| 缩略词 | 第4-7页 |
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第11-26页 |
| 1.1 国内外研究进展 | 第11-24页 |
| 1.1.1 植物连作障碍 | 第11-18页 |
| 1.1.1.1 连作障碍产生的背景 | 第11页 |
| 1.1.1.2 连作障碍的危害 | 第11-12页 |
| 1.1.1.3 连作障碍产生的原因 | 第12-18页 |
| 1.1.2 土壤微生物 | 第18-24页 |
| 1.1.2.1 土壤微生物的多样性与重要性 | 第18-19页 |
| 1.1.2.2 土壤微生物的影响因素 | 第19-21页 |
| 1.1.2.3 土壤微生物的研究方法 | 第21-24页 |
| 1.2 本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 1.3 本研究的研究目标及拟解决的关键问题 | 第25页 |
| 1.3.1 本研究的主要研究目标 | 第25页 |
| 1.3.2 本研究拟解决的关键问题 | 第25页 |
| 1.4 本研究的技术路线 | 第25-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-32页 |
| 2.1 取样地点概况 | 第26-27页 |
| 2.2 取样方法 | 第27页 |
| 2.3 研究方法 | 第27-31页 |
| 2.3.1 土壤细菌 16S rDNA 测序 | 第27-31页 |
| 2.3.1.1 土壤微生物基因组 DNA 的提取 | 第27-29页 |
| 2.3.1.2 NanoDrop2000 微量紫外可见分光光度计检测各样品总 DNA 质量 | 第29页 |
| 2.3.1.3 土壤细菌 16S rDNA PCR 扩增 | 第29-30页 |
| 2.3.1.4 Roche Genome Sequencer FLX Titanium 上机测序 | 第30页 |
| 2.3.1.5 数据分析 | 第30-31页 |
| 2.4 主要实验仪器及辅助软件 | 第31-32页 |
| 2.4.1 主要实验仪器 | 第31-32页 |
| 2.4.2 主要辅助软件 | 第32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-40页 |
| 3.1 土壤微生物总 DNA 提取和扩增结果 | 第32-34页 |
| 3.1.1 各样品土壤微生物总 DNA 提取结果 | 第32-33页 |
| 3.1.2 各样品土壤细菌 16S rDNA PCR 扩增结果 | 第33-34页 |
| 3.2 基于 16S rDNA 测序的土壤细菌多样性分析 | 第34-40页 |
| 3.2.1 454 测序结果及取样深度验证 | 第34-35页 |
| 3.2.2 基于 OTU 的α多样性指数分析 | 第35页 |
| 3.2.3 基于分类地位的群落特征分析 | 第35-40页 |
| 3.2.3.1 杨树根际土壤和非根际土壤细菌类群分析 | 第35-38页 |
| 3.2.3.2 土壤细菌群落多样性随连作代数的变化 | 第38-40页 |
| 4 讨论 | 第40-43页 |
| 5 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 在读期间发表论文 | 第58页 |
