东北虎胎盘cDNA文库构建及其ESTs序列分析
摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
1 绪论 | 第9-16页 |
1.1 种质资源保存的重要意义 | 第9-10页 |
1.1.1 东北虎资源的现状与保护 | 第9-10页 |
1.2 cDNA文库概述 | 第10-13页 |
1.2.1 cDNA文库的构建技术 | 第10-11页 |
1.2.2 cDNA文库载体的构建 | 第11-12页 |
1.2.3 cDNA文库的质量鉴定 | 第12页 |
1.2.4 cDNA文库的应用 | 第12-13页 |
1.3 EST分析方法 | 第13-14页 |
1.3.1 EST功能注释 | 第14页 |
1.3.2 EST功能分类 | 第14页 |
1.3.3 EST研究进展 | 第14页 |
1.3.4 EST网上提交 | 第14页 |
1.4 与发育相关的基因概述 | 第14-15页 |
1.5 研究内容与技术路线 | 第15-16页 |
1.5.1 研究内容 | 第15页 |
1.5.2 技术路线 | 第15-16页 |
2 东北虎胎盘组织cDNA文库的构建 | 第16-32页 |
2.1 实验材料 | 第16-17页 |
2.1.1 实验动物 | 第16页 |
2.1.2 主要仪器设备 | 第16页 |
2.1.3 主要试剂 | 第16页 |
2.1.4 主要溶液配制 | 第16-17页 |
2.2 实验方法 | 第17-25页 |
2.2.1 东北虎胎盘组织RNA的提取 | 第18页 |
2.2.2 cDNA的合成 | 第18-25页 |
2.3 结果 | 第25-28页 |
2.3.1 总RNA的提取 | 第25-26页 |
2.3.2 cDNA文库的构建 | 第26-27页 |
2.3.3 cDNA文库质量检测 | 第27-28页 |
2.4 讨论 | 第28-32页 |
2.4.1 RNA的提取 | 第28-29页 |
2.4.2 第一链的合成与LD-PCR扩增 | 第29-30页 |
2.4.3 cDNA的分级处理 | 第30页 |
2.4.4 载体的优势 | 第30-31页 |
2.4.5 文库的质量 | 第31-32页 |
3 基因序列分析 | 第32-46页 |
3.1 实验材料 | 第32页 |
3.2 实验方法 | 第32-33页 |
3.3 实验结果 | 第33页 |
3.3.1 ESTs测序与分析 | 第33页 |
3.3.2 ESTs的长度及分布 | 第33页 |
3.4 ESTs的功能注释 | 第33-34页 |
3.4.1 BLAST检索结果 | 第33-34页 |
3.5 InterPro检索结果 | 第34-38页 |
3.6 ESTs的功能分类与代谢途径分析 | 第38-42页 |
3.6.1 ESTs GO分类检索结果 | 第38-39页 |
3.6.2 KEGG代谢途径检索结果 | 第39页 |
3.6.3 胎盘发育相关基因 | 第39-42页 |
3.7 EST的注册 | 第42-44页 |
3.8 讨论 | 第44-46页 |
3.8.1 关于EST的常见问题 | 第44页 |
3.8.2 ESTs与基因预测 | 第44页 |
3.8.3 数据库检索策略 | 第44-45页 |
3.8.4 查询方法 | 第45页 |
3.8.5 基础检索 | 第45页 |
3.8.6 代谢途径分析 | 第45-46页 |
结论 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-51页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第51-52页 |
致谢 | 第52-53页 |