| 缩略语表 | 第1-7页 |
| 中文摘要 | 第7-10页 |
| 英文摘要 | 第10-14页 |
| 前言 | 第14-17页 |
| 文献回顾 | 第17-37页 |
| 正文 | 第37-75页 |
| 1 基因集分析方法统计理论探讨 | 第37-47页 |
| ·原假设的建立 | 第37-40页 |
| ·构建合理统计量 | 第40-42页 |
| ·估计统计量理论分布 | 第42-46页 |
| ·关于基因集方法统计理论的讨论 | 第46-47页 |
| 2 基因集分析方法模拟比较 | 第47-68页 |
| ·数据格式与分析方法 | 第48-52页 |
| ·初步探索不同基因集方法诊断DEGs 的效能 | 第52-57页 |
| ·各基因集方法排查非显著性基因集的能力 | 第57-59页 |
| ·模拟数据中纳入基因间相关性时各基因集方法的比较 | 第59-66页 |
| ·讨论 | 第66-68页 |
| 3 实例分析比较 | 第68-75页 |
| ·急性白血病分类研究 | 第68-72页 |
| ·Ⅱ型糖尿病分子通路特征研究 | 第72-73页 |
| ·讨论 | 第73-75页 |
| 小结 | 第75-77页 |
| 附录 | 第77-87页 |
| 附录1 急性白血病基因表达谱各基因集方法分析结果 | 第77-82页 |
| 附录2 Ⅱ型糖尿病分子通路特征分析结果 | 第82-87页 |
| 参考文献 | 第87-94页 |
| 个人简历和发表论文 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95页 |