| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-19页 |
| 1.1 课题背景与意义 | 第10-11页 |
| 1.2 研究现状及分析 | 第11-17页 |
| 1.2.1 生物医学命名实体识别 | 第12-15页 |
| 1.2.2 生物医学关系抽取 | 第15-17页 |
| 1.3 本文的研究内容及章节安排 | 第17-19页 |
| 第2章 生物医学命名实体识别 | 第19-34页 |
| 2.1 引言 | 第19页 |
| 2.2 基于 Sequence Memoizer 的命名实体识别 | 第19-28页 |
| 2.2.1 任务定义 | 第19-20页 |
| 2.2.2 Sequence Memoizer 模型简介 | 第20-22页 |
| 2.2.3 基于 Sequence Memoizer 的产生式模型 | 第22-25页 |
| 2.2.4 实验设计与分析 | 第25-28页 |
| 2.3 基于最大熵模型的命名实体识别 | 第28-32页 |
| 2.3.1 CALBC 任务介绍 | 第29-30页 |
| 2.3.2 实验设计及结果 | 第30-32页 |
| 2.4 本章小结 | 第32-34页 |
| 第3章 自动规则学习的蛋白质相互作用关系抽取 | 第34-46页 |
| 3.1 引言 | 第34页 |
| 3.2 蛋白质相互作用关系抽取任务定义 | 第34页 |
| 3.3 自动规则学习的蛋白质相互作用关系抽取方法 | 第34-40页 |
| 3.3.1 依存句法分析介绍 | 第35页 |
| 3.3.2 规则的获取 | 第35-37页 |
| 3.3.3 规则的泛化 | 第37-38页 |
| 3.3.4 规则的匹配 | 第38-39页 |
| 3.3.5 规则的过滤 | 第39-40页 |
| 3.4 自动规则学习的蛋白质相互作用关系抽取实验 | 第40-45页 |
| 3.4.1 实验数据 | 第40-41页 |
| 3.4.2 实验方案设计 | 第41-42页 |
| 3.4.3 实验结果及分析 | 第42-45页 |
| 3.5 本章小结 | 第45-46页 |
| 第4章 基于广义期望准则的蛋白质相互作用关系抽取 | 第46-55页 |
| 4.1 引言 | 第46页 |
| 4.2 广义期望准则 | 第46-49页 |
| 4.2.1 概念介绍 | 第47-48页 |
| 4.2.2 广义期望准则与最大熵模型 | 第48-49页 |
| 4.3 基于广义期望准则的蛋白质相互作用关系抽取实验 | 第49-53页 |
| 4.3.1 实验数据 | 第49页 |
| 4.3.2 实验方案设计 | 第49-52页 |
| 4.3.3 实验结果及分析 | 第52-53页 |
| 4.4 本章小结 | 第53-55页 |
| 第5章 基于 MEDLINE 的生物医学文献检索系统 | 第55-60页 |
| 5.1 引言 | 第55页 |
| 5.2 相关平台简介 | 第55-57页 |
| 5.3 InsunBioSearch 系统 | 第57-58页 |
| 5.3.1 系统主要功能 | 第57页 |
| 5.3.2 系统实现细节 | 第57-58页 |
| 5.4 本章小结 | 第58-60页 |
| 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-66页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第66-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
