 第48页 |
| ·引物合成 | 第48页 |
| ·SSR标记扩增 | 第48-49页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第49页 |
| ·cDNA-AFLP分析 | 第49页 |
| ·基因型分析和数据统计 | 第49-50页 |
| ·连锁图谱的绘制 | 第50页 |
| ·估算基因组长度和图谱覆盖程度 | 第50页 |
| ·估算基因组内转录区杂合水平 | 第50页 |
| ·群体内回交子代个体遗传杂合度估算 | 第50-51页 |
| ·结果与分析 | 第51-64页 |
| ·SSR标记在群体中的分离 | 第51-53页 |
| ·SSRs扩增效率 | 第51页 |
| ·SSRs在毛白杨回交群体中的分离 | 第51-53页 |
| ·cDNA-AFLP标记多态性水平分析 | 第53-56页 |
| ·毛新杨和毛白杨转录组图谱的构建 | 第56-59页 |
| ·各连锁群上标记分布 | 第59-61页 |
| ·基因组长度和图谱覆盖程度分析 | 第61-62页 |
| ·基因组转录区遗传杂合水平分析 | 第62-63页 |
| ·个体杂合度 | 第63-64页 |
| ·小结 | 第64-65页 |
| 4 毛白杨幼化群体(根萌苗)转录组图谱构建 | 第65-74页 |
| ·引言 | 第65页 |
| ·材料与方法 | 第65-66页 |
| ·毛新杨×毛白杨的幼化群体(根萌苗)的构建 | 第65-66页 |
| ·模板制备 | 第66页 |
| ·cDNA-AFLP分析 | 第66页 |
| ·作图标记统计分析 | 第66页 |
| ·遗传连锁分析 | 第66页 |
| ·结果与分析 | 第66-73页 |
| ·毛新杨×毛白杨幼化群体的建立 | 第66-67页 |
| ·标记多态性分析 | 第67页 |
| ·根萌苗转录组图谱 | 第67-72页 |
| ·转录组图谱的特点分析 | 第72-73页 |
| ·小结 | 第73-74页 |
| 5 毛白杨及毛新杨转录组图谱的整合 | 第74-92页 |
| ·引言 | 第74页 |
| ·材料与方法 | 第74页 |
| ·结果与分析 | 第74-91页 |
| ·整合图谱 | 第74-76页 |
| ·三组转录组图谱的比较 | 第76-91页 |
| ·小结 | 第91-92页 |
| 6 作图群体表型性状调查及统计分析 | 第92-113页 |
| ·引言 | 第92页 |
| ·材料与方法 | 第92-93页 |
| ·作图群体 | 第92页 |
| ·表型测量 | 第92-93页 |
| ·生长性状 | 第92页 |
| ·生理性状 | 第92-93页 |
| ·木材性状 | 第93页 |
| ·性别性状 | 第93页 |
| ·数据处理与分析 | 第93页 |
| ·杂种优势分析 | 第93页 |
| ·结果与分析 | 第93-112页 |
| ·群体生长、生理、材性等性状统计描述和遗传分析 | 第93-105页 |
| ·各性状相关分析 | 第105-108页 |
| ·七年生群体生理生长相关分析 | 第105-106页 |
| ·七年生群体生长与木材品质性状相关分析 | 第106-107页 |
| ·一年生群体生理生长相关分析 | 第107页 |
| ·不同年龄群体间生理生长相关分析 | 第107-108页 |
| ·雌雄个体间表型性状遗传分析 | 第108-111页 |
| ·计算雌雄个体间各表型性状的平均值和标准差 | 第108-110页 |
| ·检验判断雌雄株间各表型性状差异程度 | 第110-111页 |
| ·杂种优势分析 | 第111-112页 |
| ·小结 | 第112-113页 |
| 7 毛新杨×毛白杨回交群体若干数量性状QTLs分析 | 第113-158页 |
| ·引言 | 第113页 |
| ·材料与方法 | 第113-114页 |
| ·作图群体 | 第113-114页 |
| ·遗传连锁图谱的构建 | 第114页 |
| ·QTL分析 | 第114页 |
| ·单标记作图法 | 第114页 |
| ·区间作图法 | 第114页 |
| ·结果与分析 | 第114-157页 |
| ·利用未成熟木质部转录组图谱进行数量性状QTL分析 | 第114-144页 |
| ·单标记作图 | 第114-128页 |
| ·区间作图 | 第128-144页 |
| ·利用根萌苗转录组图谱进行数量性状QTL分析 | 第144-157页 |
| ·单标记作图 | 第144-147页 |
| ·区间作图 | 第147-157页 |
| ·小结 | 第157-158页 |
| 8 重要性状QTLs的基因组分析 | 第158-184页 |
| ·引言 | 第158页 |
| ·材料与方法 | 第158-159页 |
| ·重要数量性状的QTLs | 第158页 |
| ·QTL区间标记回收、克隆及测序 | 第158-159页 |
| ·序列比对与功能分析 | 第159页 |
| ·结果与分析 | 第159-183页 |
| ·整合图谱QTLs分析 | 第159-172页 |
| ·QTLs筛选和区间标记测序结果分析 | 第172-183页 |
| ·小结 | 第183-184页 |
| 9 基于基因芯片的候选基因筛选 | 第184-217页 |
| ·引言 | 第184页 |
| ·材料与方法 | 第184-187页 |
| ·芯片数据 | 第184-186页 |
| ·芯片数据的预处理 | 第186-187页 |
| ·芯片质量控制 | 第186页 |
| ·芯片归一化 | 第186-187页 |
| ·利用共表达预测功能相似基因 | 第187页 |
| ·结果与分析 | 第187-215页 |
| ·芯片质量分析 | 第187-188页 |
| ·芯片归一化处理 | 第188-192页 |
| ·共表达模型预测功能相似基因 | 第192-214页 |
| ·模型检验 | 第192-194页 |
| ·利用共表达模型预测纤维素和木质素合成途径中其他相关基因 | 第194-208页 |
| ·利用共表达模型筛选QTLs候选基因 | 第208-214页 |
| ·对分离林木复杂数量性状QTLs内主效基因的探讨 | 第214-215页 |
| ·小结 | 第215-217页 |
| 10 结论与讨论 | 第217-221页 |
| ·主要结论 | 第217-218页 |
| ·毛白杨转录组图谱构建 | 第217页 |
| ·重要性状的QTL定位研究 | 第217页 |
| ·共表达模型的建立及OTL内候选基因的筛选 | 第217-218页 |
| ·讨论 | 第218-220页 |
| ·木本植物转录组图谱构建 | 第218-219页 |
| ·基于转录组图谱的QTL定位分析 | 第219页 |
| ·基因共表达及图位克隆 | 第219-220页 |
| ·展望 | 第220-221页 |
| 参考文献 | 第221-229页 |
| 个人简介 | 第229-230页 |
| 导师简介 | 第230-231页 |
| 致谢 | 第231页 |
