| 摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第12-18页 |
| 1.1 测序技术 | 第12-14页 |
| 1.1.1 第一代测序技术 | 第12页 |
| 1.1.2 第二代测序技术 | 第12-13页 |
| 1.1.3 第三代测序技术 | 第13-14页 |
| 1.2 DNA测序文库的构建 | 第14页 |
| 1.3 Barcode（Index） | 第14-15页 |
| 1.4 R语言 | 第15-17页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第17-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-20页 |
| 2.1 Barcode设计原则 | 第18页 |
| 2.2 Barcode的设计方法 | 第18页 |
| 2.3 Barcode的设计步骤 | 第18-20页 |
| 3 结果与分析 | 第20-41页 |
| 3.1 Barcode的设计结果 | 第20-24页 |
| 3.1.1 下载安装 | 第20-22页 |
| 3.1.2 程序包调入 | 第22-24页 |
| 3.2 Barcode设计代码 | 第24-41页 |
| 3.2.1 排列组合的生成 | 第24-30页 |
| 3.2.2 特殊碱基序列的删除 | 第30-32页 |
| 3.2.3 重复序列的删除 | 第32-34页 |
| 3.2.4 酶切位点的删除 | 第34-37页 |
| 3.2.5 数字与字母的替换 | 第37-41页 |
| 4 讨论 | 第41-46页 |
| 4.1 Barcode语句设计 | 第41-42页 |
| 4.2 影响Barcode设计的因素 | 第42-44页 |
| 4.2.1 Barcode设计的位置与长度的影响 | 第42-43页 |
| 4.2.2 酶切位点对barcode设计的影响 | 第43页 |
| 4.2.3 同源性对barcode设计的影响 | 第43-44页 |
| 4.3 设计barcode与现有barcode对比 | 第44页 |
| 4.4 Barcode与DNA barcode区别 | 第44-46页 |
| 5 结论 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第53页 |