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类风湿关节炎患者HLA-Ⅱ类基因SNP的初步研究

中文摘要第1-6页
ABSTRACT第6-9页
前言第9-15页
第一章 类风湿关节炎的SNP背景研究进展(综述)第15-31页
 1.SNP研究现状第15-23页
     ·SNP的概念第15-16页
     ·SNP的特点第16页
     ·SNP研究价值和应用第16-18页
       ·SNP与疾病病因研究第16-17页
       ·SNP与药物基因组学第17-18页
       ·SNP与人类进化史研究第18页
     ·SNP的应用第18-19页
     ·SNP研究的新型技术手段第19-22页
       ·微阵列杂交实验(microarray技术)第20页
       ·Taqman技术第20-21页
     ·分子灯塔(molecular beacons)第21页
       ·测序第21-22页
     ·SNP研究中存在的问题第22页
     ·SNP应用前景第22-23页
 2.类风湿关节炎的基因背景研究现状第23-30页
     ·类风湿性关节炎基因背景与HLA基因系统第23-25页
     ·类风湿性关节炎研究热点基因相关SNP研究现状第25-30页
 3.展望第30-31页
第二章 应用生物信息学的方法对HLA-DRB1区域编码区SNP位点的分析第31-45页
 1.生物信息学简介第31-32页
 2.生物信息学的方法分析HLA-DRB1基因第32-35页
     ·HLA-DRB1基因编码区SNP的搜集第32-33页
       ·从dbSNP数据库和SNPPER数据库收集SNP第32页
       ·使用SNPper软件收集HLA-DRB1基因的cSNE第32-33页
     ·HLA-DRB1基因同源模型的获得第33页
     ·HLA-DRB1基因cSNP的分析第33页
     ·候选cSNP位点在dbMHC数据库的初步印证第33-34页
     ·候选SNP位点其他相关信息的收集和综合分析第34页
     ·候选SNP位点信息的收集和比较分析结果第34-35页
 3.结果第35-40页
     ·SNPPER数据库HLA-DRB1基因cSNP的获取结果第35-37页
     ·HLA-DRB1基因同源模型的搜寻结果第37页
     ·HLA-DRB1基因cSNP的分析结果第37-40页
       ·使用PARSESNP软件分析的cSNP的结果第37-38页
       ·dbSNP数据库获得的SNP结果第38-40页
       ·综合分析第40页
 4.讨论第40-43页
     ·SNP与复杂疾病的联系第40-42页
     ·SNP与复杂性状疾病易感基因关联分析的策略第42页
     ·SNP位点的搜寻第42-43页
 5.小结第43-45页
第三章 类风湿关节炎患者HLA-Ⅱ类基因SNP的初步研究第45-55页
 1.资料与试剂第46页
     ·研究对象第46页
     ·仪器第46页
     ·试剂第46页
       ·提取DNA试剂第46页
       ·PCR试剂第46页
 2.方法第46-48页
     ·SNP位点序列特异性引物的设计第46-47页
     ·酚—氯仿法提取全血DNA第47-48页
     ·PCR-SSP检测第48页
     ·统计学分析第48页
 3.结果第48-52页
   ·DNA提取结果第48页
   ·HLA-DRB1和DQB的SNP的检测第48-49页
   ·类风湿关节炎患者HLA-DRB1和DQB SNP分析第49-52页
 4.总结和讨论第52-55页
参考文献第55-60页
附录:英文缩写索引第60-61页
攻读硕士期间发表的论文第61-62页
致谢第62页

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