缩略词表 | 第5-11页 |
中文摘要 | 第11-14页 |
英文摘要 | 第14-16页 |
前言 | 第17-19页 |
一、材料 | 第19-21页 |
1、细胞培养 | 第19页 |
2、主要试剂 | 第19-20页 |
3、主要仪器 | 第20-21页 |
二、方法 | 第21-40页 |
1、实时荧光定量 PCR | 第21-24页 |
2、构建干扰人 GRM4 基因的慢病毒载体 | 第24-28页 |
3、慢病毒包装 | 第28-30页 |
4、稳定转染细胞株的构建 | 第30-31页 |
5、Western blot 检测蛋白表达量 | 第31-34页 |
6、检测 RNA 样品 | 第34-35页 |
7、c DNA 文库的制备和测序 | 第35-36页 |
8、测序数据的处理 | 第36-39页 |
9、差异表达基因的检测 | 第39页 |
10、GO 富集分析和 KEGG 通路富集分析 | 第39-40页 |
11、转录因子的预测和蛋白相互作用网络的构建 | 第40页 |
12、蛋白互作网络中基因的 GO 和 KEGG pathway 分析 | 第40页 |
13、统计学分析 | 第40页 |
三、结果 | 第40-50页 |
1、筛选 GRM4 m RNA 最高表达的骨肉瘤细胞株 | 第40-41页 |
2、筛选沉默效率最佳的 si RNA 序列 | 第41-42页 |
3、慢病毒介导的 GRM4-si RNA 显著抑制 U2OS 细胞 GRM4 的表达 | 第42-43页 |
4、全转录组测序数据的描述和差异表达基因分析 | 第43-46页 |
5、差异表达基因的 GO 富集分析 | 第46-47页 |
6、差异表达基因的 KEGG 通路富集分析 | 第47-48页 |
7、预测参与 GRM4 调控的转录因子及构建下游蛋白互作网络 | 第48页 |
8、整合关系网络中的基因功能富集分析 | 第48-50页 |
四、讨论 | 第50-54页 |
五、结语 | 第54-56页 |
参考文献 | 第56-66页 |
附录 | 第66-97页 |
综述 | 第97-113页 |
参考文献 | 第107-113页 |
致谢 | 第113-114页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第114-115页 |