摘要 | 第3-10页 |
ABSTRACT | 第10-15页 |
第一章 前言 | 第20-33页 |
1.1 腺病毒简介 | 第20-22页 |
1.2 腺病毒的分类与分型 | 第22-27页 |
1.2.1 血清学分型 | 第22-23页 |
1.2.2 腺病毒的基因组型 | 第23-24页 |
1.2.3 腺病毒全基因组分型 | 第24-27页 |
1.3 腺病毒的流行病学 | 第27-33页 |
第二章 广州腺病毒的分子流行病学研究 | 第33-42页 |
2.1 材料 | 第33-35页 |
2.1.1 常用试剂与耗材 | 第33-34页 |
2.1.2 主要仪器 | 第34页 |
2.1.3 病毒株与细胞株 | 第34页 |
2.1.4 主要培养基和常用试剂的配制 | 第34-35页 |
2.2 方法 | 第35-37页 |
2.2.1 腺病毒的培养 | 第35页 |
2.2.2 病毒DNA提取 | 第35页 |
2.2.3 引物设计 | 第35-36页 |
2.2.4 PCR反应条件 | 第36页 |
2.2.5 临床病毒株的鉴定 | 第36-37页 |
2.3 结果 | 第37-40页 |
2.3.1 引物设计 | 第37页 |
2.3.2 腺病毒分离培养结果 | 第37-38页 |
2.3.3 腺病毒通用检测引物PCR检测结果 | 第38页 |
2.3.4 腺病毒型特异性引物PCR扩增分型结果 | 第38-39页 |
2.3.5 临床分离株的检测鉴定 | 第39-40页 |
2.4 讨论 | 第40-42页 |
第三章 人3型腺病毒的分离鉴定及进化分析 | 第42-56页 |
3.1 材料 | 第42-44页 |
3.1.1 常用试剂与耗材 | 第42页 |
3.1.2 主要仪器 | 第42-43页 |
3.1.3 病毒株与细胞株 | 第43页 |
3.1.4 主要培养基和常用试剂的配制 | 第43-44页 |
3.2 方法 | 第44-48页 |
3.2.1 腺病毒的培养 | 第44页 |
3.2.2 病毒DNA提取 | 第44页 |
3.2.3 引物设计 | 第44-45页 |
3.2.4 PCR反应条件 | 第45页 |
3.2.5 GZ13株腺病毒六邻体基因PCR扩增及测序 | 第45页 |
3.2.6 GZ13株六邻体蛋白基因序列分析及进化分析 | 第45-48页 |
3.3 结果 | 第48-55页 |
3.3.1 腺病毒分离培养结果 | 第48页 |
3.3.2 GZ13株腺病毒检测与初步分型结果 | 第48-49页 |
3.3.3 GZ13株六邻体基因序列测定与分析 | 第49-51页 |
3.3.4 GZ13六邻体基因组的系统进化关系分析 | 第51-55页 |
3.4 讨论 | 第55-56页 |
第四章 人14型腺病毒的分离、鉴定及基因组分析 | 第56-78页 |
4.1 材料 | 第56-58页 |
4.1.1 常用试剂与耗材 | 第56-57页 |
4.1.2 主要仪器 | 第57页 |
4.1.3 病毒与细胞 | 第57页 |
4.1.4 常用试剂的配制 | 第57-58页 |
4.2 方法 | 第58-67页 |
4.2.1 腺病毒的培养 | 第58-59页 |
4.2.2 病毒核酸与病毒基因组的提取 | 第59页 |
4.2.3 引物设计 | 第59-62页 |
4.2.4 PCR反应条件 | 第62-63页 |
4.2.5 HADV-GZ01株病毒基因组测序 | 第63页 |
4.2.6 基因组注释 | 第63-64页 |
4.2.7 DNA限制性内切酶分析 | 第64页 |
4.2.8 GZ01株的生物信息学和基因组比较分析 | 第64-67页 |
4.3 结果 | 第67-76页 |
4.3.1 六邻体测序及基因组提取结果 | 第67页 |
4.3.2 基因组注释与序列分析结果 | 第67-68页 |
4.3.3 HAdV-B14/CHN/GZ01的基因组型 | 第68-69页 |
4.3.4 全基因组比较与分析 | 第69-73页 |
4.3.5 末端反向重复序列的比较和分析 | 第73页 |
4.3.6 HAdV-GZ01株的基因组进化分析 | 第73-76页 |
4.4 讨论 | 第76-78页 |
第五章 人7型腺病毒的分离、鉴定及基因组分析 | 第78-101页 |
5.1 材料 | 第78-79页 |
5.1.1 常用试剂与耗材 | 第78-79页 |
5.1.2 主要仪器 | 第79页 |
5.1.3 病毒与细胞 | 第79页 |
5.1.4 常用试剂的配制 | 第79页 |
5.2 方法 | 第79-87页 |
5.2.1 腺病毒的培养 | 第79-80页 |
5.2.2 病毒核酸与病毒基因组的提取 | 第80页 |
5.2.3 引物设计 | 第80-83页 |
5.2.4 PCR反应条件 | 第83页 |
5.2.5 HAdV-DG01株病毒基因组测序 | 第83页 |
5.2.6 基因组注释 | 第83-84页 |
5.2.7 DNA限制性内切酶分析 | 第84页 |
5.2.8 HAdV-DG01株基因组进化分析 | 第84-87页 |
5.3 结果 | 第87-99页 |
5.3.1 DG01株腺病毒检测及分型结果 | 第87-88页 |
5.3.2 HAdV-DG01株分离培养结果 | 第88页 |
5.3.3 HAdV-DG01基因组提取结果 | 第88-89页 |
5.3.4 HAdV-DG01基因组测序结果 | 第89页 |
5.3.5 HAdV-DG01基因组注释结果 | 第89-91页 |
5.3.6 HAdV-DG01基因组分析 | 第91-93页 |
5.3.7 基因组In-silico限制性内切酶分析结果 | 第93-95页 |
5.3.8 HAdV-DG01基因组进化分析 | 第95-99页 |
5.4 讨论 | 第99-101页 |
全文总结 | 第101-103页 |
参考文献 | 第103-118页 |
附录 英文缩略词表 | 第118-119页 |
硕士期间获得的成果 | 第119-122页 |
致谢 | 第122-123页 |