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白令海北部浮游细菌及表层沉积物细菌的系统发育多样性分析

摘要第1-12页
Abstract第12-14页
1 前言第14-27页
   ·海洋微生物及其多样性第14-16页
     ·海洋微生物及其生态功能第14-15页
     ·海洋微生物的多样性及其研究意义第15-16页
   ·海洋细菌多样性的分析方法第16-22页
     ·传统分离培养方法第16页
     ·现代分子生态学方法第16-22页
   ·白令海细菌多样性研究第22-25页
     ·白令海概况第22-23页
     ·白令海及其它极地海域的细菌多样性研究进展第23-25页
   ·本论文的研究思路和意义第25-27页
2 材料与方法第27-45页
   ·材料第27-36页
     ·采样点概况与样品采集第27-31页
     ·菌株和质粒第31页
     ·滤膜第31页
     ·主要试剂第31页
     ·工具酶第31页
     ·引物第31-32页
     ·主要仪器第32页
     ·培养基第32-33页
     ·溶液配制第33-35页
     ·分析软件第35-36页
   ·基本方法第36-45页
     ·白令海北部底、表层水体浮游细菌的群落结构与多样性分析第36-43页
       ·样品的采集与前处理第36页
       ·水样细菌基因组总DNA的提取第36-37页
       ·16S rDNA片段的PCR扩增第37-38页
       ·16SrDNA-V3区的PCR扩增第38页
       ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)及细菌多样性分析第38-43页
     ·沉积物细菌的群落结构与多样性分析第43-45页
       ·沉积物细菌基因组总DNA的提取第43页
       ·16S rDNA片段的PCR扩增第43页
       ·16S rDNA-V3区的PCR扩增第43页
       ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)及细菌多样性分析第43页
       ·细菌16S rDNA文库的构建第43-45页
3 结果与分析第45-82页
   ·白令海北部底、表层水体浮游细菌的多样性研究第45-56页
     ·底、表层浮游细菌基因组总DNA的提取第45页
     ·底、表层浮游细菌16S rDNA片段的PCR扩增第45-46页
     ·基于DGGE图谱的底、表层浮游细菌多样性的比较分析第46-52页
     ·底、表层浮游细菌优势种群的分子鉴定与系统发育分析第52-56页
   ·白令海北部表层沉积物细菌的多样性研究第56-82页
     ·表层沉积物细菌基因组总DNA的提取第56页
     ·表层沉积物细菌16S rDNA片段的PCR扩增第56-57页
     ·基于DGGE图谱的表层沉积物细菌多样性分析第57-66页
     ·基于16S rDNA文库的表层沉积物细菌多样性分析第66-82页
4 讨论第82-92页
   ·白令海北部底、表层水体浮游细菌的多样性分析第82-85页
     ·底、表层水体浮游细菌的系统发育多样性分析第82-84页
     ·底、表层水体浮游细菌的优势菌群分析第84-85页
   ·白令海北部表层沉积物细菌的多样性分析第85-88页
     ·沉积物细菌的系统发育多样性分析第85-86页
     ·沉积物细菌的优势类群分析第86-88页
   ·关于分子生物学技术在本次研究应用过程中的若干问题第88-92页
     ·剪膜法与洗膜法对DNA提取效果的影响第88-89页
     ·直接PCR与巢式PCR对DGGE的影响第89-90页
     ·采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术与16S rDNA克隆文库对细菌多样性研究结果的比较第90-92页
5 结论与展望第92-95页
参考文献第95-104页
附录第104-107页
 附录一:攻硕期间参与的课题第104页
 附录二:载体图谱第104-105页
 附录三:DNA分子量标准第105-106页
 附录四:缩略语对照表第106页
 附录五:发表的文章及获奖情况第106-107页
致谢第107-108页

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