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厚荚相思器官发生途径microRNA及其靶基因的鉴定与表达研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
论文主要引用符号的中英文缩略词第8-9页
论文表目录第9-10页
论文图目录第10-14页
第一章 绪论第14-42页
    1. 研究背景、目的及意义第14-15页
    2. 国内外研究进展第15-38页
        2.1 植物miRNA的生物合成第15-18页
            2.1.1 生物合成第15-16页
            2.1.2 基因组织形式第16-18页
        2.2 植物miRNA的作用机制第18-19页
            2.2.1 miRNA的剪切作用第18页
            2.2.2 miRNA的翻译抑制第18-19页
            2.2.3 miRNA介导的DNA甲基化第19页
        2.3 植物miRNA的识别与鉴定方法第19-25页
            2.3.1 miRNA的识别方法第19-21页
            2.3.2 miRNA表达的鉴定第21-23页
            2.3.3 植物新miRNA的鉴定标准第23-24页
            2.3.4 miRNA靶基因的预测与鉴定方法第24-25页
        2.4 植物miRNA的生物功能调控第25-29页
            2.4.1 miRNA对植物细胞命运与形态的调控第25-27页
            2.4.2 miRNA对植物响应逆境环境的调控第27-28页
            2.4.3 miRNA参与植物的信号转导第28-29页
        2.5 豆科植物miRNA的研究第29-37页
            2.5.1 豆科植物小RNA的鉴定第30页
            2.5.2 豆科植物保守小RNA与植物的发育第30-32页
            2.5.3 豆科植物miRNA与非生物胁迫第32-33页
            2.5.4 豆科植物miRNA与丛枝菌根共生体第33-34页
            2.5.5 豆科植物miRNA与共生固氮第34-36页
            2.5.6 豆科植物miRNA与根瘤菌共生体系第36-37页
        2.6 miRNA对植物器官发生的调控第37-38页
            2.6.1 植物器官发生相关miRNA第37-38页
            2.6.2 植物不定芽再生相关miRNA第38页
    3. 研究目标与主要内容第38-40页
        3.1 研究目标第38-39页
        3.2 主要研究内容第39-40页
    4. 技术路线第40-42页
第二章 厚荚相思器官发生途径保守和新miRNA的鉴定第42-62页
    1. 前言第42-43页
    2. 材料与方法第43-46页
        2.1 试验材料第43页
        2.2 总RNA提取与高通量测序第43-44页
        2.3 参考数据信息第44页
        2.4 生物信息学分析第44-46页
    3. 结果与分析第46-49页
        3.1 sRNA文库测序结果与分析第46-47页
        3.2 厚荚相思保守miRNAs的鉴定第47-48页
        3.3 厚荚相思新miRNA的发现第48-49页
    4. 讨论第49-51页
        4.1 厚荚相思器官发生途径的小RNA第50页
        4.2 厚荚相思器官发生途径miRNA的鉴定第50-51页
    5. 小结第51-62页
第三章 基于基因芯片对厚荚相思器官发生途径miRNA研究第62-78页
    1. 前言第62页
    2. 材料与方法第62-65页
        2.1 植物材料的获取第62-63页
        2.2 样品总RNA提取第63页
        2.3 miRNA定制芯片的探针布局第63-64页
        2.4 miRNA芯片杂交第64-65页
        2.5 数据分析第65页
    3. 结果与分析第65-67页
        3.1 豆科植物miRNA在厚荚相思中的表达第65-66页
        3.2 厚荚相思已鉴定miRNA在基因芯片中的检测第66页
        3.3 厚英相思器官发生过程差异miRNA的比较筛选第66-67页
    4. 讨论第67-68页
    5. 小结第68-78页
第四章 厚荚相思器官发生途径miRNA靶基因预测与分析第78-94页
    1. 前言第78页
    2. 材料与方法第78-79页
        2.1 miRNA靶基因预测第78页
        2.2 miRNA预测靶基因的功能分类第78-79页
        2.3 5'RACE对靶基因的验证第79页
    3. 结果与分析第79-82页
        3.1 厚荚相思miRNA预测靶基因第79-80页
        3.2 靶基因功能分类第80页
        3.3 miRNA与靶基因的作用方式检测第80-82页
    4. 讨论第82页
    5. 小结第82-83页
    附表第83-94页
第五章 厚荚相思器官发生途径miRNA表达的验证与分析第94-106页
    1. 前言第94页
    2. 材料与方法第94-97页
        2.1 试验材料第94页
        2.2 小RNA的提取第94-95页
        2.3 cDNA第一链合成第95页
        2.4 荧光定量PCR第95-96页
            2.4.1 内参基因第95-96页
            2.4.2 引物第96页
            2.4.3 荧光定量PCR试验方法第96页
        2.5 数据分析第96-97页
    3. 结果与分析第97-100页
        3.1 荧光定量曲线分析第97页
        3.2 厚荚相思器官发生过程miRNA的表达模式第97-100页
    4. 讨论第100-103页
        4.1 miRNA的选择第100-101页
        4.2 厚荚相思器官发生过程miRNA组织特异性分析第101-103页
    5. 小结第103-106页
第六章 结论与展望第106-108页
    1. 主要结论第106页
    2. 整体展望第106-107页
    3. 论文创新点第107-108页
参考文献第108-126页
个人简介第126-128页
导师简介第128-130页
致谢第130页

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