| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-19页 |
| 1.1 亚洲栽培稻的起源研究进展 | 第11-13页 |
| 1.1.1 亚洲栽培稻起源式样的研究进展 | 第11-12页 |
| 1.1.2 亚洲栽培稻祖先类型的研究进展 | 第12-13页 |
| 1.1.3 亚洲栽培稻起源地点的研究进展 | 第13页 |
| 1.2 群体遗传结构评估和选择信号检测在植物驯化中的研究进展 | 第13-16页 |
| 1.2.1 群体遗传结构评估在植物驯化研究中的进展 | 第13-15页 |
| 1.2.2 选择信号检测在植物驯化研究中的进展 | 第15-16页 |
| 1.3 叶绿体基因组在物种形成研究中的应用 | 第16-17页 |
| 1.3.1 基因流是物种形成的关键因素 | 第16页 |
| 1.3.2 叶绿体基因组的结构特征及其在物种进化研究中的应用 | 第16-17页 |
| 1.4 水稻起源方式和驯化机制研究进展中存在的问题 | 第17-18页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第18页 |
| 1.6 技术路线 | 第18-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-25页 |
| 2.1 实验材料 | 第19-21页 |
| 2.1.1 样品收集 | 第19-20页 |
| 2.1.2 种子发芽实验 | 第20-21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-22页 |
| 2.2.1 叶绿体DNA的提取 | 第21页 |
| 2.2.2 叶绿体全基因组测序 | 第21-22页 |
| 2.3 数据统计与分析 | 第22-25页 |
| 2.3.1 叶绿体全基因组组装 | 第22-23页 |
| 2.3.2 基因结构及功能注释 | 第23-24页 |
| 2.3.3 全基因组变异检测分析 | 第24-25页 |
| 第三章 结果与分析 | 第25-41页 |
| 3.1 栽培稻及其近缘野生种的叶绿体基因组变异 | 第25-31页 |
| 3.2 群体遗传结构评估 | 第31-37页 |
| 3.2.1 群体结构分析 | 第31页 |
| 3.2.2 PCA分析 | 第31-32页 |
| 3.2.3 Network网络图构建 | 第32-37页 |
| 3.3 基于叶绿体的亚洲栽培稻群体基因流及其遗传多样性 | 第37-41页 |
| 3.3.1 群体间和群体内基因流 | 第37-38页 |
| 3.3.2 多样性参数 | 第38-39页 |
| 3.3.3 中性检验 | 第39-41页 |
| 第四章 讨论 | 第41-42页 |
| 4.1 基于叶绿体分析的栽培稻群体结构和基因流 | 第41页 |
| 4.2 基因流对群体遗传参数的影响 | 第41-42页 |
| 第五章 全文结论 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 作者简历 | 第50页 |
