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利用CRISPR-Cas9介导的定点诱变方法构建Cas9温敏突变体

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
主要缩略词第16-17页
第1章 绪论第17-27页
    1.1 CRISPR-Cas的发现第17页
    1.2 CRISPR基本结构第17-18页
    1.3 CRISPR-Cas系统分类第18-19页
        1.3.1 Ⅰ型CRISPR系统第19页
        1.3.2 Ⅱ型CRISPR系统第19页
        1.3.3 Ⅲ型CRISPR系统第19页
    1.4 作用原理第19-22页
        1.4.1 Cas蛋白家族和功能模块第20页
        1.4.2 Cas9作用机制第20-22页
            1.4.2.1 Cas9适应性免疫机制第20-21页
            1.4.2.2 Cas9靶向切割机制第21-22页
    1.5 基因编辑技术第22-24页
        1.5.1 编程酶概况第22-23页
        1.5.2 编程酶发展第23-24页
        1.5.3 基因编辑的作用与意义第24页
    1.6 温敏突变第24-25页
        1.6.1 传统构建方法第24-25页
        1.6.2 位点预测方法第25页
    1.7 本研究的目的与意义第25-27页
第2章 材料与方法第27-41页
    2.1 材料第27-30页
        2.1.1 菌株第27页
        2.1.2 质粒第27页
        2.1.3 培养基第27-28页
        2.1.4 试剂药品第28页
            2.1.4.1 试剂第28页
            2.1.4.2 酶第28页
            2.1.4.3 试剂盒第28页
        2.1.5 仪器及相关设备第28页
        2.1.6 实验室主要溶液及配制方法第28-30页
            2.1.6.1 碱裂解法提取质粒所用溶液的配制第28-29页
            2.1.6.2 琼脂糖凝胶电泳所用试剂的配制第29页
            2.1.6.3 SDS-PAGE电泳缓冲液配制第29页
            2.1.6.4 Cas9相关缓冲液配制第29-30页
            2.1.6.5 其他溶液的配制第30页
    2.2 方法第30-41页
        2.2.1 PCR反应体系第30-31页
        2.2.2 琼脂糖凝胶电泳回收纯化DNA片段第31页
        2.2.3 T5核酸外切酶介导的无酶克隆第31页
        2.2.4 大肠杆菌转化方法及质粒抽提操作第31页
        2.2.5 Cas9酶的表达单元的构建第31-33页
        2.2.7 Cas9基因在大肠杆菌中摇瓶诱导表达第33页
        2.2.8 Cas9蛋白的纯化第33-34页
        2.2.9 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测蛋白质第34-35页
        2.2.10 Bradford法测定蛋白质浓度第35页
        2.2.11 RNA的体外转录第35-36页
            2.2.11.1 体外转录RNA的原理第35页
            2.2.11.2 体外转录RNA的操作步骤第35-36页
        2.2.12 Cas9酶切体系第36页
        2.2.13 Cas9可突变位点预测第36-39页
            2.2.13.1 TSpred输入界面第36-37页
            2.2.13.2 TSpred预测策略及疏水性预测第37-38页
            2.2.13.3 预测包埋在内的氨基酸残基第38页
            2.2.13.4 预测标准第38-39页
        2.2.14 Cas9突变体的构建方法第39-41页
第3章 结果与分析第41-58页
    3.1 Cas9酶基因的表达单元的构建第41-42页
    3.2 Cas9酶在大肠杆菌中的摇瓶诱导表达、纯化、鉴定及蛋白浓度检测第42-45页
        3.2.1 Cas9酶在大肠杆菌中的摇瓶诱导表达第42-43页
        3.2.2 SDS-PAGE分析Cas9酶的表达及纯化情况第43-44页
        3.2.3 Cas9酶蛋白的浓度测定第44-45页
    3.3 Cas9可突变位点预测结果第45-46页
    3.4 RNA的体外转录第46页
    3.5 单条sgRNA引导Cas9酶对靶质粒的单位点酶切第46-47页
    3.6 两条sgRNA引导Cas9酶对靶质粒的双位点酶切第47-49页
    3.7 Cas9突变体的表达第49页
    3.8 野生Cas9热稳定性验证第49-50页
    3.9 Cas9突变体热稳定性探究第50-56页
    3.10 酶切效果的比较第56-58页
第4章 讨论与展望第58-60页
    4.1 讨论第58页
    4.2 展望第58-60页
参考文献第60-65页
致谢第65页

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