| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 1 文献综述 | 第11-19页 |
| 1.1 甘蓝型油菜隐性细胞核雄性不育研究进展 | 第11-13页 |
| 1.2 研究方法综述 | 第13-16页 |
| 1.2.1 转录组学研究进展 | 第13-15页 |
| 1.2.1.1 转录组测序技术简介 | 第13-14页 |
| 1.2.1.2 转录组测序技术的应用 | 第14-15页 |
| 1.2.2 基因组重测序研究进展 | 第15-16页 |
| 1.2.2.1 基因组重测序技术简介 | 第15页 |
| 1.2.2.2 基因组重测序技术的应用 | 第15-16页 |
| 1.3 本研究的主要内容与目的意义 | 第16-19页 |
| 2 两型系SLAB花发育的细胞学比较分析 | 第19-27页 |
| 2.1 试验材料 | 第19-20页 |
| 2.1.1 材料来源 | 第19页 |
| 2.1.2 主要试剂及器材 | 第19-20页 |
| 2.2 试验方法 | 第20-22页 |
| 2.2.1 扫描电镜样品制备与观察 | 第20页 |
| 2.2.2 石蜡切片的制备与观察 | 第20-22页 |
| 2.3 结果与分析 | 第22-27页 |
| 2.3.1 两型系SLA和SLB花发育形态学观察 | 第22-23页 |
| 2.3.2 两型系SLA和SLB雄蕊扫描电镜分析 | 第23-24页 |
| 2.3.3 两型系SLA和SLB花药细胞学观察 | 第24-27页 |
| 3 两型系SLAB花蕾发育的转录组学比较分析 | 第27-41页 |
| 3.1 试验材料 | 第27页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第27页 |
| 3.1.2 主要试剂与仪器 | 第27页 |
| 3.2 试验方法与步骤 | 第27-33页 |
| 3.2.1 两型系SLAB花蕾等组织总RNA提取 | 第27-29页 |
| 3.2.2 转录组建库测序 | 第29页 |
| 3.2.3 原始数据过滤处理 | 第29页 |
| 3.2.4 比对参考基因组 | 第29-30页 |
| 3.2.5 基因表达量计算 | 第30-31页 |
| 3.2.6 差异表达基因筛选 | 第31页 |
| 3.2.7 GO注释及分类 | 第31页 |
| 3.2.8 KEGG代谢途径显著富集分析 | 第31-32页 |
| 3.2.9 mRNA反转录 | 第32页 |
| 3.2.10 实时荧光定量PCR分析 | 第32-33页 |
| 3.3 结果与分析 | 第33-41页 |
| 3.3.1 测序数据质量评估 | 第33-34页 |
| 3.3.2 数据比对结果统计 | 第34-35页 |
| 3.3.3 差异表达基因的筛选 | 第35页 |
| 3.3.4 GO功能分析 | 第35-39页 |
| 3.3.5 KEGG代谢途径富集分析 | 第39-41页 |
| 4 两型系SLAB基因组重测序比较分析 | 第41-59页 |
| 4.1 试验材料 | 第41页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第41页 |
| 4.1.2 试剂和仪器 | 第41页 |
| 4.2 试验方法 | 第41-46页 |
| 4.2.1 两型系SLAB叶片DNA提取 | 第41-42页 |
| 4.2.2 基因组建库测序 | 第42页 |
| 4.2.3 原始数据过滤质控及比对分析 | 第42-43页 |
| 4.2.4 SNP和Indel变异位点检测 | 第43-44页 |
| 4.2.5 SNP和Indel变异位点注释 | 第44-46页 |
| 4.3 结果与分析 | 第46-55页 |
| 4.3.1 测序数据质量评估 | 第46-47页 |
| 4.3.2 数据比对结果统计 | 第47页 |
| 4.3.3 SNP和Indel变异位点统计分析 | 第47-49页 |
| 4.3.4 SNP和Indel在不同染色体上的分布 | 第49-50页 |
| 4.3.5 SNP和Indel在染色体上位置的分布 | 第50-51页 |
| 4.3.6 SNP和Indel在甘蓝型油菜基因组中的分布特点 | 第51-52页 |
| 4.3.7 SNP和Indel变异位点基因位置注释分析 | 第52-54页 |
| 4.3.8 发生变异基因的GO功能富集分析 | 第54-55页 |
| 4.4 转录组与重测序结果比较分析 | 第55-56页 |
| 4.4.1 关键候选基因初步筛选 | 第55页 |
| 4.4.2 育性相关的候选基因筛选鉴定 | 第55-56页 |
| 4.5 育性候选基因的qRT-PCR验证分析 | 第56-59页 |
| 5 讨论 | 第59-63页 |
| 5.1 两型系SLAB遗传学和细胞学特点 | 第59-60页 |
| 5.2 两型系SLAB花蕾发育的转录组学分析 | 第60页 |
| 5.3 两型系SLAB基因组重测序分析 | 第60-61页 |
| 5.4 两型系SLAB育性候选基因的筛选 | 第61-63页 |
| 6 结论 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-69页 |
| 致谢 | 第69-71页 |
| 作者简介 | 第71-73页 |
| 附表1 两型系SLAB转录组差异表达基因 | 第73-77页 |
| 附表2 差异基因qRT-PCR引物列表 | 第77页 |
