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马铃薯疮痂病菌分子检测技术的建立

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1 引言第9-17页
    1.1 马铃薯疮痂病简介第9-10页
        1.1.1 马铃薯疮痂病的分布和危害第9页
        1.1.2 马铃薯疮痂病的症状第9-10页
    1.2 马铃薯疮痂病病原学简介第10-11页
        1.2.1 马铃薯疮痂病病原的命名及分类第10页
        1.2.2 马铃薯疮痂病原菌的多样性第10-11页
    1.3 马铃薯疮痂病菌致病因子的研究第11-13页
        1.3.1 马铃薯疮痂病菌的致病毒素第11-12页
        1.3.2 马铃薯疮痂病菌毒素合成相关基因第12-13页
    1.4 PCR 技术与病原菌检测第13-16页
        1.4.1 PCR 技术的应用第13-14页
        1.4.2 实时荧光定量 PCR 技术第14-16页
    1.5 本研究的切入点及意义第16-17页
2 材料与方法第17-26页
    2.1 材料第17-18页
        2.1.1 供试菌株第17页
        2.1.2 试剂及培养基第17-18页
        2.1.3 主要仪器第18页
    2.2 马铃薯疮痂病原菌的培养及保存第18-19页
        2.2.1 菌种保存第18-19页
        2.2.2 菌种纯度检测第19页
    2.3 各菌株基因组 DNA 的提取第19-20页
        2.3.1 各疮痂病菌总 DNA 的提取第19页
        2.3.2 其他菌株 DNA 的提取第19-20页
        2.3.3 基因组 DNA 纯度检测第20页
    2.4 马铃薯疮痂病菌定性检测方法的建立第20-23页
        2.4.1 引物设计第20页
        2.4.2 扩增反应体系及反应条件的优化第20-21页
        2.4.3 特异性片段的纯化第21页
        2.4.4 纯化产物和载体的连接第21页
        2.4.5 连接产物的转化第21-22页
        2.4.6 克隆及测序第22页
        2.4.7 对所筛选探针稳定性的检测第22页
        2.4.8 检测体系的灵敏度测定第22-23页
    2.5 马铃薯疮痂病菌定量检测方法的建立第23-24页
        2.5.1 SYBR GreenⅠ实时荧光定量 PCR 引物设计第23页
        2.5.2 对特异性引物的筛选第23-24页
        2.5.3 样品浓度梯度的摸索第24页
        2.5.4 标准曲线的建立第24页
    2.6 检测病原菌孢子在土壤中的最底致病浓度第24-26页
        2.6.1 温室马铃薯的种植第24-25页
        2.6.2 接菌第25页
        2.6.3 结果鉴定第25-26页
3 结果与分析第26-43页
    3.1 马铃薯疮痂病菌定性检测技术第26-31页
        3.1.1 测试引物的初步扩增结果第26页
        3.1.2 最适退火温度筛选及反应体系确定第26-27页
        3.1.3 最适引物的确定第27-28页
        3.1.4 最低检测阈值第28-30页
        3.1.5 定性检测体系的稳定性测试结果第30-31页
    3.2 马铃薯疮痂病菌定量检测技术第31-42页
        3.2.1 SYBR GreenⅠqPCR 反应引物筛选结果第31-32页
        3.2.2 浓度梯度筛选结果第32-33页
        3.2.3 熔解曲线分析第33-34页
        3.2.4 各菌株分别建立标准曲线第34页
        3.2.5 SYBR GreenⅠqPCR 检测标准曲线的建立第34-41页
        3.2.6 标准曲线对带菌土壤样品的检测第41-42页
    3.3 病原菌最低致病浓度的确定第42-43页
4. 讨论第43-45页
    4.1 关于植物病原的检测方法第43-44页
    4.2 关于分子检测技术第44-45页
5 结论第45-46页
参考文献第46-53页
在读期间发表的论文第53-54页
作者简介第54-55页
致谢第55-56页

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