| 英文缩写 | 第5-6页 |
| 中文摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 前言 | 第9-13页 |
| 1.1 叶酸及同型半胱氨酸代谢的研究概况及进展 | 第9-10页 |
| 1.2 人类基因组的多态性及单核苷酸多态性 | 第10页 |
| 1.2.1 人类基因组的多态性 | 第10页 |
| 1.2.2 单核苷酸多态性 | 第10页 |
| 1.3 复杂疾病及其研究方法概述 | 第10-13页 |
| 1.3.1 复杂疾病的概念 | 第10-11页 |
| 1.3.2 复杂疾病的研究策略 | 第11-13页 |
| 1.3.2.1 连锁不平衡的概念 | 第11页 |
| 1.3.2.2 单倍型与国际人类基因组单倍型计划 | 第11页 |
| 1.3.2.3 多位点联合分析 | 第11-12页 |
| 1.3.2.4 SVM | 第12-13页 |
| 第2章：实验部分 | 第13-25页 |
| 2.1 研究对象 | 第13页 |
| 2.2 清叶酸的测定 | 第13-14页 |
| 2.2.1 主要仪器 | 第13页 |
| 2.2.2 试剂 | 第13-14页 |
| 2.3 血清同型半胱氨酸的测定 | 第14-15页 |
| 2.3.1 主要仪器 | 第14页 |
| 2.3.2 主要试剂 | 第14页 |
| 2.3.3 实验步骤 | 第14-15页 |
| 2.4 SNP分型 | 第15-22页 |
| 2.4.1 SNPs的选择 | 第15-16页 |
| 2.4.2 主要试剂 | 第16-17页 |
| 2.4.3 主要仪器 | 第17页 |
| 2.4.4 实验步骤 | 第17-22页 |
| 2.4.4.1 血样采集、DNA提取、DNA浓度的测定 | 第17-19页 |
| 2.4.4.2 Mass ARRAY检测SNP分型 | 第19-22页 |
| 2.4.4.2.1 引物设计 | 第19-20页 |
| 2.4.4.2.2 多重PCR | 第20-21页 |
| 2.4.4.2.3 SAP反应 | 第21页 |
| 2.4.4.2.4 i-PLEX单碱基延伸 | 第21-22页 |
| 2.4.4.2.5 树脂脱盐 | 第22页 |
| 2.4.4.2.6 芯片点样、飞行时间质谱分析质谱 | 第22页 |
| 2.5 分析软件和电子数据库查询信息 | 第22页 |
| 2.6 数据分析 | 第22-25页 |
| 2.6.1 Hardy-Weinberg平衡 | 第23页 |
| 2.6.2 连锁不平衡分析 | 第23页 |
| 2.6.3 关联分析 | 第23-25页 |
| 2.6.3.1 单个位点与叶酸及同型半胱氨酸代谢的关联析 | 第23-24页 |
| 2.6.3.2 多位点联合分析与预测 | 第24-25页 |
| 第3章 结果 | 第25-38页 |
| 3.1 均衡性检验 | 第25-27页 |
| 3.2 叶酸及同型半胱氨酸浓度测定结果 | 第27-28页 |
| 3.3 SNP分型实验结果 | 第28-30页 |
| 3.4 Hardy-Weinberg平衡检验结果 | 第30-31页 |
| 3.5 关联分析-----单位点与叶酸及同型半胱氨酸代谢的关联分析 | 第31页 |
| 3.6 SNPs之间连锁不平衡程度的检验 | 第31-32页 |
| 3.7 关联分析-----两位点联合与叶酸及同型半胱氨酸代谢的关联分析 | 第32-34页 |
| 3.8 关联分析-----多位点联合与叶酸及同型半胱氨酸代谢的关联分析 | 第34-35页 |
| 3.9 SNPs得分与叶酸及Hcy代谢的相关性分析 | 第35-37页 |
| 3.10 rs234713、rs1801131位点的转录因子预测 | 第37-38页 |
| 第4章 讨论 | 第38-45页 |
| 4.1 叶酸及Hey代谢通路主要基因及研究进展 | 第38-39页 |
| 4.2 通过单位点关联分析发现的有意义的SNPs | 第39-40页 |
| 4.3 通过多位点关联分析发现的有意义的SNPs | 第40-43页 |
| 4.4 多因子回归算法--SVM回归与叶酸及Hey代谢的能力预测 | 第43-45页 |
| 第5章 总结 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-50页 |
| 综述 | 第50-55页 |
| 参考文献 | 第52-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
