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板栗和猕猴桃NBS-encoding基因家族的全基因组分析

摘要第6-7页
ABSTRACT第7-8页
缩略词第9-10页
第一章 文献综述第10-30页
    1 植物抗病基因系统的演化第10-11页
    2 植物抗病基因的种类第11-13页
    3 NBS-LRR基因的主要结构和功能第13-14页
    4 R基因与Avr基因互作模式第14-19页
        4.1 R-Avr直接作用—基因对基因的假说(Gene-for-Gene Hypothesis)第14-15页
        4.2 R-Avr间接作用——防卫假说(Guard Hypothesis)第15-19页
    5 R-Avr共进化的模式第19-23页
        5.1 R与Avr直接互作模式第20-21页
        5.2 R与Avr间接互作模式第21-23页
    6 本研究的目的和意义第23-24页
    参考文献第24-30页
第二章 板栗NBS-encoding基因的全基因分析第30-56页
    1 材料与方法第32-33页
        1.1 板栗NBS-encoding基因的确定和基因家族的划分第32页
        1.2 序列分析和系统进化树的构建第32页
        1.3 非同义替换与同义替换的比率的计算第32-33页
        1.4 正选择压分析第33页
        1.5 启动子区域分析第33页
    2 结果与分析第33-48页
        2.1 板栗NBS-encoding基因的确定第33-34页
        2.2 板栗NBS-encoding基因的复制第34-36页
        2.3 板栗NBS-encoding基因的复制时间第36-37页
        2.4 板栗NBS-encoding基因受到的选择压第37-43页
        2.5 板栗NBS-encoding基因的系统进化分析第43-45页
        2.6 板栗NBS-encoding基因启动子序列的顺式作用元件分析第45-48页
    3 讨论第48-50页
        3.1 板栗中含有少数的TIR-NBS-encoding基因第48-49页
        3.2 板栗NBS-encoding基因的复制事件第49-50页
        3.3 物种内的特异性复制第50页
        3.4 含有RPW8结构域的NBS基因群第50页
    4 小结第50-52页
    参考文献第52-56页
第三章 猕猴桃中NBS-encoding基因的全基因分析第56-72页
    1 材料和方法第57-58页
        1.1 NBS-encoding基因的鉴定和家族的划分第57-58页
        1.2 序列分析和系统进化树的构建第58页
        1.3 非同义替换与同义替换的比率的计算第58页
        1.4 正选择压分析第58页
    2 结果与分析第58-65页
        2.1 猕猴桃NBS-encoding基因的确定第58-59页
        2.2 猕猴桃NBS-encoding基因家族的划分第59-60页
        2.3 猕猴桃NBS-encoding基因的系统进化分析第60-62页
        2.4 猕猴桃NBS-encoding基因的复制时间第62页
        2.5 选择压的分析第62-65页
    3 讨论第65-66页
        3.1 猕猴桃基因组中很少的NBS-LRR基因第65页
        3.2 猕猴桃基因组中的新近基因复制事件第65-66页
        3.3 猕猴桃的NBS-encoding基因受到的选择作用第66页
    4 小结第66-68页
    参考文献第68-72页
全文结论第72-74页
主要创新点第74-76页
攻读硕士学位期间发表论文第76-78页
致谢第78-80页
附录第80-92页

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