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呼吸道腺病毒的分离、鉴定及分子流行病学研究

摘要第3-10页
ABSTRACT第10-15页
第一章 前言第20-33页
    1.1 腺病毒简介第20-22页
    1.2 腺病毒的分类与分型第22-27页
        1.2.1 血清学分型第22-23页
        1.2.2 腺病毒的基因组型第23-24页
        1.2.3 腺病毒全基因组分型第24-27页
    1.3 腺病毒的流行病学第27-33页
第二章 广州腺病毒的分子流行病学研究第33-42页
    2.1 材料第33-35页
        2.1.1 常用试剂与耗材第33-34页
        2.1.2 主要仪器第34页
        2.1.3 病毒株与细胞株第34页
        2.1.4 主要培养基和常用试剂的配制第34-35页
    2.2 方法第35-37页
        2.2.1 腺病毒的培养第35页
        2.2.2 病毒DNA提取第35页
        2.2.3 引物设计第35-36页
        2.2.4 PCR反应条件第36页
        2.2.5 临床病毒株的鉴定第36-37页
    2.3 结果第37-40页
        2.3.1 引物设计第37页
        2.3.2 腺病毒分离培养结果第37-38页
        2.3.3 腺病毒通用检测引物PCR检测结果第38页
        2.3.4 腺病毒型特异性引物PCR扩增分型结果第38-39页
        2.3.5 临床分离株的检测鉴定第39-40页
    2.4 讨论第40-42页
第三章 人3型腺病毒的分离鉴定及进化分析第42-56页
    3.1 材料第42-44页
        3.1.1 常用试剂与耗材第42页
        3.1.2 主要仪器第42-43页
        3.1.3 病毒株与细胞株第43页
        3.1.4 主要培养基和常用试剂的配制第43-44页
    3.2 方法第44-48页
        3.2.1 腺病毒的培养第44页
        3.2.2 病毒DNA提取第44页
        3.2.3 引物设计第44-45页
        3.2.4 PCR反应条件第45页
        3.2.5 GZ13株腺病毒六邻体基因PCR扩增及测序第45页
        3.2.6 GZ13株六邻体蛋白基因序列分析及进化分析第45-48页
    3.3 结果第48-55页
        3.3.1 腺病毒分离培养结果第48页
        3.3.2 GZ13株腺病毒检测与初步分型结果第48-49页
        3.3.3 GZ13株六邻体基因序列测定与分析第49-51页
        3.3.4 GZ13六邻体基因组的系统进化关系分析第51-55页
    3.4 讨论第55-56页
第四章 人14型腺病毒的分离、鉴定及基因组分析第56-78页
    4.1 材料第56-58页
        4.1.1 常用试剂与耗材第56-57页
        4.1.2 主要仪器第57页
        4.1.3 病毒与细胞第57页
        4.1.4 常用试剂的配制第57-58页
    4.2 方法第58-67页
        4.2.1 腺病毒的培养第58-59页
        4.2.2 病毒核酸与病毒基因组的提取第59页
        4.2.3 引物设计第59-62页
        4.2.4 PCR反应条件第62-63页
        4.2.5 HADV-GZ01株病毒基因组测序第63页
        4.2.6 基因组注释第63-64页
        4.2.7 DNA限制性内切酶分析第64页
        4.2.8 GZ01株的生物信息学和基因组比较分析第64-67页
    4.3 结果第67-76页
        4.3.1 六邻体测序及基因组提取结果第67页
        4.3.2 基因组注释与序列分析结果第67-68页
        4.3.3 HAdV-B14/CHN/GZ01的基因组型第68-69页
        4.3.4 全基因组比较与分析第69-73页
        4.3.5 末端反向重复序列的比较和分析第73页
        4.3.6 HAdV-GZ01株的基因组进化分析第73-76页
    4.4 讨论第76-78页
第五章 人7型腺病毒的分离、鉴定及基因组分析第78-101页
    5.1 材料第78-79页
        5.1.1 常用试剂与耗材第78-79页
        5.1.2 主要仪器第79页
        5.1.3 病毒与细胞第79页
        5.1.4 常用试剂的配制第79页
    5.2 方法第79-87页
        5.2.1 腺病毒的培养第79-80页
        5.2.2 病毒核酸与病毒基因组的提取第80页
        5.2.3 引物设计第80-83页
        5.2.4 PCR反应条件第83页
        5.2.5 HAdV-DG01株病毒基因组测序第83页
        5.2.6 基因组注释第83-84页
        5.2.7 DNA限制性内切酶分析第84页
        5.2.8 HAdV-DG01株基因组进化分析第84-87页
    5.3 结果第87-99页
        5.3.1 DG01株腺病毒检测及分型结果第87-88页
        5.3.2 HAdV-DG01株分离培养结果第88页
        5.3.3 HAdV-DG01基因组提取结果第88-89页
        5.3.4 HAdV-DG01基因组测序结果第89页
        5.3.5 HAdV-DG01基因组注释结果第89-91页
        5.3.6 HAdV-DG01基因组分析第91-93页
        5.3.7 基因组In-silico限制性内切酶分析结果第93-95页
        5.3.8 HAdV-DG01基因组进化分析第95-99页
    5.4 讨论第99-101页
全文总结第101-103页
参考文献第103-118页
附录 英文缩略词表第118-119页
硕士期间获得的成果第119-122页
致谢第122-123页

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