| 论文摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 一、引言 | 第11-19页 |
| 1.1 禽流感的概述 | 第11-12页 |
| 1.1.1 禽流感的历史、发生与分布 | 第11页 |
| 1.1.2 禽流感的宿主范围 | 第11-12页 |
| 1.1.3 禽流感的危害 | 第12页 |
| 1.2 禽流感病毒的生物学特性 | 第12-14页 |
| 1.2.1 禽流感病毒的结构组成 | 第12-13页 |
| 1.2.2 血凝素(Hemmagglutinin,HA)蛋白 | 第13页 |
| 1.2.3 神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)蛋白 | 第13页 |
| 1.2.4 聚合酶(Ploymerase,PA、PB1、PB2)蛋白 | 第13-14页 |
| 1.2.5 核(Nucleoprotein,NP)蛋白 | 第14页 |
| 1.2.6 基质(Matrix Protein,M)蛋白 | 第14页 |
| 1.2.7 非结构(Nonstructural Protein,NS)蛋白 | 第14页 |
| 1.3 野生鸟类禽流感的国内外研究进展 | 第14-16页 |
| 1.3.1 野生鸟类禽流感流行病学研究 | 第15页 |
| 1.3.2 禽流感病毒遗传进化分析 | 第15-16页 |
| 1.4 本研究的背景与目标 | 第16-17页 |
| 1.5 研究内容 | 第17-18页 |
| 1.6 研究技术路线 | 第18-19页 |
| 二、材料与方法 | 第19-37页 |
| 2.1 实验材料 | 第19-24页 |
| 2.1.1 实验耗材 | 第19-20页 |
| 2.1.2 试剂盒与试剂 | 第20-22页 |
| 2.1.3 实验器具与设备 | 第22-24页 |
| 2.2 实验的分析软件 | 第24页 |
| 2.3 实验方法 | 第24-37页 |
| 2.3.1 样本的来源与采集 | 第24-25页 |
| 2.3.2 禽流感病毒检测 | 第25-29页 |
| 2.3.3 病毒基因核酸序列的扩增 | 第29-33页 |
| 2.3.4 禽流感病毒血清抗体检测 | 第33-35页 |
| 2.3.5 序列的分析与遗传进化树的构建 | 第35-37页 |
| 三、结果 | 第37-64页 |
| 3.1 上海野生鸟类禽流感感染与携带状况 | 第37-47页 |
| 3.1.1 禽流感样本采集 | 第37-43页 |
| 3.1.2 禽流感病毒M基因检测结果与病毒亚型鉴定 | 第43-44页 |
| 3.1.3 禽流感病毒血清抗体检测结果 | 第44页 |
| 3.1.4 上海地区野生鸟类禽流感感染状况与趋势分析 | 第44-47页 |
| 3.2 上海野生鸟类禽流感病毒基质蛋白(M)基因的遗传进化分析 | 第47-61页 |
| 3.2.1 基质蛋白(M)基因的进化树构建 | 第47-53页 |
| 3.2.2 M1蛋白与M2蛋白的氨基酸序列分析 | 第53-60页 |
| 3.2.3 病毒M基因选择压力的分析 | 第60-61页 |
| 3.3 上海野生鸟类禽流感病毒血凝素蛋白(H9)基因的遗传进化分析 | 第61-64页 |
| 3.3.1 血凝素蛋白(H9)基因的进化树构建 | 第61-62页 |
| 3.3.2 H9亚型共感染(多重感染)的相关性分析 | 第62-64页 |
| 四、讨论 | 第64-69页 |
| 4.1 上海野生鸟类禽流感感染与传播趋势的分析 | 第64-66页 |
| 4.1.1 越冬水鸟是上海地区野生鸟类禽流感病毒携带与传播的主要媒介 | 第64页 |
| 4.1.2 本地区禽流感传播风险与防控对策 | 第64-66页 |
| 4.2. 禽流感病毒基因的遗传进化分析 | 第66-69页 |
| 4.2.1 基质蛋白(M)基因的遗传进化分析 | 第66-67页 |
| 4.2.2 鸭源H9亚型的同亚型共感染(多重感染)与类早期人类流感M基因之间的关系 | 第67-69页 |
| 五、结论 | 第69-71页 |
| 附录 | 第71-82页 |
| 附录1 本研究中所使用引物汇总 | 第71-72页 |
| 附录2 H5型流感病毒HA抗体检测试剂盒(酶联免疫法)使用说明书 | 第72-73页 |
| 附录3 禽流感病毒M基因遗传进化树(完整) | 第73-78页 |
| 附录4 无样本H9进化树 | 第78-79页 |
| 附录5 工作照 | 第79-82页 |
| 参考文献 | 第82-90页 |
| 在读期间发表论文 | 第90-91页 |
| 后记 | 第91页 |
