| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 1. 引言 | 第12-29页 |
| 1.1. 研究背景 | 第12-15页 |
| 1.2. 相关理论简介 | 第15-19页 |
| 1.2.1. 溯祖理论(coalescent theory) | 第15-16页 |
| 1.2.2. 有效种群大小(Effective population size) | 第16页 |
| 1.2.3. 自然选择(nature selection) | 第16页 |
| 1.2.4. 随机漂变(genetic drift) | 第16-17页 |
| 1.2.5. 基因流(gene flow) | 第17页 |
| 1.2.6. 贝叶斯近似计算(Approximate Bayesian Computation,简称ABC) | 第17-19页 |
| 1.3. 分子标记技术 | 第19-25页 |
| 1.3.1. 分子标记检测技术 | 第19-20页 |
| 1.3.2. 分子标记在红树植物研究中的应用 | 第20-25页 |
| 1.4. 秋茄研究的概况 | 第25-27页 |
| 1.4.1. 秋茄的基本特征 | 第25页 |
| 1.4.2. 秋茄的研究进展 | 第25-27页 |
| 1.5. 秋茄研究中存在的问题及本研究的目的与意义 | 第27-29页 |
| 1.5.1. 存在的问题 | 第27-28页 |
| 1.5.2. 研究内容 | 第28页 |
| 1.5.3. 研究的目的与意义 | 第28-29页 |
| 2. 野外材料采集及DNA提取 | 第29-37页 |
| 2.1. 采集时间与采集方法 | 第29页 |
| 2.2. 采集地概况 | 第29-33页 |
| 2.3. DNA的提取 | 第33-37页 |
| 3. 基于AFLP对种群遗传结构及地理分布格局分析 | 第37-62页 |
| 3.1. 选取DNA样品与AFLP实验方法 | 第37-40页 |
| 3.1.1. 选取DNA样品 | 第37页 |
| 3.1.2. AFLP实验步骤 | 第37-40页 |
| 3.2. 数据处理与分析 | 第40-46页 |
| 3.2.1. 数据分析 | 第40-46页 |
| 3.3. 结果与分析 | 第46-57页 |
| 3.3.1. AFLP扩增结果多态性及中性检测 | 第46页 |
| 3.3.2. 遗传多样性参数 | 第46-48页 |
| 3.3.3. 有效种群大小 | 第48页 |
| 3.3.4. 自然种群遗传结构差异 | 第48-50页 |
| 3.3.5. 自然种群基因组成同质性及归群 | 第50-53页 |
| 3.3.6. 自然种群间基因流分析 | 第53-54页 |
| 3.3.7. 遗传距离与地理距离的相关性 | 第54-55页 |
| 3.3.8. 自然种群基因频率分布 | 第55页 |
| 3.3.9. 原生林遗传结构与人工林种群间的比较 | 第55-57页 |
| 3.4. 讨论 | 第57-61页 |
| 3.4.1. 秋茄种群遗传结构特点及形成原因 | 第57-58页 |
| 3.4.2. 秋茄种群分化及其地理格局形成的原因 | 第58-61页 |
| 3.4.3. 造林过程中人为选择种苗引起遗传结构表现 | 第61页 |
| 3.5. 小结与建议 | 第61-62页 |
| 4. 基于SSR分析种群遗传结构及种群间的亲缘地理关系 | 第62-92页 |
| 4.1. 选取DNA样品与SSR实验方法 | 第62-64页 |
| 4.1.1. 选取DNA样品 | 第62页 |
| 4.1.2. SSR分子标记实验步骤 | 第62-64页 |
| 4.2. 数据分析 | 第64-69页 |
| 4.2.1. 等位基因类型分析 | 第64-65页 |
| 4.2.2. 种群遗传多样性分析 | 第65-66页 |
| 4.2.3. 度量种群遗传的分化 | 第66页 |
| 4.2.4. 种群遗传结构 | 第66页 |
| 4.2.5. 瓶颈效应及基因流估算 | 第66-67页 |
| 4.2.6. 贝叶斯近似计算(Approximate Bayesian Computation,简称ABC)模型建构及评估 | 第67-69页 |
| 4.2.7. 叶绿体DNA的SSR数据处理 | 第69页 |
| 4.3. 结果与分析 | 第69-82页 |
| 4.3.1. 种群内等位基因类型与遗传多样性参数 | 第69-70页 |
| 4.3.2. 种群遗传分化 | 第70-72页 |
| 4.3.3. 遗传组成相似性及归群分析 | 第72-73页 |
| 4.3.4. 瓶颈效应及基因流估算 | 第73-76页 |
| 4.3.5. 种群起源及迁移路线的推测 | 第76-78页 |
| 4.3.6. 叶绿体DNA遗传多样性参数分析 | 第78页 |
| 4.3.7. 秋茄种群单倍型分析 | 第78-79页 |
| 4.3.8. 基于叶绿体DNA遗传结构组成分析 | 第79-80页 |
| 4.3.9. 叶绿体DNA遗传结构差异 | 第80-82页 |
| 4.4. 讨论 | 第82-90页 |
| 4.4.1. 遗传多样性分析 | 第82-83页 |
| 4.4.2. 种群起源及迁移路线 | 第83-86页 |
| 4.4.3. 种群分化的原因 | 第86-88页 |
| 4.4.4. 人工林与原生林之间的比较 | 第88-90页 |
| 4.5. 小结及建议 | 第90-92页 |
| 5. 结论、创新与展望 | 第92-95页 |
| 5.1. 结论 | 第92-93页 |
| 5.1.1. 秋茄种群遗传结构的多样性 | 第92页 |
| 5.1.2. 秋茄种群地理分布形成的原因 | 第92-93页 |
| 5.1.3. 秋茄种群形成分化 | 第93页 |
| 5.1.4. 人工林遗传结构的特点 | 第93页 |
| 5.2. 研究创新点 | 第93页 |
| 5.3. 研究展望 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-105页 |
| 个人简介 | 第105-106页 |
| 导师简介 | 第106-107页 |
| 获得成果目录 | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
| 附表 | 第109-116页 |
| 附表1 引物物及参考文献 | 第109-110页 |
| 附表2 Geneclass2软件计算种群间的基因流情况 | 第110-116页 |
