模体识别问题的优化遗传算法研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·背景 | 第7-8页 |
| ·研究现状 | 第8-9页 |
| ·问题描述 | 第9-10页 |
| ·本文主要工作 | 第10-13页 |
| 第二章 模体识别算法综述 | 第13-19页 |
| ·术语 | 第13-16页 |
| ·调控元件 | 第13页 |
| ·模体模型 | 第13-15页 |
| ·打分函数 | 第15-16页 |
| ·模体识别算法 | 第16-18页 |
| ·de novo模体识别算法 | 第17页 |
| ·结合高通量实验数据的模体识别算法 | 第17-18页 |
| ·系统发育足迹分析法 | 第18页 |
| ·本章小结 | 第18-19页 |
| 第三章 基于遗传的模体识别算法研究 | 第19-29页 |
| ·算法描述 | 第19-20页 |
| ·模体的表示方式 | 第20-22页 |
| ·编码和初始群体的生成 | 第22页 |
| ·编码 | 第22页 |
| ·初始群体的生成 | 第22页 |
| ·模体的适应度评价方法 | 第22-24页 |
| ·背景 | 第22-23页 |
| ·导出过程 | 第23-24页 |
| ·模体识别过程中的遗传操作 | 第24-26页 |
| ·突变操作 | 第24-25页 |
| ·交叉操作 | 第25页 |
| ·选择操作 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-29页 |
| 第四章 遗传算法的优化 | 第29-41页 |
| ·基于随机投影的初始群体 | 第29-35页 |
| ·随机投影策略 | 第29-30页 |
| ·桶的生成 | 第30-31页 |
| ·桶的存储 | 第31-33页 |
| ·哈希表的大小 | 第33-34页 |
| ·基于合格桶的位置权重矩阵 | 第34页 |
| ·投影部分与基本遗传部分的接口 | 第34-35页 |
| ·局部优化 | 第35-37页 |
| ·局部过滤 | 第35-36页 |
| ·移位操作 | 第36-37页 |
| ·算法的整体结构与分析 | 第37-39页 |
| ·本章小结 | 第39-41页 |
| 第五章 实验结果比较与分析 | 第41-51页 |
| ·参数 | 第41-43页 |
| ·遗传算法参数设置 | 第41-42页 |
| ·投影算法参数设置 | 第42-43页 |
| ·在模拟数据上的实验结果与分析 | 第43-45页 |
| ·在真实生物数据上的实验结果 | 第45-48页 |
| ·本章小结 | 第48-51页 |
| 第六章 总结与展望 | 第51-53页 |
| 致谢 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-58页 |
