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稻瘟病菌四个LIM蛋白编码基因及Gγ亚基编码基因的生物学功能研究

致谢第6-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-10页
缩略表第15-16页
第一章 文献综述第16-49页
    1 稻瘟病及稻瘟病菌概述第16-19页
        1.1 稻瘟病的发生规律与防治第17页
        1.2 稻瘟病菌的侵染机制第17-19页
    2 稻瘟病菌分子生物学研究进展第19-34页
        2.1 稻瘟病菌基因组主要特征第19-20页
        2.2 G蛋白信号途径第20-23页
        2.3 cAMP-PKA信号途径第23-24页
        2.4 Pmk1 MAPK信号途径第24-27页
        2.5 Ca~(2+)信号途径第27-28页
        2.6 黑色素合成与膨压形成机制第28-29页
        2.7 海藻糖合成途径第29-30页
        2.8 稻瘟病菌回避植物防御反应的机制第30-32页
        2.9 稻瘟病菌侵染过程中的细胞骨架动力学第32-33页
        2.10 稻瘟病菌抗氧化胁迫机制第33-34页
    3 LIM蛋白研究进展第34-47页
        3.1 LIM结构域的发现与结构第34页
        3.2 LIM蛋白的多样性及分类第34-37页
        3.3 LIM蛋白的主要功能第37-43页
            3.3.1 LHX(LIM homoeodomain)蛋白调控基因表达和决定细胞命运第37-38页
            3.3.2 核LMO蛋白调控基因表达并和肿瘤形成相关第38-39页
            3.3.3 胞质LIM蛋白可以穿梭进入细胞核并调控基因表达第39-41页
            3.3.4 与F-actin和actin细胞骨架蛋白之间的相互作用第41页
            3.3.5 参与胞外基质黏附(cell-ECM adhesion)作用及胞内外信号传导第41-43页
        3.4 真菌LIM蛋白的研究进展第43-47页
            3.4.1 酵母paxillin同源蛋白的功能第43-44页
            3.4.2 棉阿舒囊霉菌(Ashbya gossypii)paxillin类似蛋白的功能第44-45页
            3.4.3 酵母Lrg1和Rga1蛋白的功能第45-47页
            3.4.5 脉孢菌Neurospora Lrg1蛋白的功能第47页
    4 本研究的目的和意义第47-49页
第二章 材料与方法第49-71页
    1 材料和试剂第49-52页
        1.1 供试菌株、质粒载体及寄主品种第49页
            1.1.1 供试菌株第49页
            1.1.2 质粒载体第49页
            1.1.3 感病寄主品种第49页
        1.2 培养基、抗生素及工具酶使用第49-52页
            1.2.1 培养基及组成成份第49-51页
            1.2.2 转化筛选用抗生素第51-52页
            1.2.3 分子生物学试剂、试剂盒及来源第52页
    2 常规分子生物学实验操作第52-67页
        2.1 PCR第52-54页
            2.1.1 常规PCR反应体系第52页
            2.1.2 细菌菌落PCR反应体系第52-53页
            2.1.3 PCR反应程序(LA-Taq/KOD)第53页
            2.1.4 PCR产物纯化第53页
            2.1.5 重叠延伸PCR第53-54页
        2.2 核酸电泳第54-55页
            2.2.1 DNA电泳第54页
            2.2.2 RNA电泳第54-55页
        2.3 DNA抽提、酶解、回收及连接第55-58页
            2.3.1 大肠杆菌质粒DNA小量提取第55页
            2.3.2 大肠杆菌质粒DNA大量抽提第55-56页
            2.3.3 稻瘟病菌基因组DNA大量抽提第56-57页
            2.3.4 稻瘟病菌基因组DNA小量快速抽提第57页
            2.3.5 DNA酶切反应第57页
            2.3.6 DNA凝胶回收(Axyprep DNA gel extraction kit回收法)第57-58页
            2.3.7 酶切DNA片段的去磷酸化反应第58页
            2.3.8 酶切DNA片段的连接反应第58页
        2.4 RNA抽提及qRT-PCR第58-60页
            2.4.1 稻瘟病菌总RNA提取(Trizol法)第58-59页
            2.4.2 一链cDNA合成第59页
            2.4.3 qRT-PCR反应体系第59-60页
            2.4.4 qRT-PCR反应程序第60页
        2.5 DNA转化第60-63页
            2.5.1 大肠杆菌热激感受态细胞制备及转化第60-61页
            2.5.2 大肠杆菌电击感受态细胞制备及转化第61-62页
            2.5.3 稻瘟病菌菌原生质体制备与转化第62-63页
        2.6 稻瘟病菌基因组DNA Southern杂交(DIG)第63-66页
            2.6.1 模板DNA探针标记及杂交液制备第63页
            2.6.2 基因组DNA的消化、电泳及变性第63-64页
            2.6.3 DNA转模第64-65页
