| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 符号与缩略语说明 | 第11-12页 |
| 前言 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-37页 |
| 1 微生物碳素循环研究进展 | 第13-15页 |
| ·固定CO_2的微生物 | 第13-14页 |
| ·微生物固定CO2的途径 | 第14-15页 |
| 2 Rubisco基因研究进展 | 第15-18页 |
| ·Rubisco的分布与定位 | 第15页 |
| ·Rubisco基因类型 | 第15-17页 |
| ·RubisCO基因的多样性研究进展 | 第17-18页 |
| 3 产甲烷菌研究进展 | 第18-24页 |
| ·产甲烷菌的研究历史及分类 | 第18-20页 |
| ·产甲烷菌的生态环境 | 第20-24页 |
| 4 土壤微生物多样性及其研究方法进展 | 第24-29页 |
| ·土壤微生物多样性 | 第24-25页 |
| ·土壤微生物多样性研究方法进展 | 第25-29页 |
| 参考文献 | 第29-37页 |
| 第二章 江西鹰潭红壤与南京黄棕壤微生物群落多样性的DGGE分析 | 第37-53页 |
| 1 材料及方法 | 第37-42页 |
| ·研究区域概况 | 第37-38页 |
| ·样品的采集,编号及处理 | 第38页 |
| ·实验试剂 | 第38页 |
| ·土壤理化性质的测定及微生物计数 | 第38-39页 |
| ·土壤总DNA的提取与纯化 | 第39-40页 |
| ·土壤16S rDNA V3区扩增与纯化 | 第40-41页 |
| ·16S rDNA V3区的DGGE分析 | 第41页 |
| ·DGGE指纹图谱分析 | 第41页 |
| ·群落结构多样性评价指数的计算方法 | 第41-42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-48页 |
| ·土壤理化性质 | 第42-43页 |
| ·四种土样的三大菌群的计数结果 | 第43页 |
| ·土壤总DNA的提取 | 第43-44页 |
| ·土壤16S rDNA V3区扩增与纯化 | 第44页 |
| ·DGGE指纹图谱分析四种土壤的微生物群落结构 | 第44-46页 |
| ·DGGE群落相似性及微生物多样性聚类分析 | 第46-47页 |
| ·通过DGGE图谱对于土壤微生物的多样性指数分析 | 第47-48页 |
| 3 讨论 | 第48页 |
| 4 结论 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-53页 |
| 第三章 江西鹰潭红壤与南京黄棕壤中Rubisco基因多样性研究 | 第53-69页 |
| 1 材料及方法 | 第53-59页 |
| ·实验试剂 | 第53-54页 |
| ·样品的采集及保存 | 第54页 |
| ·土壤总DNA的提取与纯化 | 第54页 |
| ·cbbL基因与cbbM基因的扩增与纯化 | 第54-55页 |
| ·大肠杆菌高效感受态的制备 | 第55-56页 |
| ·PCR产物的TA克隆 | 第56页 |
| ·酶连产物的转化 | 第56页 |
| ·土壤cbbL基因文库的构建、检查及保存 | 第56-57页 |
| ·文库克隆的酶切分析 | 第57-58页 |
| ·文库的统计分析 | 第58-59页 |
| ·序列测定和系统进化树构建 | 第59页 |
| 2 结果与分析 | 第59-66页 |
| ·cbbL基因与cbbM基因的扩增 | 第59-60页 |
| ·cbbL基因克隆子插入片段的扩增 | 第60-61页 |
| ·cbbL基因文库酶切类型的统计分析 | 第61-62页 |
| ·四种cbbL基因文库的库容分析 | 第62-63页 |
| ·四种cbbL基因文库的多样性指数分析 | 第63-64页 |
| ·四种cbbL基因文库的群落结构相似性分析 | 第64页 |
| ·cbbL基因文库测序分析和系统发育树构建 | 第64-66页 |
| 3 讨论 | 第66-67页 |
| 4 结论 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-69页 |
| 第四章 江西鹰潭红壤与江苏南京黄棕壤产甲烷菌多样性研究 | 第69-81页 |
| 1. 材料及方法 | 第69-74页 |
| ·实验试剂 | 第69页 |
| ·样品的采集、保存及理化性质 | 第69页 |
| ·土壤总DNA的提取与纯化 | 第69-70页 |
| ·产甲烷菌Mcra基因片段扩增、纯化 | 第70页 |
| ·大肠杆菌高效感受态的制备 | 第70-71页 |
| ·PCR产物的TA克隆 | 第71页 |
| ·酶连产物的转化 | 第71页 |
| ·土壤Mcra基因文库的构建、检查及保存 | 第71页 |
| ·文库克隆的酶切分析 | 第71-73页 |
| ·文库的统计分析 | 第73页 |
| ·序列测定和系统进化树构建 | 第73-74页 |
| 2 结果与分析 | 第74-79页 |
| ·mcrA基因的扩增与纯化 | 第74页 |
| ·mcrA基因文库克隆插入片段的扩增 | 第74-75页 |
| ·mcrA基因文库酶切类型的统计分析 | 第75-76页 |
| ·mcrA基因文库库容分析 | 第76页 |
| ·mcrA基因文库多样性指数分析 | 第76-77页 |
| ·mcrA基因文库相似性分析 | 第77页 |
| ·mcrA基因文库测序分析及系统发育树的构建 | 第77-79页 |
| 3 结论 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-81页 |
| 全文总结 | 第81-83页 |
| 创新之处 | 第83-85页 |
| 附录 文中所用的培养基和试剂配方 | 第85-89页 |
| 致谢 | 第89页 |
