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利用蛋白质组和磷酸化组学技术研究肉鸡热应激调控机制

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
一、前言第12-21页
    1.1 热应激严重影响肉鸡的健康生长第12-14页
        1.1.1 热应激影响肉鸡生产性能和肉品质第12-13页
        1.1.2 热应激对肉鸡神经内分泌机能的影响第13页
        1.1.3 热应激对肉鸡免疫机能的影响第13页
        1.1.4 热应激对肉鸡血液生化指标的影响第13-14页
    1.2 蛋白质组学技术进展及在热应激调控机制研究中的应用第14-18页
        1.2.1 定性蛋白质组学技术第14-16页
        1.2.2 定量蛋白质组学技术分类第16-17页
        1.2.3 蛋白质组学技术在畜禽热应激调控机制研究中的应用第17-18页
    1.3 磷酸化蛋白组学技术及应用第18-20页
        1.3.1 磷酸化修饰蛋白的鉴定技术和研究进展第18-19页
        1.3.2 磷酸化蛋白组技术在热应激调控机制研究中的应用第19-20页
    1.4 本研究目的和意义第20-21页
二、利用非标蛋白质组学技术研究肉鸡热应激调控机制第21-45页
    2.1 材料与方法第21-27页
        2.1.1 试验材料第21-22页
        2.1.2 试验日粮第22-23页
        2.1.3 蛋白质提取第23页
        2.1.4 蛋白质酶切方法第23-24页
        2.1.5 多肽的液相色谱分离条件优化第24-25页
        2.1.6 质谱数据采集条件优化第25页
        2.1.7 质谱数据处理和检索第25-26页
        2.1.8 使用SWATH方法采集定量数据第26页
        2.1.9 蛋白定量数据的提取第26页
        2.1.10 MRM验证差异蛋白第26-27页
        2.1.11 Western Blotting验证第27页
        2.1.12 数据统计和GO分析第27页
    2.2 结果与分析第27-37页
        2.2.1 肝脏蛋白提取与定量结果分析第27-28页
        2.2.2 蛋白质酶切条件优化第28-29页
        2.2.3 多肽分离条件优化第29-30页
        2.2.4 质谱采集条件优化第30-32页
        2.2.5 建立SWATH定量分析鸡肝蛋白质库第32页
        2.2.6 统计分析定量SWATH采集数据的重现性第32-34页
        2.2.7 统计分析发现热应激下鸡肝差异蛋白第34页
        2.2.8 GO分析热应激下鸡肝差异蛋白的功能第34-35页
        2.2.9 KEGG分析热应激下鸡肝差异蛋白的功能第35-36页
        2.2.10 MRM验证差异蛋白质的表达水平第36页
        2.2.11 Western Blot验证差异蛋白质的表达水平第36-37页
    2.3 讨论第37-43页
        2.3.1 肉鸡热应激肝蛋白质组数据的重复性和可靠性分析第37-38页
        2.3.2 肉鸡肝脏差异表达蛋白质的生物学功能鉴定第38-39页
        2.3.3 热应激通过抑制的ERK1/2信号路径调节细胞存活第39-40页
        2.3.4 热应激影响肉鸡肝脏脂类代谢和氨基酸代谢第40-42页
        2.3.5 热应激诱导肝细胞炎症反应和免疫应答第42-43页
    2.4 小结第43-45页
三、磷酸化蛋白组技术研究肉鸡热应激前期信号调控机制第45-57页
    3.1 材料与方法第45-49页
        3.1.1 试验材料第45-46页
        3.1.2 试验日粮第46页
        3.1.3 蛋白质提取第46页
        3.1.4 蛋白质酶切方法第46-47页
        3.1.5 多肽iTRAQ标记和分级第47页
        3.1.6 磷酸化肽段的富集第47-48页
        3.1.7 iTRAQ蛋白质组定量分析第48页
        3.1.8 磷酸化肽段和蛋白的鉴定第48-49页
        3.1.9 磷酸化蛋白功能注释和分析第49页
    3.2 结果第49-54页
        3.2.1 MAPK信号通路中关键基因表达分析第49-50页
        3.2.2 比较不同酸对磷酸化富集效果第50-51页
        3.2.3 磷酸化蛋白质组学实验解析磷酸化修饰在热应激调控作用机制第51-52页
        3.2.4 总蛋白水平比较热应激24小时后鸡肝蛋白的变化第52-53页
        3.2.5 比较分析热应激下磷酸化修饰蛋白第53-54页
    3.3 讨论第54-57页
四、全文结论第57-58页
参考文献第58-67页
致谢第67-68页
博士后期间发表的文章和主持项目第68-69页
个人简历第69-70页

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