| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 1 引言 | 第9-17页 |
| 1.1 淋巴囊肿病毒的研究现状 | 第9-12页 |
| 1.1.1 淋巴囊肿病的流行病学 | 第9-10页 |
| 1.1.2 淋巴囊肿病毒在细胞内的增殖 | 第10-11页 |
| 1.1.3 淋巴囊肿病毒的传播途径 | 第11页 |
| 1.1.4 淋巴囊肿病毒基因组学 | 第11页 |
| 1.1.5 牙鲆抗淋巴囊肿病的免疫基因研究进展 | 第11-12页 |
| 1.2 转录组学的研究 | 第12-17页 |
| 1.2.1 转录组的测序技术 | 第12-14页 |
| 1.2.2 转录组测序技术的优缺点 | 第14-15页 |
| 1.2.3 基于转录组测序的牙鲆免疫相关基因的研究进展 | 第15-17页 |
| 2 牙鲆抗淋巴囊肿转录组重分析 | 第17-38页 |
| 2.1 材料及方法 | 第17-21页 |
| 2.1.1 主要仪器及试剂 | 第17页 |
| 2.1.2 实验鱼的制备及样品处理 | 第17-18页 |
| 2.1.3 RNA的提取与鉴定 | 第18页 |
| 2.1.4 cDNA文库的构建及测序 | 第18-20页 |
| 2.1.5 对测序结果进行生物信息学分析 | 第20-21页 |
| 2.2 结果与分析 | 第21-33页 |
| 2.2.1 测序的原始数据质控及mapping比率 | 第21-22页 |
| 2.2.2 RNA-seq整体质量评估 | 第22-24页 |
| 2.2.3 基因差异表达分析和表达模式聚类 | 第24-27页 |
| 2.2.4 差异基因注释及富集分析 | 第27-33页 |
| 2.3 讨论 | 第33-38页 |
| 3 三个抗病基因的克隆 | 第38-64页 |
| 3.1 材料及方法 | 第38-47页 |
| 3.1.1 主要仪器及试剂 | 第38页 |
| 3.1.2 试验鱼的制备及样品处理 | 第38页 |
| 3.1.3 RNA的提取与鉴定 | 第38页 |
| 3.1.4 总RNA的逆转录 | 第38页 |
| 3.1.5 引物设计 | 第38-39页 |
| 3.1.6 RACE(Rapid Amplification cDNA Ends)实验 | 第39-47页 |
| 3.1.7 牙鲆基因的序列分析 | 第47页 |
| 3.2 结果与分析 | 第47-61页 |
| 3.2.1 总RNA提取的质量检测 | 第47页 |
| 3.2.2 基因克隆与序列分析 | 第47-59页 |
| 3.2.3 系统进化树的构建 | 第59-61页 |
| 3.3 讨论 | 第61-64页 |
| 4 三个抗病功能基因的表达 | 第64-71页 |
| 4.1 材料及方法 | 第64-66页 |
| 4.1.1 主要仪器及试剂 | 第64页 |
| 4.1.2 实验鱼的制备及样品处理 | 第64页 |
| 4.1.3 RNA的提取与鉴定 | 第64页 |
| 4.1.4 总RNA的逆转录 | 第64-65页 |
| 4.1.5 引物设计 | 第65页 |
| 4.1.6 荧光定量qRT-PCR | 第65-66页 |
| 4.1.7 定量数据分析 | 第66页 |
| 4.2 结果与分析 | 第66-68页 |
| 4.2.1 总RNA质量检测 | 第66页 |
| 4.2.2 qRT-PCR的结果 | 第66-68页 |
| 4.3 讨论 | 第68-71页 |
| 5 结论 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-80页 |
| 硕士期间发表论文 | 第80-81页 |
| 作者简介 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
