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基于RNA干扰和RNA-seq技术探讨GRM4基因在人骨肉瘤细胞中的作用机制

缩略词表第5-11页
中文摘要第11-14页
英文摘要第14-16页
前言第17-19页
一、材料第19-21页
    1、细胞培养第19页
    2、主要试剂第19-20页
    3、主要仪器第20-21页
二、方法第21-40页
    1、实时荧光定量 PCR第21-24页
    2、构建干扰人 GRM4 基因的慢病毒载体第24-28页
    3、慢病毒包装第28-30页
    4、稳定转染细胞株的构建第30-31页
    5、Western blot 检测蛋白表达量第31-34页
    6、检测 RNA 样品第34-35页
    7、c DNA 文库的制备和测序第35-36页
    8、测序数据的处理第36-39页
    9、差异表达基因的检测第39页
    10、GO 富集分析和 KEGG 通路富集分析第39-40页
    11、转录因子的预测和蛋白相互作用网络的构建第40页
    12、蛋白互作网络中基因的 GO 和 KEGG pathway 分析第40页
    13、统计学分析第40页
三、结果第40-50页
    1、筛选 GRM4 m RNA 最高表达的骨肉瘤细胞株第40-41页
    2、筛选沉默效率最佳的 si RNA 序列第41-42页
    3、慢病毒介导的 GRM4-si RNA 显著抑制 U2OS 细胞 GRM4 的表达第42-43页
    4、全转录组测序数据的描述和差异表达基因分析第43-46页
    5、差异表达基因的 GO 富集分析第46-47页
    6、差异表达基因的 KEGG 通路富集分析第47-48页
    7、预测参与 GRM4 调控的转录因子及构建下游蛋白互作网络第48页
    8、整合关系网络中的基因功能富集分析第48-50页
四、讨论第50-54页
五、结语第54-56页
参考文献第56-66页
附录第66-97页
综述第97-113页
    参考文献第107-113页
致谢第113-114页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第114-115页

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