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人端粒酶RNA(hTER)的纯化与结构解析

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-9页
第1章 绪论第13-26页
    1.1 引言第13页
    1.2 端粒酶的研究现状第13-17页
        1.2.1 端粒酶的发现第14页
        1.2.2 端粒酶的发展第14-15页
        1.2.3 端粒酶逆转录酶TERT第15页
        1.2.4 端粒酶RNA亚基TER第15-16页
        1.2.5 端粒酶TERT-TER复合体第16页
        1.2.6 人端粒酶的研究第16-17页
    1.3 人端粒酶RNA的研究现状第17-20页
        1.3.1 人端粒酶RNA的结构特点第17-19页
        1.3.2 人端粒酶RNA的结构与作用第19页
        1.3.3 人端粒酶RNA的结构与功能的研究意义第19-20页
    1.4 人端粒酶RNA研究的现存问题第20-21页
        1.4.1 人端粒酶RNA结构研究中的问题第20页
        1.4.2 改进方法第20-21页
    1.5 SHAPE化学法的应用第21-24页
        1.5.1 SHAPE化学法的机理第21-22页
        1.5.2 亲电子物质选择与应用第22-23页
        1.5.3 SHAPE实验的数据分析第23-24页
    1.6 文章主要内容及创新点第24-26页
        1.6.1 主要内容第24-25页
        1.6.2 创新点第25-26页
第2章 人端粒酶RNA基因模板的设计与体外扩增第26-36页
    2.1 实验仪器与材料第26-28页
        2.1.1 实验仪器与设备第26-27页
        2.1.2 实验材料与试剂第27-28页
        2.1.3 常用试剂配置第28页
    2.2 实验方法第28-31页
        2.2.1 含hTER基因的质粒设计与质粒抽提第28-29页
        2.2.2 PCR体系与条件的初步设计第29-31页
    2.3 结果与讨论第31-34页
        2.3.1 含hTER基因的质粒设计与质粒抽提第31-32页
        2.3.2 PCR体系与条件的初步设计结果第32-34页
    2.4 本章小结第34-36页
第3章 hTER的体外转录与纯化第36-45页
    3.1 实验仪器与材料第36-38页
        3.1.1 实验仪器与设备第36-37页
        3.1.2 实验材料与试剂第37-38页
        3.1.3 常用试剂配制第38页
    3.2 实验方法第38-41页
        3.2.1 hTER-Shape DNA模板制备第38-40页
        3.2.2 体外转录体系第40页
        3.2.3 RNA的纯化第40-41页
    3.3 结果和讨论第41-44页
        3.3.1 hTER-Shape DNA模板的制备结果第41-43页
        3.3.2 体外转录与RNA纯化的结果第43-44页
    3.4 本章小结第44-45页
第4章 hTER的SHAPE实验第45-57页
    4.1 实验仪器与材料第45-48页
        4.1.1 实验仪器与设备第45-46页
        4.1.2 实验材料与试剂第46-47页
        4.1.3 常用试剂配制第47-48页
    4.2 实验方法第48-51页
        4.2.1 逆转录酶测试实验第48页
        4.2.2 RNA反转录条件的摸索与优化第48-49页
        4.2.3 RNA的复性第49页
        4.2.4 RNA的化学修饰第49-50页
        4.2.5 RNA的测序第50页
        4.2.6 SHAPE化学法综合实验第50-51页
    4.3 结果和讨论第51-56页
        4.3.1 逆转录酶测试实验第51-52页
        4.3.2 RNA反转录条件的摸索与优化第52-53页
        4.3.3 RNA的复性第53页
        4.3.4 RNA的化学修饰第53-54页
        4.3.5 RNA的测序第54-55页
        4.3.6 SHAPE化学法综合实验结果第55-56页
    4.4 本章小结第56-57页
第5章 hTER二级结构的解析第57-64页
    5.1 实验方法第57-58页
        5.1.1 原始数据的输入第57页
        5.1.2 基线调整第57-58页
        5.1.3 泳动变位第58页
        5.1.4 信号延迟校正第58页
        5.1.5 配对和整合处理第58页
    5.2 结果和讨论第58-63页
        5.2.1 ShapeFinder软件处理结果第58-59页
        5.2.2 hTER全长自由度柱形图第59-60页
        5.2.3 hTER核心结构域的分析第60-61页
        5.2.4 hTER C R4/CR5结构域的分析第61页
        5.2.5 hTER Sca RNA结构域的分析第61-63页
    5.3 本章小结第63-64页
第6章 全文总结与展望第64-66页
    6.1 总结第64-65页
    6.2 展望第65-66页
参考文献第66-70页
附录一:hTER的序列和SHAPE分析数据表第70-76页
附录二:发表文章第76-77页
致谢第77页

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