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多尺度模拟方法在生命科学和材料科学中的若干应用--血红素与小分子配合物、溶剂化自由能和含能材料的爆轰反应

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
第一章 前言第12-30页
    1.1 多尺度模拟介绍第12-14页
    1.2 量子化学计算第14-16页
    1.3 分子力场方法第16-24页
    1.4 分子动力学模拟方法第24-25页
    1.5 基于第一原理的CAR-PARRINELLO 分子动力学模拟第25-26页
    1.6 自由能计算方法第26-30页
第二章 血红素分子成键机理研究第30-52页
    2.1 血红素简介第30-31页
    2.2 计算模型与方法第31-34页
    2.3 血红素配合物电子结构第34-35页
    2.4 血红素配合物结构、成键能分析第35-37页
    2.5 血红素配合物成键机理第37-50页
        2.5.1 σdonation 成键机理第37-39页
        2.5.2 πdonation 成键机理第39-44页
        2.5.3 咪唑对小分子与血红素配合的影响第44-50页
    2.6 小结第50-52页
第三章 溶剂化自由能计算及油水分配系数和无限稀释活度系数预测第52-83页
    3.1 研究背景介绍第52-56页
    3.2 计算模型与方法第56-57页
    3.3 分子力场验证第57-59页
    3.4 溶剂化自由能计算及性质预测第59-65页
        3.4.1 计算条件优化第59-63页
        3.4.2 计算结果与讨论第63-65页
    3.5 分子间相互作用力场验证第65-67页
    3.6 小结第67-83页
第四章 含能材料反应机理研究第83-120页
    4.1 含能材料介绍第83-90页
    4.2 硝基甲烷分子反应机理研究第90-102页
        4.2.1 计算模型与研究方法第90-91页
        4.2.2 初始反应机理第91-94页
        4.2.3 反应过程生成物研究第94-102页
        4.2.4 小结第102页
    4.3 FOX-7 分子反应机理研究第102-120页
        4.3.1 计算模型与计算方法第102-105页
        4.3.2 初始反应机理第105-112页
        4.3.3 反应过程生成物研究第112-119页
        4.3.4 小结第119-120页
第五章 全文总结第120-123页
参考文献第123-133页
附录第133-144页
攻读硕士学位期间已发表的论文第144-145页
攻读硕士学位期间参与的科研项目第145-146页
攻读硕士学位期间取得的学术荣誉第146-147页
致谢第147-148页
上海交通大学学位论文答辩决议书第148-150页

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