| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第1章 绪论 | 第13-21页 |
| 1.1 川芎的生物学特性 | 第13-14页 |
| 1.2 川芎的药理作用 | 第14-17页 |
| 1.2.1 传统中药作用 | 第14页 |
| 1.2.2 对中枢神经的作用 | 第14-15页 |
| 1.2.3 对心脏作用 | 第15页 |
| 1.2.4 对平滑肌作用 | 第15-16页 |
| 1.2.5 对肾脏作用 | 第16页 |
| 1.2.6 抑制血管收缩 | 第16页 |
| 1.2.7 抗衰老和抗辐射 | 第16-17页 |
| 1.2.8 其它作用 | 第17页 |
| 1.3 川芎主要成分 | 第17-19页 |
| 1.3.1 有机酸类 | 第17-18页 |
| 1.3.2 生物碱类 | 第18页 |
| 1.3.3 挥发油 | 第18-19页 |
| 1.4 转录组测序 | 第19-20页 |
| 1.5 本文的研究目的和意义 | 第20-21页 |
| 第2章 川芎根茎、叶转录组学分析 | 第21-38页 |
| 2.1 材料与方法 | 第21-26页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第21-22页 |
| 2.1.2 川芎根茎、叶总RNA提取 | 第22页 |
| 2.1.3 转录组测序 | 第22-23页 |
| 2.1.4 测序的数据统计与评估 | 第23-24页 |
| 2.1.5 序列组装 | 第24页 |
| 2.1.6 Unigene数据库构建 | 第24-25页 |
| 2.1.7 Unigene的功能注解 | 第25页 |
| 2.1.8 Unigene的结构分析 | 第25-26页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第26-37页 |
| 2.2.1 川芎根茎、叶总RNA提取 | 第26-27页 |
| 2.2.2 测序统计与质量分析 | 第27-28页 |
| 2.2.3 序列组装结果 | 第28-29页 |
| 2.2.4 RNA-seq序列比对结果 | 第29-30页 |
| 2.2.5 基因GO功能分析 | 第30-33页 |
| 2.2.6 COG功能分类 | 第33-35页 |
| 2.2.7 KEGG代谢通路分析 | 第35-36页 |
| 2.2.8 SSR | 第36-37页 |
| 2.3 本章小结 | 第37-38页 |
| 第3章 川芎根茎、叶转录组差异表达基因分析 | 第38-50页 |
| 3.1 材料与方法 | 第38-39页 |
| 3.1.1 转录组数据 | 第38页 |
| 3.1.2 Unigene表达量分析 | 第38-39页 |
| 3.1.3 差异表达基因筛选 | 第39页 |
| 3.1.4 差异表达基因分析 | 第39页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第39-49页 |
| 3.2.1 样品表达量评估 | 第39-40页 |
| 3.2.2 川芎根茎、叶中高表达的Unigenes | 第40-42页 |
| 3.2.3 差异表达基因(DEG)筛选 | 第42-43页 |
| 3.2.4 差异表达基因的GO分布 | 第43-44页 |
| 3.2.5 差异表达基因的COG分布 | 第44-46页 |
| 3.2.6 差异表达转录因子 | 第46-47页 |
| 3.2.7 与根茎发育相关的差异表达基因挖掘 | 第47-49页 |
| 3.3 本章小结 | 第49-50页 |
| 第4章 川芎qPCR内参基因选择 | 第50-60页 |
| 4.1 材料与方法 | 第50-52页 |
| 4.1.1 川芎总RNA的提取与cDNA的制备 | 第50-51页 |
| 4.1.2 内参引物设计 | 第51页 |
| 4.1.3 qPCR扩增 | 第51页 |
| 4.1.4 川芎候选内参基因稳定性分析 | 第51-52页 |
| 4.1.5 川芎候选内参基因稳定性分析 | 第52页 |
| 4.2 结果与分析 | 第52-58页 |
| 4.2.1 RNA的提取 | 第52-53页 |
| 4.2.2 候选内参基因的选择和引物设计 | 第53-55页 |
| 4.2.3 川芎候选内参基因引物特异性 | 第55页 |
| 4.2.4 川芎候选内参基因的表达谱 | 第55-56页 |
| 4.2.5 川芎内参基因筛选 | 第56-58页 |
| 4.2.6 qRT-PCR验证 | 第58页 |
| 4.3 本章小结 | 第58-60页 |
| 第5章 阿魏酸生物合成路径 | 第60-68页 |
| 5.1 材料与方法 | 第60-61页 |
| 5.1.1 阿魏酸的化学结构 | 第60页 |
| 5.1.2 阿魏酸的药理活性 | 第60-61页 |
| 5.1.3 阿魏酸的生物合成路径 | 第61页 |
| 5.1.4 阿魏酸关键酶基因研究 | 第61页 |
| 5.1.5 差异表达基因分析 | 第61页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第61-66页 |
| 5.2.1 阿魏酸生物合成路径 | 第61-63页 |
| 5.2.2 阿魏酸合成路径基因研究 | 第63-64页 |
| 5.2.3 差异表达基因 | 第64-65页 |
| 5.2.4 关键酶基因COMT分析 | 第65-66页 |
| 5.3 本章小结 | 第66-68页 |
| 结论 | 第68-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-77页 |
| 附录 | 第77-88页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文及科研成果 | 第88页 |