| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第14-33页 |
| 1.1 低温胁迫对水稻的影响 | 第14-22页 |
| 1.1.1 低温胁迫的类型 | 第14-15页 |
| 1.1.2 低温胁迫对水稻生理代谢的影响 | 第15-17页 |
| 1.1.3 水稻对低温胁迫的应答反应 | 第17-20页 |
| 1.1.4 水稻低温胁迫的评价与鉴定方法 | 第20-22页 |
| 1.2 水稻耐冷相关QTL和基因的研究进展 | 第22-29页 |
| 1.2.1 水稻耐冷相关QTL的鉴定和定位 | 第22-24页 |
| 1.2.2 水稻耐冷相关基因的克隆 | 第24-29页 |
| 1.3 全基因组关联分析在水稻研究中的应用 | 第29-31页 |
| 1.3.1 全基因组关联分析 | 第29-30页 |
| 1.3.2 全基因组关联分析的应用 | 第30-31页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第31-33页 |
| 第二章 水稻苗期耐冷性状的全基因组关联分析 | 第33-40页 |
| 2.1 试验材料与方法 | 第33-34页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第33页 |
| 2.1.2 表型鉴定 | 第33-34页 |
| 2.1.3 SNP基因型 | 第34页 |
| 2.1.4 群体亲缘关系评估 | 第34页 |
| 2.1.5 连锁不平衡分析 | 第34页 |
| 2.1.6 全基因组关联分析 | 第34页 |
| 2.2 结果与分析 | 第34-38页 |
| 2.2.1 表型变异 | 第34-35页 |
| 2.2.2 SNP密度分布 | 第35页 |
| 2.2.3 亲缘关系评估 | 第35-38页 |
| 2.2.4 苗期耐冷性与SNP标记的全基因组关联分析 | 第38页 |
| 2.3 讨论 | 第38-40页 |
| 2.3.1 苗期耐冷性的鉴定 | 第38页 |
| 2.3.2 SNP分布及群体结构对关联分析的影响 | 第38-39页 |
| 2.3.3 表型与标记的全基因组关联分析 | 第39页 |
| 2.3.4 全基因组关联分析的问题与展望 | 第39-40页 |
| 第三章 QCT11 的精细定位与应用 | 第40-60页 |
| 3.1 试验材料与方法 | 第40-46页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第40页 |
| 3.1.2 性状调查 | 第40页 |
| 3.1.3 数据统计分析 | 第40页 |
| 3.1.4 常规实验方法 | 第40-44页 |
| 3.1.5 qCT11的精细定位 | 第44页 |
| 3.1.6 近等基因系的转录组测序分析 | 第44页 |
| 3.1.7 表达量分析 | 第44-45页 |
| 3.1.8 载体的构建 | 第45-46页 |
| 3.1.9 qCT11的应用 | 第46页 |
| 3.2 结果与分析 | 第46-56页 |
| 3.2.1 QTL分析验证GWAS结果 | 第46-48页 |
| 3.2.2 qCT11的精细定位 | 第48-49页 |
| 3.2.3 候选基因的预测与分析 | 第49-52页 |
| 3.2.4 近等基因系的转录组分析 | 第52-54页 |
| 3.2.5 含有qCT11的不育系苗期耐冷性评价 | 第54-56页 |
| 3.3 讨论 | 第56-60页 |
| 3.3.1 QTL与GWAS的联合分析 | 第56-57页 |
| 3.3.2 qCT11候选基因的分析 | 第57页 |
| 3.3.3 qCT11的转录调控分析 | 第57-58页 |
| 3.3.4 qCT11提高不育系苗期耐冷性 | 第58-60页 |
| 第四章 全文结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-74页 |
| 附录 | 第74-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 作者简历 | 第83页 |