摘要 | 第6-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
缩略词 | 第9-10页 |
第一章 文献综述 | 第10-30页 |
1 植物抗病基因系统的演化 | 第10-11页 |
2 植物抗病基因的种类 | 第11-13页 |
3 NBS-LRR基因的主要结构和功能 | 第13-14页 |
4 R基因与Avr基因互作模式 | 第14-19页 |
4.1 R-Avr直接作用—基因对基因的假说(Gene-for-Gene Hypothesis) | 第14-15页 |
4.2 R-Avr间接作用——防卫假说(Guard Hypothesis) | 第15-19页 |
5 R-Avr共进化的模式 | 第19-23页 |
5.1 R与Avr直接互作模式 | 第20-21页 |
5.2 R与Avr间接互作模式 | 第21-23页 |
6 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
参考文献 | 第24-30页 |
第二章 板栗NBS-encoding基因的全基因分析 | 第30-56页 |
1 材料与方法 | 第32-33页 |
1.1 板栗NBS-encoding基因的确定和基因家族的划分 | 第32页 |
1.2 序列分析和系统进化树的构建 | 第32页 |
1.3 非同义替换与同义替换的比率的计算 | 第32-33页 |
1.4 正选择压分析 | 第33页 |
1.5 启动子区域分析 | 第33页 |
2 结果与分析 | 第33-48页 |
2.1 板栗NBS-encoding基因的确定 | 第33-34页 |
2.2 板栗NBS-encoding基因的复制 | 第34-36页 |
2.3 板栗NBS-encoding基因的复制时间 | 第36-37页 |
2.4 板栗NBS-encoding基因受到的选择压 | 第37-43页 |
2.5 板栗NBS-encoding基因的系统进化分析 | 第43-45页 |
2.6 板栗NBS-encoding基因启动子序列的顺式作用元件分析 | 第45-48页 |
3 讨论 | 第48-50页 |
3.1 板栗中含有少数的TIR-NBS-encoding基因 | 第48-49页 |
3.2 板栗NBS-encoding基因的复制事件 | 第49-50页 |
3.3 物种内的特异性复制 | 第50页 |
3.4 含有RPW8结构域的NBS基因群 | 第50页 |
4 小结 | 第50-52页 |
参考文献 | 第52-56页 |
第三章 猕猴桃中NBS-encoding基因的全基因分析 | 第56-72页 |
1 材料和方法 | 第57-58页 |
1.1 NBS-encoding基因的鉴定和家族的划分 | 第57-58页 |
1.2 序列分析和系统进化树的构建 | 第58页 |
1.3 非同义替换与同义替换的比率的计算 | 第58页 |
1.4 正选择压分析 | 第58页 |
2 结果与分析 | 第58-65页 |
2.1 猕猴桃NBS-encoding基因的确定 | 第58-59页 |
2.2 猕猴桃NBS-encoding基因家族的划分 | 第59-60页 |
2.3 猕猴桃NBS-encoding基因的系统进化分析 | 第60-62页 |
2.4 猕猴桃NBS-encoding基因的复制时间 | 第62页 |
2.5 选择压的分析 | 第62-65页 |
3 讨论 | 第65-66页 |
3.1 猕猴桃基因组中很少的NBS-LRR基因 | 第65页 |
3.2 猕猴桃基因组中的新近基因复制事件 | 第65-66页 |
3.3 猕猴桃的NBS-encoding基因受到的选择作用 | 第66页 |
4 小结 | 第66-68页 |
参考文献 | 第68-72页 |
全文结论 | 第72-74页 |
主要创新点 | 第74-76页 |
攻读硕士学位期间发表论文 | 第76-78页 |
致谢 | 第78-80页 |
附录 | 第80-92页 |