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磷酸原激酶的结构与功能研究

摘 要第4-5页
ABSTRACT第5页
主要符号对照表第11-13页
第一章 引言第13-41页
    1.1 磷酸原激酶概述第13-18页
    1.2 肌酸激酶(CK)第18-25页
        1.2.1 肌酸激酶的分布及生理功能第18-19页
        1.2.2 肌酸激酶的同工酶及分布第19页
        1.2.3 肌酸激酶的结构第19-20页
        1.2.4 肌酸激酶的活性中心第20-22页
        1.2.5 肌酸激酶的亚基界面第22页
        1.2.6 肌酸激酶亚基之间的相互作用第22-24页
        1.2.7 肌酸激酶的纯化和活性测定第24页
        1.2.8 肌酸激酶的体外去折叠与再折叠的研究第24-25页
    1.3 精氨酸激酶(AK)第25-33页
        1.3.1 精氨酸激酶的分子形式第26-27页
        1.3.2 精氨酸激酶的结构第27-30页
        1.3.3 精氨酸激酶的活性中心和催化机制研究第30-32页
        1.3.4 外界因素对精氨酸激酶的影响第32-33页
        1.3.5 精氨酸激酶的测活方法第33页
    1.4 CK和AK之间的进化关系第33-35页
    1.5 蛋白质折叠研究概述第35-39页
        1.5.1 维系蛋白质结构的作用力第35页
        1.5.2 蛋白质的变性第35-36页
        1.5.3 常用的蛋白质变性剂第36页
        1.5.4 研究蛋白质折叠的常用技术第36页
        1.5.5 蛋白质的去折叠途径第36-37页
        1.5.6 蛋白质的部分折叠态第37-38页
        1.5.7 蛋白质折叠过渡态第38-39页
    1.6 本论文的研究目的和主要内容第39-41页
第二章 N末端氨基酸缺失对肌酸激酶结构和功能的影响第41-70页
    2.1 前言第41-42页
    2.2 实验材料与方法第42-50页
        2.2.1 试验材料第42-43页
        2.2.2 兔肌CK cDNA 的克隆第43-45页
        2.2.3 兔肌CK的表达第45页
        2.2.4 兔肌CK的纯化第45页
        2.2.5 兔肌CK 的N末端缺失突变体的获得第45-47页
        2.2.6 测活方法以及Km的测定第47-48页
        2.2.7 突变体CKND6与野生型CK的变性第48页
        2.2.8 光谱学方法检测第48页
        2.2.9 凝胶过滤层析(SEC)第48页
        2.2.10 差示扫描量热实验(DSC)第48-49页
        2.2.11 脲梯度电泳(UGGE)第49页
        2.2.12 核磁共振实验 (NMR)第49-50页
    2.3 实验结果第50-66页
        2.3.1 酶基因的克隆第50-52页
        2.3.2 缺失突变体重组质粒pCKND6的构建第52页
        2.3.3 蛋白质表达和纯化第52-54页
        2.3.4 比活和米氏常数的测定第54页
        2.3.5 野生型CK和突变体CKND6的凝胶过滤层析第54页
        2.3.6 野生型CK和突变体CKND6的CD光谱和内源荧光光谱第54-57页
        2.3.7 在变性剂脲中的稳定性比较第57-62页
            2.3.7.1 突变体CKND6与野生型CK在脲溶液中的活性变化第57页
            2.3.7.2 突变体CKND6与野生型CK在脲溶液中的荧光变化第57-58页
            2.3.7.3 突变体CKND6与野生型CK在脲溶液中的ANS荧光变化第58-59页
            2.3.7.4 突变体CKND6与野生型CK在脲溶液中的CD光谱变化第59-60页
            2.3.7.5 突变体CKND6与野生型CK在不同浓度脲溶液中的凝胶过滤层析(SEC)第60-61页
            2.3.7.6 野生型CK与突变体CKND6的脲梯度电泳(UGGE)第61-62页
        2.3.8 突变体CKND6与野生型CK的热稳定性比较第62-63页
        2.3.9 突变体CKND6与野生型CK的NMR一维谱比较第63-66页
    2.4 讨论第66-70页
第三章 海参双亚基精氨酸激酶的原核表达和蛋白质纯化第70-82页
    3.1 前言第70页
    3.2 实验材料与方法第70-75页
        3.2.1 试验材料第70-71页
        3.2.2 AK cDNA 的克隆第71-73页
        3.2.3 AK的表达第73页
        3.2.4 AK的纯化第73页
        3.2.5 AK的活性测定第73-75页
        3.2.6 等电聚焦电泳(IEF)第75页
        3.2.7 光谱学方法检测第75页
    3.3 实验结果和讨论第75-82页
        3.3.1 基因的克隆第75-77页
        3.3.2 基因的表达和纯化第77-79页
        3.3.3 精氨酸激酶的理化性质分析第79-82页
第四章 海参双亚基精氨酸激酶的去折叠研究第82-92页
    4.1 前言第82页
    4.2 实验材料与方法第82-83页
        4.2.1 试验试剂第82页
        4.2.2 AK蛋白的纯化和测活第82-83页
        4.2.3 脲处理第83页
        4.2.4 光谱学方法检测第83页
        4.2.5 凝胶过滤层析(SEC)第83页
        4.2.6 脲梯度电泳(UGGE)第83页
    4.3 实验结果第83-90页
        4.3.1 精氨酸激酶在不同浓度脲溶液中的活性变化第83-84页
        4.3.2 不同浓度脲作用下精氨酸激酶的三级结构变化第84-87页
        4.3.3 不同浓度脲作用下精氨酸激酶的二级结构变化第87-89页
        4.3.4 精氨酸激酶在脲溶液中的亚基解聚第89-90页
        4.3.5 精氨酸激酶的脲梯度电泳(UGGE)第90页
    4.4 讨论第90-92页
第五章 精氨酸激酶及其底物复合物的结晶和初步晶体学研究第92-99页
    5.1 前言第92页
    5.2 材料与方法第92-93页
        5.2.1 酶蛋白的获得第92页
        5.2.2 晶体生长第92-93页
        5.2.3 X-射线衍射实验第93页
        5.2.4 用分子置换法求取相位第93页
    5.3 结果第93-97页
        5.3.1 结晶第93-94页
        5.3.2 X-射线衍射图样的采集及晶胞参数的测定第94-96页
        5.3.3 每个不对称单位内蛋白分子数目的确定第96页
        5.3.4 用分子置换法求取相位第96-97页
    5.4 讨论第97-99页
第六章 结论第99-102页
参考文献第102-119页
致谢及声明第119-120页
个人简历、在学期间的研究成果及发表的论文第120-121页

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