中文摘要 | 第3-4页 |
英文摘要 | 第4页 |
引言 | 第7-8页 |
第一章 绪论 | 第8-12页 |
1.1 B细胞表位预测研究背景 | 第8-9页 |
1.1.1 线性B细胞表位预测简介 | 第8-9页 |
1.1.2 构象性B细胞表位预测简介 | 第9页 |
1.2 研究目的与意义 | 第9页 |
1.3 国内外研究现状 | 第9-10页 |
1.4 本文主要研究内容 | 第10-12页 |
第二章 相关背景知识介绍 | 第12-18页 |
2.1 线性B细胞表位预测相关数据库简介 | 第12-13页 |
2.1.1 BciPep数据库 | 第12页 |
2.1.2 AAindex数据库 | 第12-13页 |
2.2 线性B细胞表位预测方法简介 | 第13-15页 |
2.2.1 ABCPred | 第14页 |
2.2.2 BCPred | 第14页 |
2.2.3 COBEpro | 第14页 |
2.2.4 BayesB | 第14页 |
2.2.5 CBTOPE | 第14-15页 |
2.3 机器学习相关知识简介 | 第15-18页 |
2.3.1 主成分分析 | 第15页 |
2.3.2 支持向量机 | 第15-16页 |
2.3.3 核函数 | 第16-18页 |
第三章 基于PCA和SVM的线性B细胞表位预测研究 | 第18-26页 |
3.1 数据集的构建 | 第18-19页 |
3.1.1 原始训练数据集 | 第18页 |
3.1.2 精简测试数据集 | 第18-19页 |
3.1.3 测试和训练数据集图表 | 第19页 |
3.2 特征提取 | 第19-23页 |
3.2.1 氨基酸特征 | 第20页 |
3.2.2 序列特征 | 第20-21页 |
3.2.3 结构特征 | 第21-22页 |
3.2.4 其它特征 | 第22-23页 |
3.3 基于PCA的线性B细胞表位预测方法 | 第23-24页 |
3.4 基于SVM的线性B细胞表位预测方法 | 第24-25页 |
3.5 小结 | 第25-26页 |
第四章 测试结果和分析 | 第26-33页 |
4.1 评价参数 | 第26-27页 |
4.2 基于PCA和SVM的线性B细胞表位预测结果 | 第27-29页 |
4.2.1 基于PCA和SVM的线性B细胞表位预测测试数据集分析 | 第27-28页 |
4.2.2 基于PCA和SVM的线性B细胞表位预测结果分析 | 第28-29页 |
4.3 算法结果分析 | 第29-31页 |
4.3.1 本文参数分析 | 第29页 |
4.3.2 与其它结果比较分析 | 第29-31页 |
4.4 小结 | 第31-33页 |
第五章 结论与展望 | 第33-35页 |
5.1 全文总结 | 第33页 |
5.2 研究展望 | 第33-35页 |
参考文献 | 第35-38页 |
英文缩略表 | 第38-39页 |
致谢 | 第39-40页 |
在学期间公开发表论文及著作情况 | 第40页 |