| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词表 | 第9-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-16页 |
| 1.1 种系特异基因 | 第10-12页 |
| 1.1.1 种系特异的蛋白编码基因 | 第10-11页 |
| 1.1.2 种系特异的miRNA基因 | 第11-12页 |
| 1.2 新基因 | 第12-15页 |
| 1.2.1 新基因的概述 | 第12-13页 |
| 1.2.2 新基因的产生方式 | 第13-15页 |
| 1.2.2.1 基因重复 | 第13-14页 |
| 1.2.2.2 外显子重排 | 第14页 |
| 1.2.2.3 可移动元件 | 第14-15页 |
| 1.3 本研究的目的意义与技术路线 | 第15-16页 |
| 第二章 柑橘特异蛋白编码基因的鉴定与起源分析 | 第16-28页 |
| 2.1 引言 | 第16页 |
| 2.2 材料方法 | 第16-21页 |
| 2.2.1 数据准备 | 第16-18页 |
| 2.2.2 柑橘特异蛋白编码基因的鉴定 | 第18-19页 |
| 2.2.3 柑橘特异蛋白编码基因的基因组定位及序列特征分析 | 第19页 |
| 2.2.4 柑橘特异蛋白编码基因的表达分析和功能分析 | 第19页 |
| 2.2.5 柑橘特异蛋白编码基因的进化分析 | 第19-21页 |
| 2.2.5.1 基因重复 | 第19-20页 |
| 2.2.5.3 外显子重排 | 第20页 |
| 2.2.5.2 可移动元件 | 第20-21页 |
| 2.3 结论与讨论 | 第21-28页 |
| 2.3.1 柑橘特异蛋白编码基因鉴定结果 | 第21页 |
| 2.3.2 柑橘特异蛋白编码基因基因组定位及序列特征分析结果 | 第21-24页 |
| 2.3.3 柑橘特异蛋白编码基因表达及功能分析结果 | 第24-25页 |
| 2.3.4 柑橘特异蛋白编码基因的进化分析结果 | 第25-27页 |
| 2.3.4.1 基因重复 | 第25-26页 |
| 2.3.4.2 外显子重排 | 第26页 |
| 2.3.4.3 可移动元件 | 第26-27页 |
| 2.3.5 讨论 | 第27-28页 |
| 第三章 柑橘特异miRNA的起源分析 | 第28-34页 |
| 3.1 引言 | 第28页 |
| 3.2 材料和方法 | 第28-29页 |
| 3.2.1 柑橘特异miRNA的鉴定 | 第28页 |
| 3.2.2 柑橘特异miRNA基因组定位和基因倍增模式分析 | 第28-29页 |
| 3.2.3 柑橘特异miRNA基因倍增时间估计 | 第29页 |
| 3.2.4 柑橘特异miRNA多序列比对与系统发育分析 | 第29页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第29-34页 |
| 3.3.1 基因组定位与基因倍增模式分析 | 第29-31页 |
| 3.3.2 分子系统进化树的构建 | 第31-32页 |
| 3.3.3 miRNA表达分析 | 第32-33页 |
| 3.3.4 讨论 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-41页 |
| 附录Ⅰ附表 | 第41-42页 |
| 附录Ⅱ附图 | 第42-46页 |
| 附录Ⅲ 作者简介 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47页 |