            2.6.4 杂交过程第65页
            2.6.5 免疫显色第65-66页
        2.7 酵母双杂交实验第66-67页
            2.7.1 各类贮备液第66页
            2.7.2 酵母双杂转化第66-67页
    3 稻瘟病菌生物学性状测定实验第67-71页
        3.1 稻瘟病菌生长速度测定及菌落形态观察第67页
        3.2 稻瘟病菌产孢培养和产孢量测定第67页
        3.3 稻瘟病菌分生孢子诱导及侧拍实验第67页
        3.4 附着胞形成实验第67-68页
        3.5 稻瘟菌有性生殖实验第68页
        3.6 稻瘟菌单孢分离实验第68页
        3.7 大麦离体接种和水稻喷雾接种第68-69页
        3.8 水稻幼根接种实验第69页
        3.9 洋葱表皮穿透实验第69页
        3.10 稻瘟病菌菌丝、分生孢子和附着胞的GFP观察第69页
        3.11 稻瘟病菌细胞壁敏感性测定第69-71页
第三章 结果与分析第71-106页
    1 稻瘟病菌四个LIM蛋白编码基因的功能分析第71-96页
        1.1 稻瘟病菌四个LIM蛋白编码基因的鉴定与同源性分析第71-72页
        1.2 稻瘟病菌四个LIM蛋白编码基因的敲除与互补第72-78页
            1.2.1 LIM蛋白编码基因的敲除载体构建第72-74页
            1.2.2 LIM蛋白编码基因的敲除突变体的获得第74-75页
            1.2.3 LIM蛋白编码基因敲除突变体的分子杂交验证第75-77页
            1.2.4 LIM蛋白编码基因互补载体的构建及恢复型菌株的获得第77-78页
        1.3 稻瘟病菌四个LIM蛋白编码基因敲除的表型分析第78-86页
            1.3.1 LIM蛋白编码基因敲除对稻瘟病菌营养生长的影响第78-79页
            1.3.2 LIM蛋白编码基因敲除对稻瘟病菌产孢的影响第79-81页
            1.3.3 LIM蛋白编码基因敲除对分生孢子形态及隔膜分化的影响第81-83页
            1.3.4 LIM蛋白编码基因敲除对附着胞形成的影响第83-85页
            1.3.5 LIM蛋白编码基因敲除对稻瘟病菌致病性的影响第85-86页
        1.4 稻瘟病菌LIM蛋白的亚细胞定位第86-87页
        1.5 MoLrg1和MoPax1蛋白结构域功能分析第87-90页
            1.5.1 结构域缺失载体的构建及转化第87-88页
            1.5.2 MoLrg1蛋白结构域功能分析第88-89页
            1.5.3 MoPax1蛋白结构域功能分析第89-90页
        1.6 稻瘟病菌MoLdb1和LIM蛋白的互作关系第90-94页
            1.6.1 酵母双杂鉴定MoLdb1与四个LIM蛋白之间的互作第90-91页
            1.6.2 稻瘟病菌MoLDB1的敲除对四个LIM蛋白表达的影响第91-92页
            1.6.3 MoPAX1、MoLRG1及MoLDB1敲除突变体的表达谱测序分析第92-94页
        1.7 稻瘟病菌MoPax1、MoLrg1及MoRga1互作蛋白检测第94-95页
        1.8 稻瘟病菌其它6个含RhoGAP蛋白的基因敲除及表型初步分析第95-96页
    2 稻瘟病菌Gγ亚基编码基因MGG1生物学功能分析第96-106页
        2.1 Gγ亚基编码基因MGG1序列分析第96页
        2.2 Gγ亚基编码基因MGG1的敲除及互补第96-99页
            2.2.1 MGG1基因敲除载体构建与突变体的获得第96-97页
            2.2.2 MGG1基因敲除的分子杂交验证第97页
            2.2.3 MGG1基因互补载体的构建和恢复型菌株的获得第97-99页
        2.3 Gy亚基编码基因MGG1敲除菌株的表型分析第99-104页
            2.3.1 MGG1基因敲除对稻瘟病菌生长的影响第99-100页
            2.3.2 MGG1基因敲除对稻瘟病菌产孢的影响第100页
            2.3.3 MGG1基因敲除对稻瘟病菌分生孢子萌发的影响第100-101页
            2.3.4 MGG1基因敲除对稻瘟病菌附着胞形成的影响第101-103页
            2.3.5 MGG1基因敲除对稻瘟病菌有性生殖的影响第103页
            2.3.6 MGG1基因敲除对稻瘟病菌致病性的影响第103-104页
        2.4 稻瘟病菌Gγ亚基的细胞定位第104-106页
第四章 全文总结、讨论与展望第106-112页
    1 全文总结第106-107页
    2 讨论及展望第107-112页
        2.1 LIM蛋白的同源性及一致性分析第107页
        2.2 稻瘟病菌的基因敲除效率第107-108页
        2.3 突变体△mopax1和△molrg1的表型互补第108页
        2.4 稻瘟病菌MoPax1及其同源蛋白功能比较第108-110页
        2.5 Lrg1和Rga1蛋白功能比较第110-111页
        2.6 MGG1插入失活与敲除突变分析第111页
        2.7 未来研究展望第111-112页
参考文献第112-126页
附录1 本文的突变体及野生菌株第126-127页
附录2 本文的引物信息第127-130页
附录3 作者简历及在学期间取得的科研成果第130页

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