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全基因组外显子测序筛查青少年特发性脊柱侧凸可疑致病基因ADAMTS9

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
1 前言第13-16页
    1.1 青少年特发性脊柱侧凸的流行病学及病因遗传学第13-14页
    1.2 研究背景与研究目的第14-15页
    1.3 本课题研究思路第15-16页
        1.3.1 WES筛查及数据分析定位致病基因第15页
        1.3.2 致病基因靶向测序第15页
        1.3.3 利用荧光定量RT-PCR检测致病基因mRNA的表达水平第15-16页
2 实验材料与方法第16-49页
    2.1 研究对象第16-21页
        2.1.1 全基因组外显子测序研究对象第16-18页
        2.1.2 靶向测序研究对象第18-20页
        2.1.3 正常对照第20页
        2.1.4 ADAMTS9 mRNA表达研究对象第20-21页
    2.2 研究试剂第21-23页
        2.2.1 DNA提取试剂第21-22页
        2.2.2 PCR试剂第22页
        2.2.3 电泳试剂第22页
        2.2.4 全基因组外显子测序试剂第22页
        2.2.5 PCR产物纯化及测序试剂第22页
        2.2.6 外周血B淋巴细胞建系试剂第22-23页
        2.2.7 RNA提取试剂第23页
        2.2.8 Real-time RT-PCR试剂第23页
    2.3 研究仪器第23-26页
        2.3.1 DNA提取仪器第23页
        2.3.2 测OD值仪器第23页
        2.3.3 全基因组外显子测序仪器及器材第23-24页
        2.3.4 PCR扩增仪第24页
        2.3.5 电泳仪器第24页
        2.3.6 PCR产物纯化仪器第24-25页
        2.3.7 上机测序及序列分析第25页
        2.3.8 外周血B淋巴细胞建系及培养的仪器第25页
        2.3.9 ADAMTS9 mRNA表达研究使用仪器第25-26页
    2.4 电子数据库及软件第26-27页
    2.5 实验方法第27-48页
        2.5.1 样本资料的收集第27页
        2.5.2 全血标本的采集第27页
        2.5.3 外周血DNA的提取第27-28页
        2.5.4 外周血DNA的溶解第28页
        2.5.5 外周血DNA浓度及含量的测定第28页
        2.5.6 全基因组外显子测序第28-37页
        2.5.7 PCR扩增及测序第37-44页
        2.5.8 利用MEGA6.0绘制氨基酸保守性位图第44页
        2.5.9 ADAMTS9 mRNA表达研究实验方法第44-48页
    2.6 统计学分析第48-49页
3 实验结果第49-64页
    3.1 全基因组外显子测序第49-58页
        3.1.1 全基因组外显子测序数据产出结果第49-50页
        3.1.2 全基因组外显子测序致病突变筛选结果第50-58页
    3.2 致病基因靶向验证结果第58-61页
    3.3 已报告突变位点验证结果第61页
    3.4 致病基因正常对照验证结果第61-62页
    3.5 验证结果统计分析第62页
    3.6 ADAMTS9 mRNA表达研究结果第62-64页
4 讨论第64-69页
5 结论第69-70页
参考文献第70-74页
综述第74-93页
    参考文献第83-93页
攻读学位期间的科研成果第93-94页
致谢第94-95页
基金项目第95页

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