| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 主要符号表 | 第12-13页 |
| 第1章 前言 | 第13-27页 |
| 1.1 环状RNA(circular RNA, circ RNAs)发现及分类 | 第13-14页 |
| 1.1.1 Circ RNAs发现及发展 | 第13-14页 |
| 1.1.2 Circ RNAs分类 | 第14页 |
| 1.2 Circ RNAs产生机制 | 第14-16页 |
| 1.3 Circ RNAs特点与功能 | 第16-19页 |
| 1.3.1 Circ RNAs特点 | 第16-17页 |
| 1.3.2 Circ RNAs功能 | 第17-19页 |
| 1.3.2.1 Mi RNAs海绵功能 | 第17-18页 |
| 1.3.2.2 Circ RNA直接翻译成蛋白质 | 第18页 |
| 1.3.2.3 其他功能作用 | 第18-19页 |
| 1.4 Circ RNAs与人类疾病 | 第19-20页 |
| 1.5 Circ RNAs与mi RNAs、Lnc RNAs的相互作用 | 第20-23页 |
| 1.5.1 Circ RNAs与mi RNA的相互作用 | 第20-22页 |
| 1.5.1.1 Mi RNA及其功能 | 第20-21页 |
| 1.5.1.2 Circ RNAs与mi RNA的相互作用 | 第21-22页 |
| 1.5.2 Circ RNAs与Lnc RNA的相互作用 | 第22-23页 |
| 1.5.2.1 Lnc RNA及其功能 | 第22-23页 |
| 1.5.2.2 Circ RNAs与lnc RNA的相互作用 | 第23页 |
| 1.6 Circ RNAs的研究方法 | 第23-24页 |
| 1.6.1 Circ RNAs数据库与网站 | 第23页 |
| 1.6.2 Circ RNAs常用研究方法 | 第23-24页 |
| 1.7 成骨不全与Circ RNA | 第24-25页 |
| 1.8 本课题拟研究内容 | 第25-27页 |
| 第2章 成骨不全miRNA、circRNA、lncRNA与靶基因相互作用的生物信息学分析 | 第27-57页 |
| 2.1 实验目的 | 第27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27-28页 |
| 2.2.1 Mi RNAs-circ RNAs相互作用的生物信息学预测与网络分析 | 第27页 |
| 2.2.1.1 Mi RNAs-circ RNAs相互作用的生物信息学预测 | 第27页 |
| 2.2.1.2 Mi RNAs-circ RNAs相互作用的网络分析 | 第27页 |
| 2.2.2 Mi RNAs靶基因的生物信息学预测与网络分析 | 第27-28页 |
| 2.2.2.1 Mi RNAs靶基因的生物信息学预测 | 第27-28页 |
| 2.2.2.2 Mi RNAs靶基因的网络分析 | 第28页 |
| 2.2.3 Mi RNAs-lnc RNAs相互作用的生物信息学预测与网络分析 | 第28页 |
| 2.2.3.1 Mi RNAs-lnc RNAs相互作用的生物信息学预测 | 第28页 |
| 2.2.3.2 Mi RNAs-lnc RNAs相互作用的网络分析 | 第28页 |
| 2.3 结果 | 第28-46页 |
| 2.3.1 Mi RNAs-circ RNAs相互作用的生物信息学预测与网络分析 | 第28-31页 |
| 2.3.2 Mi RNAs靶基因的生物信息学预测与网络分析 | 第31-41页 |
| 2.3.2.1 Mi RNAs靶基因预测结果统计 | 第31页 |
| 2.3.2.2 Mi RWALK中7个以上软件共有的mi RNAs预测靶基因相互作用及网络分析 | 第31-35页 |
| 2.3.2.3 Mi RWALK中8个以上软件共有的mi RNAs预测靶基因相互作用及网络分析 | 第35-40页 |
| 2.3.2.4 Mi RWALK中9个以上软件共有的mi RNAs及其预测靶基因相互作用分析 | 第40-41页 |
| 2.3.3 7-9 个数据库预测得到的相关通路分析 | 第41页 |
| 2.3.4 MiRNAs-lncRNAs相互作用的生物信息学预测与网络分析 | 第41-45页 |
| 2.3.5 MiRNAs与之相互作用的cric RNAs、lncRNAs及靶基因间相互作用分析 | 第45-46页 |
| 2.4 讨论 | 第46-57页 |
| 2.4.1 MiRNAs-circRNAs相互作用 | 第46页 |
| 2.4.2 MiRNAs-lncRNAs相互作用 | 第46-47页 |
| 2.4.3 MiRNAs及其靶基因相互作用 | 第47-54页 |
| 2.4.3.1 分析比较不同数量软件预测结果的差异 | 第47-50页 |
| 2.4.3.2 Cytoscape预测miRNA-Target Gene相互作用节点数高且可信度高的基因功能 | 第50-52页 |
| 2.4.3.3 DAVID预测信号通路分析 | 第52-54页 |
| 2.4.4 Mic RNAs、cric RNAs、lnc RNAs与靶Gene相互作用分析 | 第54-57页 |
| 第3章 成骨不全相关circ RNAs、靶基因差异性表达分析 | 第57-67页 |
| 3.1 实验材料 | 第57页 |
| 3.1.1 实验试剂 | 第57页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第57页 |
| 3.2 实验方法 | 第57-58页 |
| 3.2.1 样本的采集 | 第57-58页 |
| 3.2.2 RNA的提取 | 第58页 |
| 3.3 引物设计与合成 | 第58-59页 |
| 3.3.1 Circ RNAs引物合成 | 第58-59页 |
| 3.3.2 靶基因引物合成 | 第59页 |
| 3.4 RNA逆转录反应 | 第59页 |
| 3.5 Circ RNAs、靶基因实时荧光定量PCR反应 | 第59-60页 |
| 3.6 实验结果与分析 | 第60-65页 |
| 3.6.1 引物筛选结果与分析 | 第60-64页 |
| 3.6.1.1 Circ RNA引物设计与筛选结果 | 第60-61页 |
| 3.6.1.2 靶基因引物设计与筛选结果 | 第61-64页 |
| 3.6.2 Circ RNA与靶基因差异性表达结果与分析 | 第64-65页 |
| 3.6.2.1 靶基因差异性表达结果 | 第64页 |
| 3.6.2.2 Circ RNAs差异性表达 | 第64-65页 |
| 3.7 讨论 | 第65-67页 |
| 第4章 总结与展望 | 第67-69页 |
| 4.1 本文研究的主要结论 | 第67页 |
| 4.2 本文不足与展望 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-83页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第83-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
